简介:研制人线粒体DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)表达谱芯片,鉴定芯片的特异性和稳定性,完善芯片的制备和使用程序,优化实验参数,为线粒体功能研究提供物质基础及技术保障。以人mtDNA剑桥序列为标准,设计mtDNA编码的13种mRNA、2种rRNA和9种tRNA基因及蛋白产物定位于线粒体的核DNA(nDNA)编码的5种凋亡相关基因寡核苷酸探针。芯片点样仪点制芯片,进行荧光显示和洗脱,用其检测人宫颈癌上皮Hela细胞和人肾小管上皮Hc1细胞cDNA文库mtDNA编码基因及nDNA编码凋亡相关基因的差异表达情况。所点制的芯片扫描结果显示,样点分布均匀、清晰,规整度好,无漏点、连点。cDNA文库杂交鉴定结果显示,整张芯片荧光信号均匀一致,背景清晰,各基因重复样点杂交结果一致,各质控点能正常显示。成功制备了人mtDNA基因表达谱芯片,完善了该芯片的制备和使用程序,通过初步应用,证明所研制的人mtDNA基因表达谱芯片具有特异性高、稳定性好等优点,可用于不同组织或细胞样本cDNA文库mtDNA基因的差异表达分析。
简介:DNAcondensationisanimportantprocessinmanyfieldsincludinglifesciences,polymerphysics,andappliedtechnology.Inthenucleus,DNAiscondensedintochromosomes.Inpolymerphysics,DNAistreatedasasemi-flexiblemoleculeandapolyelectrolyte.Manyagents,includingmulti-valentcations,surfactants,andneutralpoorsolvents,cancauseDNAcondensation,alsoreferredtoascoil–globuletransition.Moreover,DNAcondensationhasbeenusedforextractionandgenedeliveryinappliedtechnology.ManyphysicaltheorieshavebeenpresentedtoelucidatethemechanismunderlyingDNAcondensation,includingthecounterioncorrelationtheory,theelectrostaticzippertheory,andthehydrationforcetheory.Recentlyseveralsingle-moleculestudieshavefocusedonDNAcondensation,sheddingnewlightonoldconcepts.Inthisdocument,themulti-fieldconceptsandtheoriesrelatedtoDNAcondensationareintroducedandclarifiedaswellastheadvancesandconsiderationsofsingle-moleculeDNAcondensationexperimentsareintroduced.
简介:Cancercellsdifferfromnormalcellsinvariousparameters,andthesedifferencesarecausedbygenomicmutationsandconsequentialalteredgeneexpression.Thegeneticandfunctionalheterogeneityoftumorcellsisamajorchallengeincancerresearch,detection,andeffectivetreatment.Assuch,theuseofdiagnosticmethodsisimportanttorevealthisheterogeneityatthesingle-celllevel.Dropletmicrofluidicdevicesareeffectivetoolsthatprovideexceptionalsensitivityforanalyzingsinglecellsandmolecules.Inthisreview,wehighlighttwonovelmethodsthatemploydropletmicrofluidicsforultrasensitivedetectionofnucleicacidsandproteinmarkersincancercells.Wealsodiscussthefuturepracticalapplicationsofthesemethods.
简介:目的:通过对线粒体DNA1555/1494突变耳聋文献病例进行分析,总结患者听力学特点,探讨影响耳聋程度的相关因素。方法以“线粒体DNA1555/1494突变”和“感音神经性聋”为主题词,检索中文CNKI、万方、维普数据库,英文PubMed数据库,进行文献回顾。对线粒体DNA1555/1494突变耳聋患者病例进行基本信息和听力学相关信息统计,按照性别、基因突变信息、是否应用氨基糖甙类抗生素、用药年龄、用药情况、发病间隔、发病年龄、单倍型、突变异质率以及耳聋程度等相关项目编辑excel表格,按需要导入SPSS19.0软件分析。结果共收集到符合要求的文献39篇,资料完整的线粒体DNAA1555G和C1494T突变携带者324例。线粒体DNAA1555G突变共285例,华裔254例,其他亚裔18例,非亚裔13例,线粒体DNAC1494T突变39例均为华裔。明确使用氨基糖甙类抗生素致聋230例,无氨基糖甙类抗生素使用发生耳聋92例。2例应用氨基糖甙类抗生素药物1年听力正常。统计分析发现用药患者的耳聋程度较未用药患者重(X2=25.414,P<0.05)。无论是否用药,发病年龄与耳聋程度有显著的负相关,而用药后发病间隔与耳聋程度无相关(R=0.054,P>0.05)。另外,线粒体DNA1555/1494突变异质率与耳聋程度显著正相关(R=0.823,P<0.05)。结论多种因素影响mtDNAA1555G/C1494T携带者的临床表现。对于线粒体DNAA1555G/C1494T相关耳聋进行早期耳聋基因诊断有重要的临床意义。对突变携带者,严禁使用氨基糖甙类抗生素。
简介:本文首次以吖啶橙为荧光探针建立了在线HPLC—DAD—MS……n-DNA—AO—FLD检测系统并应用于天然药物的活性成分研究中,该系统可以同时给出所测天然药物的指纹图谱、各色谱峰的紫外光谱、总离子流图,多级高分辨MS数据以及各化合物与DNA结合的活性图谱,能够对天然药物进行高效分离、结构鉴定和活性检测以及构效、量效关系和作用机理研究。本文采用该系统对紫草正己烷提取物进行了快速分离、结构鉴定和活性研究,证明5个萘醌类化合物具有明显的DNA结合活性;构效和量效关系研究表明,紫草萘醌化合物的母核能嵌插在DNA碱基对中,阻断DNA的复制,侧链上的羟基酰化能够促进与DNA结合,对活性有较大的影响。本文为天然药物中发现抗肿瘤药物提供了简便、快速、精密度高、稳定性好的研究方法。