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310 个结果
  • 简介:Werecentlyreportedtheuseofagene-trappingapproachtoisolatecellclonesinwhichareportergenehadintegratedintogenesmodulatedbyT-cellactivation.WehavenowtestedapanelofclonesfromthatreportandidentifiedtheonethatrespondstoavarietyofG-proteincoupledreceptors(GPCR).TheβlactamasetaggedEGR-3JurkatcellwasusedtodissectspecificGPCRsignalinginvivo.ThreeGPCRswerestudied,includingthechemokinereceptorCXCR4(Gicoupled)thatwasendogenouslyexpressed,theplateletactivationfactor(PAF)receptor(Gq-coupled),andβ2adrenergicreceptor(Gs-coupled)thatwasbothstablytransfected.Agonistsforeachreceptoractivatedtranscriptionoftheβ-lactamasetaggedEGR-3gene.InductionofEGR-3throughCXCR4wasblockedbypertussistoxinandPD58059,aspecificinhibitorofMEK(MAPK/ERKkinase).NeitheroftheseinhibitorsblockedisoproterenolorPAF-mediatedactivationofEGR-3.Conversely,β2-andPAF-mediatedEGR-3activationwasblockedbythep38,specificinhibitorSB580.Inaddition,bothβ2-andPAF-mediatedEGR-3activationcouldbesynergisticallyactivatedbyCXCR4activation.ThiscombinedresultindicatesthatEGR-3canbeactivatedthroughdistinctsignaltransductionpathwaysbydifferentGPCRsandthatsignalscanbeintegratedandamplifiedtoefficientlytunethelevelofactivation.

  • 标签: G-蛋白相连受体 信号通道 转移因子 EGR-3
  • 简介:G-proteincoupledreceptors(GPCRs)representoneofthemostimportantclassesofdrugtargetsforpharmaceuticalindustryandplayimportantrolesincellularsignaltransduction.PredictingthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsisvitalforfurtherunderstandingthemechanismofsignaltransductionandthefunctionofthereceptorswithinacell,whichcanprovidenewcluesforpharmaceuticalresearchanddevelopment.Inthisstudy,thefeaturesofaminoacidcompositionsandphysiochemicalpropertiesofthefull-lengthGPCRsequenceshavebeenanalyzedandextracted.Basedonthesefeatures,classifiershavebeendevelopedtopredictthecouplingspecificityofGPCRstoG-proteinsusingsupportvectormachines.Thetestingresultsshowthatthismethodcouldobtainbetterpredictionaccuracy.

  • 标签: G-蛋白 疾病预防 分子机制 临床表现
  • 简介:组蛋白甲基化是参予细胞的过程的一个多样的数组的重要epigenetic现象并且被发现了与癌症被联系。几的Recentidentification嘘一demethylases证明了那嘘一甲基化是一个可逆过程。通过一条候选人途径,我们化学上有简历作为H3K27demethylase识别了JMJD3。进HeLa房间的JMJD3的Transfection引起了整齐的乙醇H3K27的特定的减小,但是没在di-和单音的甲基H3K27上有效果,或嘘H3K4和H3K9上的一离氨酸methylations。Theenzymatic活动要求JmjC域和被建议了为余因子绑定重要的保存组氨酸。试管内生物化学的实验证明那JMJD3directly催化demethylation。另外,我们发现JMJD3起来在前列腺癌症,和它的表示调整了在变形前列腺癌症是更高的。因此,我们作为能够把整齐的乙醇组从移开的ademethylase识别了JMJD3嘘一H3离氨酸27并且起来在前列腺癌症调整了。

  • 标签: 组蛋白 甲基化物 前列腺癌 临床
  • 简介:目的建立具有潮霉素(hygromycin)抗性的3T3细胞系,用于转染目的基因(pTRE-Ins-human)的ES阳性细胞克隆筛选的饲养层.方法通过脂质体转染的方法,将含有潮霉素B磷酸转移酶基因的质粒pHyg导入3T3细胞中,利用潮霉素的药物选择特性,对转染细胞进行压力筛选,并对其进行PCR鉴定.结果经500μg/ml的潮霉素压力筛选后,获得了抗性细胞克隆.抗性3T3细胞的形态和生长速度与正常3T3细胞没有差异,特异性核苷酸引物检测抗性细胞基因组DNA,可以扩增出对应的核苷酸片段.结论成功地培育了潮霉素抗性的3T3细胞,为进行目的基因(pTRE-Ins-human)转染ES细胞的阳性细胞克隆筛选奠定了基础.

  • 标签: 潮霉素 抗性 细胞 饲养层 基因
  • 简介:Circulargenomes,beingthelargestproportionofsequencedgenomes,playanimportantroleingenomeanalysis.However,traditional2Dcircularmaponlyprovidesanoverviewandannotationsofgenomebutdoesnotofferfeature-basedcomparison.Forremedyingtheseshortcomings,wedeveloped3DGenomeTuner,ahybridofcircularmapandcomparativemaptools.Itscapabilityofviewingcomparisonsbetweenmultiplecircularmapsina3Dspaceoffersgreatbenefitstothestudyofcomparativegenomics.Theprogramisfreelyavailable(underanLGPLlicence)athttp://sourceforge.net/projects/dgenometuner.

  • 标签: 基因组分析 三维空间 调谐器 多循环 语境 比较基因组学
  • 简介:混合的系kinase(MLK3)3是被肿瘤坏死因素激活的激活mitogen的蛋白质kinasekinasekinase--伪(TNF-伪)并且明确地在TNF-伪刺激上激活c6月N终端kinase(JNK)。TNF-伪由激活MLK3的机制不被知道。TNF联系受体的因素(TRAF)是被招募到TNF受体的细胞质的结束并且调停的改编者分子,包括JNK的激活下游的发信号。这里,我们报导MLK3与TRAF2,TRAF5和TRAF6联系;然而,仅仅TRAF2能显著地导致MLK3的kinase活动。到TRAF领域并且为到它的C终端一半(氨基酸511-847)的MLK3的TRAF2地图的相互作用领域。与对方一起的内长的TRAF2和响应以一种时间依赖者方式的TNF-伪处理的MLK3伙伴。在MLK3和TRAF2之间的协会调停有绑在MLK3的TRAF2删除异种的MLK3激活和竞争以一种剂量依赖者方式稀释MLK3kinase活动,在TNF-伪处理上。而且MLK3的下游的目标,JNK被TNF-伪以一种TRAF2依赖的方式激活。因此,我们在TRAF2和MLK3之间的直接相互作用为TNF-伪-被要求的数据表演导致了MLK3和它的下游的目标的激活,JNK。

  • 标签: 丝裂原活化蛋白激酶 肿瘤坏死因子-α 诱导 相互作用 肿瘤坏死因子受体 时间依赖性
  • 简介:植物替代控制是利用一种或多种植物的生长优势控制入侵杂草的方法,它是控制外来杂草危害的有效途径之一;因其既可控制入侵杂草危害又能取得一定的经济效益及生态效益而被人们广泛接受。本文简要介绍了我国3种入侵杂草植物替代控制技术研究与应用现状,系统总结了植物替代控制技术阻截和修复豚草、紫茎泽兰及黄顶菊扩散危害的技术模式和效果,提出了植物替代控制技术未来研究的方向和重点。

  • 标签: 替代控制 入侵杂草 筛选评价 豚草 紫茎泽兰 黄顶菊
  • 简介:东方田鼠(Microtusfortis)分布于我国东北、西北、华中、华南17个省区,在韩国及俄罗斯也见报道.国内对该鼠的5个亚种,即指名亚种(M.f.fortis)(西北)、东北亚种(M.f.pelliecus)、辽宁亚种(M.f.dolichocephalus)、长江亚种(M.f.calamorum)和福建亚种(M.f.fujianensis)(华南),作过一般生物学描述[1],对于东方田鼠研究得较多的是长江亚种,60年代有人对该种动物的生态学特点进行了报道,近期对洞庭湖区东方田鼠的种群动态、繁殖特性、迁移行为也有系列研究[2],特别是该种动物具有对日本血吸虫天然抗感染性,引起了学术界的广泛兴趣,本研究通过对人工繁殖的东方田鼠的细胞遗传学的观察,了解该种动物的染色体数目的范围、染色体核型以及染色体G带特征.

  • 标签: 东方田鼠 系列研究 华中 抗感染 日本血吸虫 染色体核型
  • 简介:在胸腺的中央忍耐是为删除汽车的主要机制反应T房间。尽管有这,进圆周的自我反应的T淋巴细胞的逃跑揭示汽车免疫的威胁。补偿它的瑕疵,胸腺也与镇压功能生产Foxp3+CD4+CD25+规章的T房间的一个自然地发生的子集,能够控制汽车反应房间。Foxp3(叉头框P3),为房间的这个子集的系特定的标记,对他们的thymic开发和外部功能关键,并且还Foxp3驾驶的transcriptional程序直到现在大部分未定义。新兴的证据提供了卓见进它的角色:从Foxp3到的能力与象NFAT那样的另外的抄写因素合作,到目标的染色体宽的描述,基因直接由Foxp3跳了并且调整。这里,我们讨论自然地发生的规章的T房间的发现-他们的显型,发展,维护,和功能-大部分当他们被系特定的标记定义,Foxp3

  • 标签: 免疫学 T细胞 抑制作用 胸腺
  • 简介:[目的]建立具有潮霉素B(hygromycinB)抗性的3T3细胞系,用于转染目的基因(pTRE2-human-Ins)的ES阳性细胞克隆筛选的饲养层。[方法]通过脂质体转染的方法,将含有潮霉素B磷酸转移酶基因(hyg)的质粒pHyg导入NIH3T3细胞中,利用潮霉素B的药物选择特性,对转染细胞进行压力筛选,并对其进行PCR和southernblot鉴定。[结果]经300ug/ml的潮霉素B压力筛选后,获得了抗性细胞克隆。抗性NIH3T3细胞的形态和生长速度与正常NIH3T3细胞没有差异,特异性核苷酸引物检测抗性细胞基因组DNA,可以扩增出相应的核苷酸片段,Southernblot鉴定结果表明潮霉素基因片段已整合入潮霉素抗性NIH3T3细胞。[结论]本实验通过脂质体介导的方法成功地培育了潮霉素B抗性的NIH3T3细胞,为进行目的基因(pTRE2-human-Ins)转染ES细胞的阳性细胞克隆筛选打下了基础。

  • 标签: NIHNIH3T3细胞 潮霉素B磷酸转移酶基因 转染 潮霉素B抗性 ES细胞
  • 简介:大环内酯类抗生素基因工程是近年来生物工程领域研究的一个热点,利用基因工程改造大环内酯类抗生素合成基因,已经合成了100多种"非天然”的天然化合物,为筛选新抗生素开辟了新的途径.本研究以糖多孢红霉菌A226基因组DNA为模板,先用PCR扩增出红霉素合成基因eryKR6两侧片段,再用重叠PCR将其拼接成去除KR6的约3.2kbDNA片段,并克隆于pWHM3载体,构建了同源重组质粒pWHM2201.用PEG介导将pWHM2201转入糖多孢红霉菌A226原生质体.PCR鉴定和生物活性检测均显示pWHM2201已重组到红霉素合成基因位点.在无抗性R3M斜面上生长两代后,制备重组体原生质体,并涂R3M平皿.利用PCR筛选出KR6敲除的突变体糖多孢红霉菌M.

  • 标签: 酮内酯类化合物 3-去氧-3-羰基-红霉内酯B 基因工程 合成
  • 简介:Microarrayhasbecomeapopularbiotechnologyinbiologicalandmedicalresearch.However,systematicandstochasticvariabilitiesinmicroarraydataareexpectedandunavoidable,resultingintheproblemthattherawmeasurementshaveinherent"noise"withinmicroarrayexperiments.Currently,logarithmicratiosareusuallyanalyzedbyvariousclusteringmethodsdirectly,whichmayintroducebiasinterpretationinidentifyinggroupsofgenesorsamples.Inthispaper,astatisticalmethodbasedonmixedmodelapproacheswasproposedformicroarraydataclusteranalysis.TheunderlyingrationaleofthismethodistopartitiontheobservedtotalgeneexpressionlevelintovariousvariationscausedbydifferentfactorsusinganANOVAmodel,andtopredictthedifferentialeffectsofGV(genebyvariety)interactionusingtheadjustedunbiasedprediction(AUP)method.ThepredictedGVinteractioneffectscanthenbeusedastheinputsofclusteranalysis.Weillustratedtheapplicationofourmethodwithageneexpressiondatasetandelucidatedtheutilityofourapproachusinganexternalvalidation.

  • 标签: 聚类基因 基因表达 微分结构 互感作用 基因多样性
  • 简介:Annotationsofcompletegenomesequencessubmitteddirectlyfromsequencingprojectsarediverseintermsofannotationstrategiesandupdatefrequencies.Theseinconsistenciesmakecomparativestudiesdifficult.Toallowrapiddataprepara-tionofalargenumberofcompletegenomes,automationandspeedareimpor-tantforgenomere-annotation.Hereweintroduceanopen-sourcerapidgenomere-annotationsoftwaresystem,Restauro-G,specializedforbacterialgenomes.Restauro-Gre-annotatesagenomebysimilaritysearchesutilizingtheBLAST-LikeAlignmentTool,referringtoproteindatabasessuchasUniProtKB,NCBInr,NCBICOGs,Pfam,andPSORTb.Re-annotationbyRestauro-Gachievedover98%accuracyformostbacterialchromosomesincomparisonwiththeoriginalmanuallycuratedannotationofEMBLreleases.Restauro-GwasdevelopedinthegenericbioinformaticsworkbenchG-languageGenomeAnalysisEnvironmentandisdistributedathttp://restauro-g.iab.keio.ac.jp/undertheGNUGeneralPublicLicense.

  • 标签: 生物信息学 基因组学 基因分析 基因解释系统
  • 简介:<正>Asoneofthemostcharacterizedcytokines,interleukin3(IL-3)iswellknownforitssurvivaleffectonbothprogenitorsandmaturebloodcells.Althoughwiththeextensivestudies,thesignalingpathwaysandunderlyingmechanismleadingtosurvivalresponsesofIL-3stillarenotcompletelyunderstood.Recently,anapoptoticgeneticpathwayofC.eleganswassuggestedtobeevolutionallyconservedinthatcontrolsthecytokine-dependentanti-apoptoticresponsesinmammalianhematopoieticcelllineages.Amongthispathway,Ces-2isknowntobethefirstdeathspecificationgeneintheC.eleganspathwayandencodesabZIPfamilytranscriptionalfactorthatsharesthesameDNArecognitionsequencewithanoncoprotein,

  • 标签: 血细胞 祖细胞 IL-3 细胞存活效应 转录调节
  • 简介:hPFTAIRE1(PFTK1),Cdc2相关的蛋白质kinase,高度在人的大脑被表示。它在Hela房间展出细胞质的分发,尽管它在它的N终点包含二个原子本地化信号(NLS)。到为它的底层和规章的部件的搜索,我们由把全身的hPFTAIRE1用作一个诱饵屏蔽了一个二混血儿的图书馆。四14-3-3isoforms(贝它,epsilon,希腊语字母的第七字,字形物)被识别与hPFTAIRE1交往。我们在hPFTAIRE1发现了一个通常认为的14-3-3绑定一致主题(RHSSPSS),它与它的第二NLS重叠了。RHSSPSS主题的删除或有在保存有约束力的主题的翼的Ser119的替换废除了在hPFTAIRE1和14-3-3蛋白质之间的特定的相互作用。变异的S120AhPFTAIRE1也显示出一个弱相互作用到14-3-3蛋白质。结果建议Ser119为在hPFTAIRE1和14-3-3蛋白质之间的相互作用是关键的。当熔化了到绿荧光灯的蛋白质(GFP)的C终点时,所有hPFTAIRE1异种在Hela房间和人的neuroblastoma房间(SH-SY5Y)的细胞质散布了,显示有14-3-3蛋白质的那绑定不贡献潜水艇hPFTAIRE1的细胞的本地化,尽管绑定可以涉及它的发信号的规定。

  • 标签: 蛋白激酶 大脑 相互作用 蛋白质
  • 简介:Glucosetransporter4(GLUT4)isresponsibleforinsulin-stimulatedglucosetransportingintotheinsulin-sensitivefatandmusclecells.ThedynamicsofGLUT4storagevesicles(GSVs)remainstobeexploredanditisunclearhowGSVsarearrangedbasedontheirmobility.Weexaminedthisissuein3T3-L1cellsviainvestigatingthethree-dimensionalmobilityofsingleGSVlabeledwithEGFP-fusedGLUT4.Athinlayerofcytosolrightadjacenttotheplasmamembranewasilluminatedandsuccessivelyimagedat5Hzunderatotalinternalreflectionfluorescencemicroscopewithapenetrationdepthof136nm.Employingsingleparticletracking,thethree-dimensionalsubpixeldisplacementofsingleGSVwastrackedataspatialprecisionof22nm.Boththemeansquaredisplacementandthediffusioncoefficientwerecalculatedforeachvesicle.Trackingresultsrevealedthatvesiclesmovedasifrestrictedwithinacagethathasameanradiusof160nm,suggestingthepresenceofsomeintracellulartetheringmatrix.ByconstructingthehistogramofthediffusioncoefficientsofGSVs,weobservedasmoothdistributioninsteadoftheexistenceofdistinctgroups.TheresultindicatesthatGSVsaredynamicallyretainedinacontinuousandwiderangeofmobilityratherthanintoseparateclasses.

  • 标签: 胰岛素 葡萄糖载体4 葡萄糖载体4贮藏囊泡 3T3-L1细胞 全内反射 荧光显微法
  • 简介:CT120,anovelmembrane-associatedgeneimplicatedinlungcarcinogenesis,waspreviouslyidentifiedfromchromosome17pl3.3locus,ahotmutationspotinvolvedinhumanmalignancies.Inthepresentstudy,wefurtherdeterminedthatCT120ectopicexpressioncouldpromotecellproliferationactivityofNIH3T3cellsusingMTSassay,andmonitoredthedownstreameffectsofCT120inNIH3T3cellswithAtlasmousecDNAexpressionarrays.Among588knowngenes,133geneswerefoundtobeupregulatedordownregulatedbyCT120.Twomajorsignalingpathwaysinvolvedincellproliferation,cellsurvivalandanti-apoptosiswereoverexpressedandactivatedinresponsetoCT120:OneistheRaf/MEK/ErksignalcascadesandtheotheristhePI3K/Aktsignalcascades,suggestingthatCT120mightcontribute,atleastinpart,totheconstitutivelyactivationofErkandAktinhumanlungcanercells.Inaddition,sometumormetastasisassociatedgenescathepsinB,cathepsinD,cathepsinL,MMP-2/TIMP-2werealsoupregulatedbyCT120,uponwhichCT120mightbeinvolvedintumorinvasivenessandmetastasis.Inaddition,CT120mightplayanimportantroleintumorprogressionthroughmodulatingtheexpressionofsomecandidate“LungTumorProgression”genesincludingB-Raf,Rab-2,BAX,BAG-1,YB-1,andCdc42.

  • 标签: 肺癌 CT120基因 基因表达 细胞增殖 NIH3T3细胞 过表达
  • 简介:比较HitrapG蛋白Sepharose亲和色谱系统对不同动物血清或腹水的纯化效果,为抗体纯化提供依据。结果显示,G蛋白对不同动物血清IgG吸附能力不同,体现在单位体积抗体回收量明显不同,这一特点与A蛋白亲和色谱系统相似。该方法简便快速,纯化抗体纯度高,免疫活性好,色谱柱可反复使用多次

  • 标签: G蛋白 A蛋白 亲和色谱法 抗体