学科分类
/ 1
4 个结果
  • 简介:Althoughtheproteinsequence-structuregapcontinuestoenlargeduetothedevelopmentofhigh-throughputsequencingtools,theproteinstructureuniversetendstobecompletewithoutproteinswithnovelstructuralfoldsdepositedintheproteindatabank(PDB)recently.Inthiswork,weidentifyaproteinstructuraldictionary(Frag-K)composedofasetofbackbonefragmentsrangingfrom4to20residuesasthestructural"keywords"thatcaneffectivelydistinguishbetweenmajorproteinfolds.Wefirstlyapplyrandomizedspectralclusteringandrandomforestalgorithmstoconstructrepresentativeandsensitiveproteinfragmentlibrariesfromalargescaleofhigh-quality,non-homologousproteinstructuresavailableinPDB.Weanalyzetheimpactsofclusteringcut-offsontheperformanceofthefragmenthbraries.Then,theFrag-KfragmentsareemployedasstructuralfeaturestoclassifyproteinstructuresinmajorproteinfoldsdefinedbySCOP(StructuralClassificationofProteins).OurresultsshowthatastructuraldictionarywithN4004-to20-residueFrag-KfragmentsiscapableofclassifyingmajorSCOPfoldswithhighaccuracy.

  • 标签: PROTEIN FRAGMENT FOLD recognition PROTEIN structure
  • 简介:Multicastcapability,includingmulticastaddressandmulticastroutingmechanisms,atthenetworklayerisnecessaryinordertoreducethebandwidthrequirementsofmultiparty,multicastapplications.Basedonhierarchicalautonomousstructureinaccordancewiththeself-organizationtopologiesofInternet,thepaperputsforwardamulticastaddressmanagementschemethatisshowntoberobustandscalable.Connectioncontrolhierarchy(CCH)basedonmaster/slaverelationshipandasimpleefficientbuildingalgorithmofmulti-pointconnectionisalsobuilt.Thepaperalsodescribesthenormaloperationsofmulticastaddressmanagementandmulti-pointconnectioncontroller.Throughsimulationexperiment,HAMCMandDDMofMulticastAddressAllocationarecompared.HAMintegratesthemeritsofCMandDDM,whichisefficientasawhole,robustandscalable.CCHraisestheefficiencyofconnectioncontrol,andishighlyrobust,flexibleandscalable.

  • 标签: 通信 分级独立结构 连接控制
  • 简介:Coalitional技巧比赛(CSG)是在每个代理人有被要求完成许多任务的一套技巧的不明确的环境的合作的一个简单模型,每项任务要求一套技巧被完成,但是每技巧是很难的被确定并且能仅仅是表示的品质上。因此远,包围CSG的许多计算问题被学习了。就我们的知识而言,作为CSG的一个中央问题,然而,联盟结构产生问题(CSGP)是极其挑战性的并且很好没被解决。到这个目的,二个不同计算智力算法此处被评估:二进制粒子群优化(BPSO)和二进制微分进化(BDE)。特别地,我们与二维的二进制代码编码开发二个随机的搜索算法并且相应为单个修理启发式。在那以后,我们讨论一些基本性质求婚启发式。最后,我们为在CSG解决CSGP把改进BPSO和BDE与最先进的算法作比较。试验性的结果证明我们的算法能与存在途径在最佳的答案附近发现一样,但是花极其短的时间,特别在大问题尺寸下面。

  • 标签: 联盟结构 智能算法 计算问题 游戏 二进制编码 随机搜索算法
  • 简介:这份报纸建议在命名实体之间的语义关系察觉和分类(RDC)的一个树核方法。它在RDC的以前的树核方法解决二个批评问题。首先,一个新树内核被介绍更好由与上下文易感知并且子树的近似匹配启用标准卷绕旋转树内核在一棵分析树上捕获固有的结构的信息。第二,充实的分析树结构被建议很好导出必要结构的信息,例如,合适的潜伏的注解,从一棵分析树。ACERDC语料库上的评估证明新树核和充实的分析树结构显著地作出贡献到RDC和我们大部分超过最先进的树核方法。

  • 标签: 结构解析 语义关系 分类树 内核 检测 结构信息