简介：为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94的杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合的6个农艺性状的杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状的贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行cDNA-SRAP差异表达分析,并对差异表达片段进行克隆测序分析。结果表明：超高亲优势表现为株高〉叶数〉叶厚〉叶长〉叶宽〉叶面积;中亲优势表现为株高〉叶数〉叶面积〉叶长〉叶宽〉叶厚。叶面积和叶长、叶宽,叶长与叶宽呈极显著相关。主成分分析将6个农艺性状简化为3个主成分,即叶产量因子、长势因子、叶数因子,提供的信息占全部信息量的95.99%。6对SRAP引物在Florda301×GDH94及其亲本中共扩增出66条带,其中差异条带32条,占48.48%;差异表达类型分为UNF1、ABF1、UNP1、UNP2、DMP、DMP2六种,分别占：19.20%、8.04%、4.60%、5.75%、2.30%、6.90%。从杂种特异表达片段中分离的两条片段分别与GDP-甘露糖4,6-脱水酶和蔗糖6-果糖基转移酶同源。本研究结果为烟草农艺性状杂种优势研究提供基础理论参考。

简介：利用SRAP标记,对来源不同的56份有棱丝瓜和8份无棱丝瓜种质的亲缘关系进行了分析。从144对SRAP引物中筛选出60对多态性强、重复性好的SRAP引物。共扩增得到1433条谱带,其中多态性谱带1280条,平均每对引物扩增得到21.33条多态性谱带,多态性位点百分率为88.74%。将丝瓜种质利用UPMGA方法进行聚类分析,结果表明,64份丝瓜种质的遗传相似系数为0.17～0.98。在遗传相似系数0.17处,供试种质被分为2大类群,第一大类群为普通丝瓜,第二大类群为有棱丝瓜,在第二大类群中又被分为以长绿型丝瓜为主和短果型丝瓜2亚群。丝瓜类群的划分与形态学性状比较一致,即首先与棱沟的有无密切相关,其次与瓜条的长短、颜色有较高的相关性。

简介：以石斛为研究材料,探索SRAP-PCR反应体系,对主要影响因子模板DNA、dNTP、Buffer、引物以及TaqDNA聚合酶进行单因素不同梯度试验,最终建立一套适用于石斛属植物的稳定性强、带型清晰的SRAP最佳反应体系结果如下：模板DNA20ng/μL3μL,dNTP0。25mM2。5μL,10＆#215;PCRBuffer3。0μL,引物4μM4。0μL,TaqDNA聚合酶0。25μL。PCR群体扩增结果表明：该体系完全满足石斛基因组SRAP扩增要求。

简介：对木头开发和形成的分子的生物研究是相关基因的发现的最近的年，而是步里的焦点，他们在木头性质的控制的函数是慢的。它在另外的工具上的高产量能力，敏感，和可靠性的优点为调查能够的基因表示patternsis开发了的microarraytechniquewith很快assaying几千基因。在这研究，从开发白杨木部纸巾的二个cDNA图书馆准备的cDNAmicroarray从Populusdeltoides的主要的茎在不同高度在不成熟的木部纸巾习惯于试金基因表示模式(15?岁)，它被证实有不同木头性质(microfibrillar角度，木质的密度)旁边X光检查。有在薄片之间的微分表示侧面的274个抄本外面被屏蔽，并且单个克隆受到5定序。用生物信息的分析，我们识别了可以影响白杨木头性质的候选人基因，许多哪个属于各种各样规章并且信号transduction基因家庭例如锌手指蛋白质抄写因素，DNA有约束力的抄写因素，乙烯反应因素等等。结果建议这些基因可以调整涉及木头形成的酶。进一步的工作将被执行克隆这些基因并且决定他们怎么影响白杨木头性质。

简介：SRAP标记是一种新的分子标记技术。本研究以霍山石斛总DNA为模板,对石斛SRAP反应体系的重要参数进行优化试验。经过大量重复性实验,建立了一套适用于石斛属植物稳定可靠、重复性强的SRAP反应体系:25μl的反应体系中,模板DNA量30ng、2.5mmol/LMg2+浓度、0.8μmol/L的上下游引物、200μmol/L的dNTPs以及Taq酶1U。该体系的建立为SRAP标记应用于石斛属植物的遗传多样性研究及原植物鉴别奠定了基础。

简介：Phytohormoneabscisicacid(ABA)wascriticalformanyplantgrowthanddevelopmentalprocessesincludingseedmaturation,germinationandresponsetoenvironmentalfactors.WiththepurposetodetectthepossibleABArelatedsignaltransductionpathways,wetriedtoisolateABA-regulatedgenesthroughcDNAmacroarraytechnologyusingABA-treatedriceseedlingasmaterials(undertreatmentfor2,4,8and12h).Of6144cDNAclonestested,37differentialclonesshowinginductionorsuppressionforatleastonetime,wereisolated.Ofthem30and7wereup-ordown-regulatedrespectively.Sequenceanalysesrevealedthattheputativeencodedproteinswereinvolvedindifferentpossibleprocesses,includingtranscription,metabolismandresistance,photosynthesis,signaltransduction,andseedmaturation.6cDNAcloneswerefoundtoencodeproteinswithunknownfunctions.RegulationbyABAof7selectedclonesrelatingtosignaltransductionormetabolismwasconfirmedbyreversetranscriptionPCR.Inaddition,somecloneswerefurthershowntoberegulatedbyotherplantgrowthregulatorsincludingauxinandbrassinosteroid,which,however,indicatedthecomplicatedinteractionsofplanthormones.PossiblesignaltransductionpathwaysinvolvedinABAwerediscussed.

简介：FemaleinflorescenceofBetulaplatyphyllawassampledatanintervalofeachtwodaystoanalyzethebackgroundofgeneexpressioninfloralphase.OnthebasisofSMARTstrategy,thedrivercDNAwasobtainedfromtotalRNAofthelastsampleandthetestercDNAwasfromthatoftheothersbyRT-PCRwhichweresubsequentlyusedtoconstructasubtractedcDNAlibrary.TheresultoftheESTs(expressionsequencetags)blastXshowedthatthegenesinthesubtractedcDNAlibrarycouldbemainlyclusteredinto5groupsrelatedtometabolism,transportationandsignaltransduction,cellcycle,stressresponse,andregulation.Therelationshipbetweengeneexpressionanddevelopmentwasalsodiscussed.

简介：Objective:Toclonemultidrugresistance(MDR)relatedgenesinlungadenocarcinomacelllines.Methods:ThedifferentiallyexpressedcDNAfragmentsbetweenA549andA549DDPcellswereanalyzedbymRNAdifferentialdisplayPCR(DDRT-PCR).ThefragmentsthusobtainedwerefurtheranalyzedbyDNAsequencingandNorthernblotting.Results:ThreedifferentiallyexpressedcDNAfragmentswereobtainedandconfirmedbyNorthernblot.Sequenceanalysisrevealedthattwoofthemwerenovelandonewas100%identicalwithICEgene.Conclusion:AnalyzingdifferentiallyexpressedfragmentbetweenA549andA549DDPcellsmaybehelpfulforfindingnewMDRrelatedgenes.ThedrugresistanceofA549DDPcellsmayberelatedtotheinhibitionordown-regulationofICEgene.

简介：目的：克隆COPS3基因cDNA,构建其原核融合蛋白表达载体并表达和鉴定。方法：从培养的人骨肉瘤细胞系SOSP-9607细胞中提取总RNA,经RT-PCR获得COPS3基因。将该基因克隆到pGEM-T-Easy载体中,酶切及测序鉴定。将COPS3基因插入pET28a融合蛋白表达载体中,IPTG诱导表达,进行SDS-PAGE分析。免疫印迹法鉴定COPS3蛋白的表达。结果：cDNA测序证明,获得了COPS3基因cDNA,其序列与Genebank中报道序列完全一致。酶切分析表明,成功构建了含COPS3基因的pET28a融合蛋白表达载体。SDS-PAGE以及免疫印迹法鉴定分析表明,COPS3蛋白获得高效表达,分子质量为51Ku,表达量约占菌体总蛋白的30%。结论：成功克隆和表达了COPS3cDNA。

简介：为了确保反应体系的可行性,以便更好地开展大蒜野生近缘种的SRAP标记的遗传多样性分析,本研究以新疆大蒜野生近缘种为材料,采用L16(44)正交法,对其反应体系进行4因素4水平优化试验。结果表明:对大蒜野生近缘种PCR扩增影响最大的是dNTPs浓度,影响最小的是Taq酶浓度。筛选出15对引物,经过程序和温度筛选,最终确定SRAP的反应程序为:94℃条件下预变性1min,其次在94℃变性1min、35℃退火1min、72℃延伸1min的环境下进行5个循环的反应,再与前5个循环相同环境下,提高其退火温度至52℃进行35个循环,最后72℃延伸10min。2μL10×PCRBuffer,dNTPs浓度0.225mmol/L,引物浓度0.250μmol/L,Taq酶用量1.000U,模板DNA用量75.000ng,ddH2O补足20μL,为最佳SRAP-PCR反应体系。研究结果为进一步开展大蒜野生近缘种的遗传多样性分析、亲缘关系鉴定和分子标记辅助育种提供技术支持。

简介：从144对SRAP引物中筛选出61对多态性强、重复性好的SRAP引物，对43份苦瓜种质DNA进行了扩增，共得到2078条谱带，其中多态性谱带863条，平均每对引物扩增得到14．15条多态性谱带，多态性位点百分率为42．11％。用UPM—GA方法进行聚类分析，供试苦瓜种质的遗传相似系数为0．50～0．95，在阈值O．65处（L1）可将苦瓜分为2个类群，第1类群为野生种，第Ⅱ类群为半栽培种和栽培种；在阈值0．80处（L2）将第Ⅱ类群分为5个亚类群，L2的划分反映了苦瓜种质间的遗传多样性与果实性状、来源或地理分布有较高相关性；在阈值0．83处，第Ⅱ类群1亚类群又分为4类，大致分为滑身苦瓜（粗棱无瘤）、大顶苦瓜（棱细大圆瘤、倒锥形）、棱细圆瘤苦瓜以及尖刺瘤或凸瘤苦瓜，分类结果与苦瓜的刺瘤有无、棱条粗细、瘤的形状和瓜色等密切相关，初步认为刺瘤苦瓜为较原始类型。

简介：利用相关序列扩增多态性（SRAP）分子标记技术,对辣椒品种镇研20号杂交种子纯度进行鉴定试验.结果表明：从30对随机引物中筛选出的引物E2M5在亲本和杂交种中表现出明显的多态性;并对镇研20号杂交种进行纯度鉴定,其结果为95.5％,与田间鉴定结果基本一致。

简介：为了揭示建兰（Cymbidiumensifolium）品种的遗传多样性和亲缘关系,为建兰种质资源的有效利用和开发提供依据,本研究采用SRAP（sequence-relatedamplifiedpolymorphism）分子标记技术对来自四川、台湾、广东的47个建兰品种的遗传多样性进行分析,应用NYSYS软件对SRAP-PCR结果进行聚类分析。结果从88对引物中筛选获得12对特异性强、稳定性好的引物进行SRAP分析,共扩增出188条带纹,其中147条为多态性位点,平均每组引物扩增出12条多态性带。聚类分析表明,47个品种可以分为4个类群：第Ⅰ群由来自四川的3个品种组成;第Ⅱ群的23个品种中有18个来自四川、3个来自广东、2个来自台湾;第Ⅲ群的12个品种中有11个品种源于台湾,1个源于四川;第Ⅳ群仅有1个来自四川,其他品种均来自台湾。结果表明,由于人工驯化,造成了建兰品种遗传背景的混乱,而SRAP分子标记技术能有效地分析建兰品种的遗传多样性和亲缘关系。

简介：利用30对多态性良好的SRAP引物对90份山药种质资源进行PCR扩增,构建扩增图谱,共扩增到722个位点,多态性位点581个,多态性比例为80.47%,每对引物组合检测多态性位点3～30个,每对引物能鉴别6～51份山药种质资源；采用DNA数据分析软件对扩增出的多态性位点进行分析,构建山药种质资源方框指纹图谱,该图谱清晰地反映出每对引物能扩增的多态位点数、鉴别资源份数及资源具体编号,资源在该引物组合下所能检测得到的多态位点数及所处的具体位置等信息；从10对SRAP引物组合中挑选出的21个多态性位点,根据谱带的有无转化成的1/0字符串编码,形成山药种质资源DNA数字指纹图谱,该图谱可鉴别区分90份山药种质资源中的82份资源。同时这些指纹图谱可为下一步的山药品种鉴定,种质资源评价、利用,分子标记辅助育种及品种权保护提供技术支撑。

简介：TherootofPanaxginsengplantundergoesaspecificdevelopmentalprocesstobecomeabiosynthesisandaccumulationtissueforginsenosides.Toidentifyandanalyzegenesinvolvedinthebiosynthesisofginsenoside,weconstructedandcharacterizedafull-lengthcDNAlibraryfor6-year-oldNorthAmericanginseng.ThetiterofprimarycDNAlibraryis1.2×106pfu/mL,thetiterofamplifiedlibraryis2.6×1010pfu/mLandtherateofrecombinantisabove86%.Theinsertsizerangesfrom0.3to2.0kb.Sequencingresultsshowthat18of58genesarehighhomologoustothegenes(GBR5,GBR3andGBR1)knowninGenBank,whichareinvolvedinbiosynthesisofginsenosideinNorthAmericanginsengplant;16of58genesarenovelgenes.Thefull-lengthcDNAlibraryofNorthAmericanginsengroottissuesisessentialforthecloningofgenesknownanditisalsoaninitialkeyforthescreeningandcloningofnewgenes.

简介：Objective:Toanalyzethechangesofgeneexpressioninphenylbutyrateinduceddifferentiationofgliomacells.Methods:Theexpressionlevelsof14000genesingliomacellsbeforeandafterinducementwithsodiumphenyl-butyratefor2hor6dayswereevaluatedbycDNAarraytechniqueandprovedbymulti-dotblotting.Results:expressionof98genesingliomacellsshowedchangesaftertheinducement.Somegenesinvolvedintranscriptionandtranslationandsomeoncogenesaredown-regulated,whilesomegeneinvolvedindifferentiationorapoptosisareup-regulated.18unknownexpressionsequencingtag(EST)changedtoo.Conclusion:Ageneexpressionprofileassociatedwithdifferentiationofgliomacellswasestablished.

简介：Throughexploitingthehighhomologyofcerealcropgenes,membranouscDNAmicroarrayscontaining3311uniquericetranscripts(including1639cndosperm-derivedtranscriptsand1672maturestem-derivedtranscripts)wereusedformonitoringtheexpressionprofilesofl-leafstageseedlingsof4cerealcropspecies:rice,maize,sorghumandbarley.Afterhybridizingwith[P]labeledprobes,73.6%ofthearrayedgenesgeneratedreliablesignalsinallofthefourcerealcrops.Furtheranalysisrevealedthatamongthearrayedgenes,ahigherpercentageoftheendosperm-derivedtranscripts(86.6%)expressedthanthatofthematurestem-derivedgenes(60.9%),indicatingthatmostoftheendospermexpressedgenesfunctionedinyoungseedlingswhilcconsiderableamountofmaturestemtissueexpressedgenesdidnotexpress.Theseresultsalsoinferredthatsomegenesmightfunctiononlyatcertaindevelopmentalstages.Bycomparingtheobtainedprofdes,84geneswereidentifiedconstantlyexpressedinallthefourcerealcrops.Manyhousekeepinggenes,suchaspolyubiquitin,ubiquitinconjugatingenzymeandribosomalproteinswereincludedinthiscatalogue.Theexperimentalsoidentified14riceseedlingspecificallyexpressedgenes,including3bioticandabioticstressinducedgenesand1apoptosissuppressorencodinggeneBaxinhibitor-1.Thisinvestigationprovidedinvaluableinformationforcomparativegenomicsofgramineaemembers.

简介：Twostarch-branchingenzyme(SBE)inrice,isknowntobeakeyenzymeinamylopectinbiosynthesis.ThecDNAoftwoSBE(starch-branchingenzyme)genesSheIandShedencodingSBEⅠandSBEⅢ(twomajorisoformsinrice)wereclonedbyanimprovedRT-PCRtechnique,fromatemplatecDNAlibray,derivedfromthetotalmRNAsextractedfromtheimmatureseedsofajaponicariceWuyunjing7.DNAsequenceanalysisshowedthatthesizeoftheclonedSheIandShedcDNAswere2490and2481bplong,respectively,includingtheirentirecodingsequences.ComparisonanalysisindicatedthatthenucleotidesequenceofShe3wasthesameasthatofshed(GenbankAccessionNo.D16201)asreportedpreviously.Therewereonlyfourbase-pairsdifference,whichresultedinchangesoftwodeducedaminoacidsbetweentheclonedShe1cDNAandthereportedshe1(GenbankAccessionNo.D11082).TheclonedSheIandShedcDNAsmakeitpossibletoimprovericestarchqualitythroughgeneticengineering.

简介：以莴苣为材料研究了影响SRAP标记PCR结果的因素，包括Mg^2＋、dNTP、引物、Taq酶的浓度以及退火温度等，建立了适用于莴苣属蔬菜SRAP分析的PCR反应体系：在20μl反应体系中，模板DNA为50ng，Mg^2＋浓度为2．0mmol／L，dNTP浓度为0．2mmol／L，引物浓度为0．75μmol／L，Taq酶用量为1U。适宜的扩增程序为94℃5min；94℃1min，35℃1min，72℃1min，5个循环；94℃1min，51℃lmin，72℃1min，30个循环；72℃7min。对体系的验证结果表明本研究建立的莴苣SRAP体系重复性好、分辨率高、多态性丰富，在莴苣属蔬菜种盾资源评价、分子标记辅助选择言种等骞方面躲有专耍作用。

简介：