Characterization of Binding Sites of Eukaryotic Transcription Factors

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摘要 探索真核细胞的抄写因素(TF)的性质有约束力的地点并且决定他们怎么不同于包围DNA序列,我们检验了与DNA有约束力的地点联系的四个特征:G+C内容,模式复杂性,palindromic结构,和Markov定序订。我们规章的主题的分析从TRANSFAC数据库获得了,用酵母内部是的遗传因子的序列背景,表明这四个特征在主题序列显示出可变丰富。例如,主题序列比是背景序列是更可能的有palindromic结构。另外,这些特征对规章的主题紧局部性,显示他们自己是主题序列的一个性质并且没被一般倡导者分享规章的主题在住的“环境”。由根据他们绑在的TF班毁坏主题序列,更特定的协会被识别。最后,当其它例如复杂性丰富,越过检验的种类是通用的时,我们发现一些关联例如G+C内容丰富,是种类特定的。这里提供的定量分析应该增加我们protein-DNA相互作用的理解并且也帮助通过生物信息学便于规章的主题的发现。
机构地区 不详
出版日期 2006年02月12日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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