摘要目的分析2018—2019年北京市朝阳区腮腺炎病毒（mumps virus，MuV）小疏水蛋白（small hydrophobic，SH）编码基因序列变异特点，掌握朝阳区MuV型别构成及其变化规律，为朝阳区流行性腮腺炎（简称流腮）防控提供基础资料。方法对2018—2019年朝阳区临床诊断为流腮患者的腮腺管口拭子样本进行MuV核酸检测及病毒分离培养，并对MuV进行SH段基因扩增、序列分析和基因分型。结果362份流腮患者的腮腺管口拭子样本中检出30份MuV核酸阳性标本，并从中分离出16株MuV毒株，将其SH基因序列与各基因型参考株和疫苗株序列进行比对，其中15株MuV毒株为F基因型，其核苷酸一致性为95.98%~100.00%，氨基酸同源性为91.23%~100.00%，F基因型MuV毒株（19009株）的第28~30位置上的氨基酸三联体为IIL；1株MuV毒株为G基因型，其与辽宁流行的G基因型毒株核苷酸一致性为98.85%，氨基酸同源性为98.25%。本研究中F基因型与G基因型MuV毒株的核苷酸差异为12.07%。16株MuV北京分离株与Jeryl-Lynn疫苗株的核苷酸差异为13.22%~18.39%。结论2018—2019年北京市朝阳区流腮病例中检出的MuV存在F和G两种基因型，并以F基因型流行为主，建议进一步加强对流腮的病原学监控。
