Comparative Analysis of Transcription Start Sites Using Mutual Information

(整期优先)网络出版时间:2006-03-13
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抄写开始地点(TSS)区域与另外的倡导者元素相比显示出更大的可变性。我们被感兴趣由把信息内容用作一项措施寻找它的可变性。我们在这研究注意可变性在与15nt的块相比包围TSS区域的5核苷酸(nt)的块是重要的。这建议可以被包含的实际区域在在尺寸的5-10nt的范围。为Escherichia关口i,我们注意从dinucleotide替换矩阵的信息内容清楚地显示出更好的辨别,建议一些关联的存在。然而,为人,这效果是少得多,并且为老鼠,它实际上是不在的。我们能断定存在短期在TSS区域以内的关联是种类依赖者并且不是通用的。我们进一步观察到在除了TSS的mitochondrial控制元素有另外的可变区域。有效比较能仅仅在块上被做,这也被注意,当单个核苷酸比较不给我们任何可检测的信号时。