简介：摘要目的评估新型冠状病毒Omicron变异株在北京市现有防控措施下的传播力，为做好疫情防控工作提供参考依据。方法收集北京市2022年3月7-25日报告的78例具有明确传播链的Omicron变异株感染者信息，分别采用Gamma和Weibull分布拟合潜伏期和序列间隔时间，使用马尔科夫链蒙特卡罗算法估计实时再生数（Rt）。结果Omicron变异株感染者潜伏期M（Q1，Q3）为4.0（3.0，6.0）d，序列间隔时间3.0（2.0，5.0）d，序列间隔时间在未完成和已完成全程疫苗接种感染者中M（Q1，Q3）分别为2.0（1.0，4.0）d和4.0（2.0，6.0）d（Z=-2.12，P=0.034），儿童和成年人感染者分别为2.0（1.5，3.0）d和4.0（2.0，6.0）d（Z=-2.02，P=0.044），差异均有统计学意义。本轮疫情Rt初始值为4.98（95%CI：2.22~9.04）。结论与既往Delta变异株相比，北京市Omicron变异株的传播力较强，应持续做好常态化疫情防控和新型冠状病毒疫苗接种工作，关注儿童易感人群。

简介：摘要目的分析2018—2019年北京市朝阳区腮腺炎病毒（mumps virus，MuV）小疏水蛋白（small hydrophobic，SH）编码基因序列变异特点，掌握朝阳区MuV型别构成及其变化规律，为朝阳区流行性腮腺炎（简称流腮）防控提供基础资料。方法对2018—2019年朝阳区临床诊断为流腮患者的腮腺管口拭子样本进行MuV核酸检测及病毒分离培养，并对MuV进行SH段基因扩增、序列分析和基因分型。结果362份流腮患者的腮腺管口拭子样本中检出30份MuV核酸阳性标本，并从中分离出16株MuV毒株，将其SH基因序列与各基因型参考株和疫苗株序列进行比对，其中15株MuV毒株为F基因型，其核苷酸一致性为95.98%~100.00%，氨基酸同源性为91.23%~100.00%，F基因型MuV毒株（19009株）的第28~30位置上的氨基酸三联体为IIL；1株MuV毒株为G基因型，其与辽宁流行的G基因型毒株核苷酸一致性为98.85%，氨基酸同源性为98.25%。本研究中F基因型与G基因型MuV毒株的核苷酸差异为12.07%。16株MuV北京分离株与Jeryl-Lynn疫苗株的核苷酸差异为13.22%~18.39%。结论2018—2019年北京市朝阳区流腮病例中检出的MuV存在F和G两种基因型，并以F基因型流行为主，建议进一步加强对流腮的病原学监控。

简介：摘要目的分析四川南充和新疆和田甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)分离株全基因组序列特征。方法收集2006年四川南充同1起暴发的3份和2016年新疆和田6份急性期甲肝患者血清标本，通过核酸提取、逆转录、分段巢式PCR、测序和序列拼接获得9条HAV全基因组序列。利用生物信息学软件进行系统进化、抗原中和位点、重组和选择压力分析。结果VP1-2A连接区基因分型表明9条HAV序列都属于IA亚型，分为4个不同的分支，其中3条南充序列和3条和田序列属于同一分支；全基因组序列表明，3条南充序列核苷酸和氨基酸同源性分别为99.99%～100%和100%，与3条和田序列全基因组核苷酸和氨基酸差异分别为0.50%～0.57%和0.08%～0.17%。9条HAV全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为98.29%～100%和99.62%～100%，与我国hd9和蒙古MNA12-001关系最近(核苷酸和氨基酸同源性分别为：与hd9 98.60%～99.50%和99.75%～99.92%；与MNA12-001 98.45%～99.32%和99.71%～99.87%)。9条HAV序列在已发表的抗原中和位点处未发生改变，未发现重组，选择压力分析表明处于负向选择。结论我国存在多株HAV流行株；9条HAV氨基酸序列在主要抗原中和位点处很保守。

简介：

简介：目的研究2株产气肠杆菌临床株Ea293和Ea2880对厄他培南耐药的机制。方法采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度（MIC），应用K—B法检测菌株对美罗培南、亚胺培南及厄他培南的耐药性，改良Hodge试验检测碳青霉烯酶；聚合酶链反应（PCR）扩增碳青霉烯酶基因（KPC，IMP-1、2组，VIM）和广谱及超广谱p内酰胺酶基因（TEM，SHV，CTX-M-1、2、9组ESBLs），并进行序列分析；十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）进行细菌外膜蛋白分析，并对外膜蛋白基因OmpE36进行PCR扩增及序列分析。结果药物敏感试验显示，产气肠杆菌Ea293和Ea2880均对厄他培南耐药。PCR扩增4种碳青霉烯酶基因和5种广谱及超广谱β-内酰胺酶基因，仅Ea2880的SHV和CTX-M9组ESBLs基因阳性，SHV基因的PCR产物测序为SHV-11型广谱酶。细菌外膜蛋白SDS-PAGE结果显示，与碳青霉烯类抗生素敏感的产气肠仟菌Ea1885相比，Ea293和Ea2880均缺失42kD左右的条带，即OmpE36。PCR扩增外膜蛋白基因OmpE36，Ea2880可见预期片段，DNA序列分析显示其与GenBank公布的产气肠杆菌标准株ATCC13048的相似性为87％，氨基酸序列的相似性亦为87％；而Ea293未扩增出预期片段。结论产气肠杆菌临床株Ea293与Ea2880对厄他培南耐药的主要原因可能是外膜蛋白基因OmpE36缺失，同时Ea2880可能还有CTX-M-9组ESBLs参与。

简介：摘要目的对北京市一起冷链相关新型冠状病毒（新冠病毒）Delta变异株聚集性疫情进行溯源调查，分析其感染来源和传播链。方法应用流行病学调查方法核查病例的活动轨迹，对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样核酸检测，对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果2022年1月18日至2月6日，共报告112例新冠病毒感染者，除1例待查外，其余111例存在明确的流行病学关联。感染来源为进口冷冻货品外包装，2021年1月进口冷冻货品捕捞后储存于东南亚地区某国冷库，2021年6月包装后发送到我国北京市A区A冷库存储，随后分批次于2022年1月起在B区B冷库贴标销售，首发病例在搬运阳性冷冻货品期间发生感染，继而造成共同工作、就餐和居住在B冷库及其毗邻的C冷库和D餐厅（两库一店）所在区域的人员感染，涉及77例两库一店直接相关病例。在两库一店区域外还造成16个传播支链，涉及35例病例。结论本起疫情提示进口冷链货品外包装污染输入疫情的风险，应继续加强冷链行业管理。

简介：“喂,护士,帮我一下”。刚走出办公室,我即被这一熟悉而带喘息的声音叫住了。顺着声音传来的方向一看,原来是二十八床病人站在楼梯口之间,正扶着栏杆,大口地喘着气。唉,准又是下楼去转悠,老毛病又犯了,爬不上楼梯了。我急走下去,搀着他的手,关心又似责备地说:“大爷,医生不是叫你多休息吗?你怎么老住外跑。”他只是笑,没有回答,却问起我

简介：目的：对本院150株大肠埃希菌临床分离株的分布及耐药性进行分析，指导临床合理使用抗生素。方法：按卫生部《临床检验操作规程》进行菌株分离，采用德灵公司Microscan常规革兰氏阴性复合板进行菌株鉴定及药敏试验，对近2年来我院大肠埃希菌的耐药性进行回顾调查分析。结果：临床标本中共分离得到大肠埃希菌150株，其中痰标本的检出率最高占54．5%，科室分布ICU最高占20．0％，其中：氨苄西林／舒巴坦钠、氨苄西林、头孢唑啉、哌拉西林、复方新诺明耐药率〉80％，亚胺培南为1．5％，耐药率最低。

简介：目的了解结核分枝杆菌临床分离株相关基因型的分布情况，并分析北京家族菌株与耐药的相关性。方法收集浙江省结核分枝杆菌临床分离株，常规罗氏培养基培养，应用Spoligotyping进行基因分型研究，聚类分析采用BioNumerics软件，统计学分析采用卡方检验。结果70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株可分为2个基因群，即北京家族（Beijingfamily）和非北京家族（Non-Beijingfamily），分别占70％（49／70）和30％（21／70），18种基因型，其中12株为独特类型，剩余58株分为6簇。北京家族菌株中，89．8％（44／49）为典型北京家族（typicalBeijingfamily），非北京家族菌株表现为高度的基因多态性，可分为13个基因型，9株为独特的基因型。北京家族菌株中表现为全敏感者71．4％（35／49），表现为耐药者为28．6％（14／49）；而非北京家族菌株中表现为全敏感者为66．7％，表现为耐药者为33．3％，经卡方检验，两者问的差异无统计学意义（X^2=0．158，P〉0．05）。结论北京家族菌株为浙江的流行优势菌株。北京基因犁与耐药无明显相关性。

简介：本文对安徽省426名健康人群血清检测结果分析表明：风疹HI抗体平均阳性率为59.15%；育龄期妇女易感率为10.77%。对361名健康人群BRDⅡ株风疹减毒活疫苗免疫应答研究结果分析表明：各年龄组对风疹疫苗均有较好的免疫应答反应；免前阳性人群接种风疹疫苗仍可获得良好的免疫应答反应，显示我国选育的BRDⅡ株风疹减毒活疫苗具有良好的免疫原性。推荐我省风疹免疫策略：1）在全省建立风疹的监测；将风疹疫苗的接种纳入EPI管理规程。2）实行1岁儿童完成初种及对婚前育龄期妇女给予一针风疹疫苗的接种的方案。3）在条件许可的情况下，对全省农村地区14岁以下的儿童进行一针普种。

简介：摘要从657例泻便标本分离出弧菌属细菌73株，分离率为11.1％，以致伤弧菌(24株32.8%)、副溶血弧菌(19株26%)和河弧菌(9株9.6%)为主。0-1群霍乱弧菌9株(5.5%)经血清学鉴定均为小川型，患者呈散在发病。

简介：上海市徐汇区疾病预防控制中心在2004年11月10日检出1株痢疾志贺菌Ⅶ型,该菌株在本市未见报道,现就检测过程和结果作一报道.

简介：目的了解儿童金黄色葡萄球菌（金葡菌）分离株耐药情况,为临床治疗用药提供依据。方法采用微生物检验报告系统统计分析金葡菌分离株中耐甲氧西林金葡菌（MRSA）比率,并分析MRSA和甲氧西林敏感金葡菌（MSSA）对主要抗菌药物的耐药性差异。结果共分离到647株金葡菌,其中MRSA194株,占29.98%。MRSA和MSSA对万古霉素、替加环素、替考拉宁、利奈唑胺、奎奴普丁-达福普汀和呋喃妥因均100%敏感,对甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑、阿米卡星、青霉素的耐药率差异无统计学意义;MRSA对大多β内酰胺类药物及其含酶抑制剂、红霉素、四环素、利福平、庆大霉素、环丙沙星和左氧氟沙星的耐药率较MSSA高,差异有统计学意义。结论金葡菌儿童临床感染形势严峻,MRSA和MSSA对多种抗菌药物耐药率差异明显,儿童金葡菌相关性感染可根据病情及参考药敏结果选用敏感的抗菌药物治疗。

简介：摘要目的从福建省2016年输入性黄热病病例标本中分离黄热病毒(YFV)并分析其生物学特征。方法将16份黄热病毒核酸阳性血清、尿液、唾液样品分别接种C6/36细胞，YFV实时荧光RT-PCR法鉴定检测培养物中特异性病毒核酸，通过高通量测序获得病毒全基因序列并绘制系统进化树。结果从1例患者发病后3天的血清样品分离到一株病毒，通过YFV实时荧光RT-PCR鉴定为YFV病毒；BLAST分析显示该毒株全基因序列与2016年我国首例输入性黄热病病例中分离得到的毒株CNYF01R/2016(KX268355)序列完全一致；系统进化树显示该毒株与1971年安哥拉流行株Angola71分属同一进化树分支，与疫苗株17D vaccine strain(X03700)存在明显的差异，表明本研究分离到的YFV毒株是属于安哥拉型YFV野毒株。结论福建省成功从2016年输入性黄热病病例样品分离到一株安哥拉型YFV毒株。

简介：目的了解中国大陆地区新生隐球菌环境株的分布情况，及其表型和基因型特征。方法采用CACA培养基培养1372份来自中国大部分地区私人和公共养鸽场所的鸽粪标本，分离出新生隐球菌，并对其表型和基因型特征进行分析。结果共分离出80株新生隐球菌，分离阳性率约为5．5％，所有菌株37℃生长良好，有完整荚膜，尿素酶试验阳性。ITS序列分析证实分离出的新生隐球菌均属于血清型A。M13-PCR显示，其基因型为我国及东南亚地区特征性的VNIC型，显示了与临床株的高度一致性。结论中国大陆地区的新生隐球菌临床株与环境株显示了高度的同源性，提示对于易感人群，阻断与相应环境的接触可有效预防新生隐球菌的感染。

简介：目的了解我院泌尿生殖道感染患者解脲支原体（Uu）和人型支原体（Mh）的感染情况及对9种抗生素的耐药性,为临床治疗支原体感染用药提供参考依据,有效控制支原体感染.方法采用上海奥普生物药业有限公司生产的支原体培养、鉴定药敏一体化的试剂盒进行支原体培养及药敏试验.结果从3130例患者标本中分离出支原体1450株,男性患者支原体阳性166例（11.45％）,女性患者支原体阳性1284例（88.55％）;其中单纯解脲支原体（Uu）感染1061例（73.17％）;单纯人型支原体（Mh）感染353例（24.34％）;Uu/Mh混合感染36例（2.49％）.药敏试验结果显示支原体对多西环素最为敏感.结论支原体对多种抗生素耐药,治疗支原体引起的泌尿系统感染,应以多西环素、交沙霉素、米诺环素作为首选药物.

简介：目的：分析引起医院内感染的细菌种类、致病菌科室分布及抗生素使用情况，为临床合理使用抗菌药物提供理论依据。方法：对2008年12月-2009年12月住院患者中临床标本分离培养的严格符合设计条件的200株细菌的患者情况进行调查，对患者的基础病史、感染细菌种类、感染危险因素、抗生素使用情况及细菌耐药性等进行分析。结果：①200株病原菌分离株中普外科27％、ICU15％，比例最高；②病原菌中革兰阴性杆菌占76．5％，其中大肠埃希菌29．5％、铜绿假单胞菌10．5％、肺炎克雷伯菌10．0％和鲍曼不动杆菌9．5％最为常见，而在革兰阳性球菌中，金黄色葡萄球菌多见12．O％；③手术及其他侵入性操作、住院时间长短、年龄因素等都对医院内感染有着重要的影响；④肠杆菌科细菌对碳青酶烯类抗生素较敏感，而革兰阳性球菌对糖肽类和唑烷酮类抗生素较敏感；⑤细菌鉴定及药敏结果对临床使用抗生素有较好的指导作用。结论：医院要进一步加强医院内感染细菌的监测，加强医护人员的无菌操作观念和培训以减少医院感染的发生概率。同时，临床需合理使用抗生素，以延缓菌株的变异以及耐药菌株的增加。

简介：为比较斑点热黑龙江立克次体054株与从病人血液分离的H-5株，采用微量免疫荧光方法和聚合酶链反应／限制性片段长度多态性分析技术。结果表明，二者间的血清反应模式一致，表明有相同的抗原结构。同时，用立克次体190kD抗原基因设计的一对引物扩增两株立克次体DNA后，用PstⅠ消化经PAGE，其电泳图谱的酶切带的数量和迁移完全一致，说明基因组相同。结论：从抗原性和基因型两方面证实斑点热054株与H-5株二者一致。

简介：摘要目的对延庆区新冠肺炎聚集性疫情进行流行病学调查和基因测序，分析病例的感染来源、传播链条、防控措施，为新冠疫情防控提供参考。方法对病例开展流行病学调查，应用大数据技术对病例的活动轨迹进行核查，对风险点位进行调查管控，判定和管理密切接触者，并对人员和环境开展核酸检测，对溯源重点人群采集血清标本进行抗体检测，对报告的病例进行全基因组测序、比对，分析感染来源和传播链。结果2022年7月4日至7月10日，延庆区聚集性疫情共涉及16例新冠病毒确诊病例（普通型1例、轻型15例），其中延庆区8例，顺义区5例，通州区、昌平区、丰台区各1例，毒株分型均为新冠病毒Omicron亚型变异毒株BA.5，潜伏期中位数为3 d。指示病例为1例从美国入境人员，6月15日至6月30日在上海隔离点隔离，7月1日隔离期满后返京，7月4日诊断为确诊病例，在工作单位传播给同工作、同餐人员引起的聚集性疫情。结论OmicronBA.5亚分支正成为全球主要流行毒株，要加强入境人员管理，做好口岸城市疫情防控工作。加强疫苗接种、核酸检测等常态化防控措施落实，早期发现疫情后，采取科学精准的防控措施。

简介：摘要目的比较百日咳鲍特菌耐药株与敏感株的基因型别，分析百日咳菌株耐药性演变与分子型别特征的关联性。方法于2016—2018年在监测医院和社区采集<1岁临床疑似百日咳患儿的鼻咽拭子，采用E-test法检测分离的百日咳鲍特菌对红霉素的耐药性，扩增23S rRNA基因并测序检测其2047位点耐药突变；采用多位点抗原序列分型(MAST)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对菌株进行分型。结果600份鼻咽拭子标本共分离到34株百日咳鲍特菌，其中28株对红霉素耐药，6株敏感。所有红霉素耐药株均检测到23S rRNA基因A2047G位点突变，细菌基因型均为prn1/ptxP1/ptxA1/fim3-1/fim2-1，且MLVA型别识别为MT195、MT55和MT104。6株敏感株均未检测到A2047G位点突变，细菌基因型为prn9(或prn2)/ptxP3/ptxA1/fim3-1/fim2-1，且MLVA型别全部为MT27型。结论百日咳鲍特菌红霉素耐药株与敏感株的分子分型特征不同，红霉素耐药性的获得可能伴随特定分子型别的变化。