简介：

简介：ThisisthespecialissuedevotedtobioinformaticsresearchinSingapore.BioinformaticsresearchinSingaporestartedlargelyin1996whentheBioinformaticsCenter,NationalUniversityofSingapore,wasformed.Withthegovernment'seffortstoturnSingaporeintoapowerhouseofbiomedicalresearch,theGenomeInstituteofSingaporeandtheBioinformaticsInstituteofSingaporehavebeenestablishedsince2000.Recently,abioinformaticsresearchcenterwasalsoformedintheNanyangTechnologicalUniversity.Currently,therearealargenumberofbioinformaticsresearchteamsineachoftheseinstitutions.

简介：TheNetAcetmethodhasbeendevelopedtomakepredictionsofN-terminalacetylationsites,butmoreinformationofthedatasetcouldbeutilizedtoimprovetheperformanceofthemodel.Byemployinganewwaytoextractpatternsfromsequencesandusingasamplebalancingmechanism,weobtainedacorrelationcoefficientof0.85,andasensitivityof93%onanindependentmammaliandataset.Awebserverutilizingthismethodhasbeenconstructedandisavailableathttp://166.111.24.5/acetylation.html.

简介：TheCoronaviridaefamilyischaracterizedbyanucleocapsidthatiscomposedofthegenomeRNAmoleculeincombinationwiththenucleoprotein(Nprotein)withinavirion.ThemoststrikingphysiochemicalfeatureoftheNproteinofSARS-CoVisthatitisatypicalbasicproteinwithahighpredictedpIandhighhydrophilicity,whichisconsistentwithitsfunctionofbindingtotheribophosphatebackboneoftheRNAmolecule.ThepredictedhighextentofphosphorylationoftheNproteinonmultiplecandidatephosphorylationsitesdemonstratesthatitwouldberelatedtoimportantfunctions,suchasRNA-bindingandlocalizationtothenucleolusofhostcells.SubsequentstudyshowsthatthereisanSR-richregionintheNproteinandthisregionmightbeinvolvedintheprotein-proteininteraction.TheabundantantigenicsitespredictedintheNprotein,aswellasexperimentalevidencewithsynthesizedpolypeptides,indicatethattheNproteinisoneofthemajorantigensoftheSARS-CoV.Comparedwithotherviralstructuralproteins,thelowvariationrateoftheNproteinwithregardstoitssizesuggestsitsimportancetothesurvivalofthevirus.

简介：Themodulationandcontrolofgecko'sfootmovementswerestudiedelectrophysiologicallyinordertodesignthemotorcontrolsystemofagecko-mimicrobot.Inthisstudy(1)theanatomyoftheperipheralnervescontrollingthegecko'sfootmovementswasdetermined;(2)therelationshipbetweenthelimbnervesofthegeckoanditsfootmotorpatternswasstudied;(3)theafferentimpulsesofthenervesevokedbyrubbingthegecko'stoesandpalmwererecorded;(4)copyingthenaturalpatternsofmovementofthegecko'sfoot(abduction,adduction,flexion,andrevolution)anditslimbnervemodulationandcontrolmechanism,thenerveswerestimulatedundercomputercontrol,andtheresultsrecordedbyCCD.Resultssuggestthatgecko'sfootmovementscanbesuccessfullycontrolledbyartificialelectricalsignals.

简介：China'sFreeARTProgramwasinitiatedin2002asanemergencyresponsetosaveandimprovethelivesofAIDSpatientslivingmainlyinimpoverishedruralregionsofcentralChina.WithlittleexperienceinHIV/AIDStreatmentandcareandresourcelimitations,China'seffortstoprovidewidespreadaccesstofreeantiretroviraltherapyhasbeenaprocessfraughtwithdifficulty.However,theFreeARTProgramisprogressingfromanemergencyresponsetoastandardizedtreatmentandcaresystem.Thedevelopmentofnationalguidelines,trainingprograms,alaboratorysupportnetwork,anationalpatientdatabase,programsforspecialpopulationssuchaschildrenandpatientslivingwithcoinfections,andoperationalresearchhasimprovedthescopeandqualityofthefreetreatmentprogram.AsofJune30,2005,atotalof19,456patientsin28provinces,autonomousregions,andspecialmunicipalitieshadreceivedfreeART.ChallengesstemmingfromthenatureofChina'shealthsystemandpatientpopulationpersist,butwithstronggovernmentsupportandadiversesetofresources,Chinahasthecapacitytoovercomethesechallengesandtoprovidenationwideaccesstohighqualitytreatmentandcare.

简介：Thecorona-likespikesorpeplomersonthesurfaceofthevirionunderelectronicmicroscopearethemoststrikingfeaturesofcoronaviruses.TheS(spike)proteinisthelargeststructuralprotein,with1,255aminoacids,intheviralgenome.Itsstructurecanbedividedintothreeregions:alongN-terminalregionintheexte-rior,acharacteristictransmembrane(TM)region,andashortC-terminusintheinteriorofavirion.WedetectedfifteensubstitutionsofnucleotidesbycomparisonswiththeseventeenpublishedSARS-CoVgenomesequences,eight(53.3%)ofwhicharenon-synonymousmutationsleadingtoaminoacidalternationswithpredictedphysiochemicalchanges.ThepossibleantigenicdeterminantsoftheSproteinarepredicted,andtheresultisconfirmedbyELISA(enzyme-linkedimmunosorbentassay)withsynthesizedpeptides.AnotherprofoundfindingisthatthreedisulfidebondsaredefinedattheC-terminuswiththeN-terminusoftheE(envelope)pro-tein,basedonthetypicalsequenceandpositions,thusestablishingthestructuralconnectionwiththesetwoimportantstructuralproteins,ifconfirmed.Phyloge-neticanalysisrevealsseveralconservedregionsthatmightbepotentdrugtargets.

简介：预言潜水艇的能力从它的顺序的蛋白质的细胞的本地化是很重要的，它关于蛋白质的功能提供信息。我们在场一个计算工具，PredSL，它利用神经网络，Markov链，隐藏的Markov建模的侧面，和得分为潜水艇的预言的矩阵在从N终端氨基酸顺序的真核细胞的房间的蛋白质的细胞的本地化。它试图分类蛋白质进五个组：叶绿体，thylakoid，线粒体，能分泌的小径，和“其它”。当在一个五倍的交叉验证过程测试了时，PredSL分别地为植物和非植物数据集表明86.7%和87.1%全面精确性。与TargetP，迄今为止是最广泛地使用的方法，和LumenP相比，PredSL的结果在大多数情况中是可比较的。当在Saccharomycescerevisiae染色体的试验性地验证的蛋白质上测试了时，PredSL可比较地表现如果比为一样的任务的任何可得到的算法不好。而且，PredSL是为这些的预言有能力的唯一的方法代替作为通过URL:http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PredSL/的独立应用可得到的细胞的本地化。

简介：

简介：Polyamines在在植物，而是他们的准确角色调整各种各样的发展过程被含有并且他们怎么管理这些过程尚待逃犯。我们这里报导浓密的Arabidopsis和矮子异种，bud2，哪个从编码S-adenosylmethioninedecarboxylases(SAMDC)的小基因家庭的一个成员的完全的删除的结果为在polyamine简历的不可缺少的中介的形成必要合成小径。bud2植物在开花期，根，和叶柄扩大了脉管的系统，并且polyamines的改变的动态平衡。bud2和samdc1的双异种，另一个SAMDC成员的击倒的异种，是胚胎致命，证明SAMDC为植物胚胎开始是必要的。我们的结果建议polyamines为更高的植物的正常生长和发展被要求。

简介：目的探讨睾丸内注射法pEGFP-N1在精细胞的整合和在早期胚胎中表达.方法选择4头本地山羊,双侧睾丸注射不同剂量质粒DNApEGFP-N1,注射后PCR和Southern杂交检测pEGEP-N1在精子中的整合.结果pEGFP-N1整合到精子基因组中,转染效率最高发生在注射后第40天,转染阳性率最高为81%;绿色荧光蛋白在精子及其体外受精的部分胚胎中表达,胚胎阳性率最高的达66.7%.结论通过睾丸内注射pEGFP-N1能整合进入精子基因组,并能通过体外受精在山羊早期胚胎中表达;睾丸内注射法可能是一种可行、简单并利于推广的制备转基因山羊的方法.

简介：[目的]观察禽流感H5N1型病毒对沙鼠的致病性;[方法]在生物安全三级实验室,将禽流感H5N1型病毒通过滴鼻接种乙醚麻醉后沙鼠,观察14天,记录沙鼠的体温体重、临床症状、病理变化、病毒分离及抗体变化;[结果]沙鼠感染后发病主要表现在第2天至第6天,攻毒组沙鼠出现反应迟钝、皱毛、弓背、食欲下降、呼吸急促、打堆等症状,攻毒组沙鼠的体温降低和体重减轻,死亡率为44%,在第8天检出抗体,主要病理变化表现为肺出现严重淤血、水肿、出血,镜下可见肺间质充血,血管周围炎性细胞浸润,肝和胸腺淤血,肾出血,肾小管变形。

简介：土壤宏无脊椎动物在在澳大利亚的热带无树平原支撑生产和生物多样性起一个重要作用。例如，通过他们的foraging和嵌套的活动，白蚁再循环营养素和碳并且生产便于水渗入的土壤毛孔。挑战向前到份量上理解驾驶这的关系和进程。不同种类和宏无脊椎动物的功能的组在各种各样的风景过程起什么作用？是不同陆地管理的效果的，练习(例如，国内牛放牧，火)在为风景健康的这些关系，和后果上?这篇论文在北澳大利亚从研究论述初步的结果，检验在土壤宏无脊椎动物上放牧的陆地状况和国内牛的效果，并且为要用作一个工具恢复的白蚁的潜力在降级的区域玷污功能。在北澳大利亚，增加了降级似乎在差异和活动ofmacroinvertebrates与衰落被联系。白蚁看起来是最有弹性的组之一，与能够维持在降级的风景的活动的某种类。

简介：为了研究禽流感H5N1病毒在各个器官的增殖和病理变化,在生物安全实验室,我们将禽流感H5N1病毒通过尾静脉接种BALB/C小鼠。结果小鼠在不经过适应的情况下,直接感染发病,甚至死亡。在观察的7天内,感染小鼠临床症状主要表现呼吸急促,体温、体重下降。尸检表现肺出血,心外膜坏死以及肝脏的坏死。组织病理检查表现心、肝、肺等多器官的病变。肺的病变伴有纤维化的弥漫性肺泡损伤;心肌外膜大量淋巴细胞浸润、坏死;肝细胞大量坏死,淋巴细胞浸润。心、肝的坏死病变在H5N1禽流感病毒相关的研究中未见报道。经过对各个组织器官的病毒载量的检测,未发现病毒在各个病变组织中的复制。免疫组化的检测,各个组织中也未检出阳性的细胞反应。因此,我们认为H5N1禽流感病毒感染小鼠引起多个器官组织的损伤,甚至死亡,不是病毒在器官的复制,而可能是病毒感染小鼠,产生炎症细胞因子的高度表达,损伤多个器官组织所致。

简介：<正>Usingsubtractioncloning,weidentifiedthehumanN-MycDownstream-RegulatedGene-2(hNDRG2),locatedat14q11.2,asacandidatetumorsuppressorgene.Semi-quantitativeRT-PCRshowedthattheexpressionofhNDRG2in15of27(56%)humanGBMtissuesandall6humanglioblastomacelllineswassignificantlylowerthanthatinthenormalbrain.TheexpressionofhNDRG2alsowasevaluatedin60lung-carcinomapatients.17of26casesofsquamouscarcinomaand4of11casesofsmallcelllungcancerdisplayed

简介：应用DNA聚合酶链式反应(PCR)技术,对p16抑癌基因(CDKN2)进行体外定点突变,在p16cDNA中引入第48位密码子CCG(Pro)→CTG(Leu)和第74位密码子GAC(Asp)→AAC(Asn)突变,构建了p16-P48L和p16-D74N突变体。野生型和突变型p16cDNA克隆于pcDNA3构建pCMV-p16、pCMV-p16P48L和pCMV-p16D74N真核表达载体,导入纯合缺失p16基因的人肺癌细胞株H460,经RNA点杂交、RNA印迹和细胞免疫化学染色,检测到P16表达。通过比较表达野生型和突变型P16的H460细胞在~3H-TdR掺入及细胞所在周期的差异,证实P16表达抑制细胞进入S期,而P48L和D74N突变体对细胞进入S期没有什么影响,提示P48L和D74N突变导致P16蛋白功能丧失。

简介：Fische：344大鼠在国外广泛应用于肿癌研究与慢性毒性试验，八十年代中期引入我国。我们对F344／K—Smu—D大鼠的生长发育的若干生物学特性进行了检测。结果表明，该品系大鼠体型较SD大鼠与Wistar大鼠小。除睾丸，垂体、肾上腺，乳腺外的大部分器官与组织的自发性肿瘤的发生率相对较低；将F344／K—Smu—D大鼠种群与F344／DuCrj种群比较，在体重、耗食量，血液学与生化学等方面的若干特性差异较大，肿瘤发生率与死亡差别不大。

简介：目的对北京市肿瘤研究所及本实验动物学部保存的$180进行了克隆培养，根据克隆细胞的腹水生长特性，从中选出8株克隆，对不同克隆$180细胞的特性进行研究。方法免疫组化法测不同克隆细胞的蛋白质分布，流式细胞仪测定不同克隆细胞的DNA含量，扫描电镜观察克隆细胞表面结构，SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测克隆细胞的电泳图谱。结果其中3株克隆从uJ见腹水之日起，腹水即为血性；1株微显血性；4株在接种腹腔7日内腹水无血性。扫描电镜观察6株克隆细胞表面结构，各具特点，有所不同。流式细胞仪测定6株不同S180克隆细胞DNA含量，分别为8．5，9．3，7．9，8．5，8．6，8．3pg。免疫组化染色显示不同克隆与11种抗体反应有所不同，一旦与某抗体反应阳性，则阳性细胞比率均在97％以上。SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳测定克隆细胞s1H10及S2D9的电泳图谱，S1HIO克隆细胞有33条带，S2D9克隆细胞有30条带。结论8株克隆细胞各具特点。

简介：对四个单位保种的S180细胞经KM小鼠腹腔传代，体外培养加秋水仙碱，涂片、染色后，显微镜下计数染色体数目：腹水传代的S180细胞．用70％乙醇固定，流式细胞仪测DNA含量。结果如下：本学部(本部)，中国医学科学院药物所(药物所)，武汉大学保种中心(武汉大学)和北京市肿瘤所(肿瘤所)保种的S180细胞株，其染色体均数分别为628±22．8，69．1±21．2，39．9±8．26，58．7±9.75条。四单位S180细胞株染色体数做方差分析表明，除肿瘤所与本部外，其它两单位比较均有显著统计学差异(P<0．01)。直方图分析显示主流染色体范围分别为56～60，61～65，41～45，61～65条。流式细胞术DNA含量分析表明肿瘤所S180DNA含量最多，武汉大学保种的S180细胞的DNA含量最少。这些结果均证明四个单位的S180细胞株在一些方面已出现显著差异。

简介：[目的]建立禽流感H5N1病毒感染恒河猴的动物模型,探讨禽流感在哺乳类动物的发病机制。[方法]通过“环甲膜穿刺术”经气管注射鸡胚培养的禽流感H5N1病毒(AF148678;ACGoose/Guangdong/11961H5N1)感染恒河猴,观察恒河猴染毒后出现的临床体征,用显微计数法检测外周血白细胞的动态变化,用ELISA检测禽流感病毒特异性抗体变化规律,用流式细胞仪检测外周血T淋巴细胞及其亚群的动态变化。在染毒后第1天、第3天、第10天和第14天分别剖杀染毒组恒河猴1只,HE染色观察主要组织器官的病理变化,用病毒分离、免疫组化和RT-PCR三种方法分析禽流感病毒侵袭机体的特点。[结果]临床症状和体征:急性起病,表现为发热,呼吸困难,精神状态下降,活动度明显减少,食欲下降,咳嗽,紫绀等,肺部听诊双肺可闻及干、湿音。1、病理特点:以肺部损伤为主,伴多器官病变。肺部的病变主要表现为弥漫性肺泡损伤,先后经历渗出期、增生期和纤维化期;在肝脏、肾脏和中枢神经系统中也观察到变性、坏死等病理变化。2、病毒侵袭机体的特点:病毒只在呼吸系统中复制,不在呼吸道以外的组织器官中复制;肺内支气管上皮细胞、肺泡上皮细胞和肺巨噬细胞是...