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  • 简介:摘要目的探讨PCR-高分辨熔解曲线(HRM)法在Kidd血型基因中的应用。方法采用简单随机抽样法,选择2019年10月至11月,于深圳市血液中心参加无偿献血的256例献血者为研究对象。本组献血者年龄为18~60岁;男性献血者为142例,女性为114例。采用血型血清学试验方法对本组献血者全血标本的红细胞抗原表型进行检测。采用PCR-SSP和PCR-HRM法对本组献血者的DNA标本进行Kidd血型基因。对于基因与血型血清学检测结果不一致的标本,则通过JK基因第9外显子直接测序法进行确认。本研究遵循的程序符合2013年修订版《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并且于献血前与所有献血者签署《献血者知情同意书》。结果①本组256例无偿献血者全血标本的血型血清学检测结果显示,Jk(a-b+)、Jk(a+b+)和Jk(a+b-)表型献血者分别为86、109和61例。②本组256例献血者基因组DNA标本的PCR-SSP和PCR-HRM法的Kidd血型基因结果一致,JKB/JKB、JKA/JKB和JKA/JKA基因献血者分别为82、115和59例。③ 22例(8.6%,22/256)献血者的血型血清学表型与基因结果不一致。其基因组DNA标本经JK基因第9外显子直接测序结果显示,JK基因第9外显子存在c.838 G>A突变,与JKA/JKB基因结果相符。结论本研究建立的PCR-HRM法可准确进行Kidd血型基因,该方法可以有效地辅助Kidd血型精准鉴定。在进行Kidd血型鉴定的实际工作中,可联合血型血清学和PCR-HRM法,以提高Kidd血型鉴定准确度。

  • 标签: Kidd血型系统 基因型 基因分型技术 多态性,单核苷酸 高分辨率熔解曲线 基因分型 JK基因
  • 简介:目的了解我院MRSA的流行状况。方法收集2005年1—6月65株社区感染MRSA及60株医院感染MRSA,应用多重PCR对MRSA染色体Dlec基因盒(staphylococcalcassettechromosomeSCCmec)及杀白细胞毒素(PVI。)基因检测,应用K—B纸片法进行药敏分析。结果125株MRSA的mecA基因阳性,其中SCCmecII1株,SCCmecⅢ120株,SCCmecⅣ3株,未分1株;未发现携带PVL基因的MRSA。携带SCCmecII、SCCmecⅢ的菌株均为多重耐药株,而携带SCCmecⅣ的菌株除对8内酰胺类药物耐药外,对其他类别的抗菌药敏感。结论本院分离的MRSA以SCCmecⅢ为主,发现SCCmecIVCA-MRSA,但不携带PVL基因;携带SCCmecⅡ、SCCmecⅢ的临床分离株耐药严重。

  • 标签: 社区获得耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 杀白细胞毒素 葡萄球菌染色体mec基因盒
  • 简介:目的建立转基因大豆的PCR-免疫层析(PCR—ICT)快速筛查新技术。方法利用转基因植物通常含有的CaMV35S启动子作为转基因成分的筛查标记,根据其序列设计特异性引物和探针,剐用生物素和地高辛标记,用胶体金免疫层析技术检测并鉴定PCR产物。结果用新建立的PCR—ICT方法可以检出含0.5%转基因大豆的标准品,对大豆样品的检测结果与琼脂糖凝胶电泳检测结果一致。结论PCR—ICT方法通过DNA杂交和金标显色来同时检测、鉴定PCR产物,可以简便、快速地筛查转基因产品。

  • 标签: 黄豆 植物 基因修饰 启动区(遗传学) 聚合酶链反应 免疫测定
  • 简介:免疫PCR基本原理与ELISA相似,即用一段可扩增的DNA分子代替ELISA中酶放大检出信号,建立了直接免疫PCR的检测蓖麻毒素技术,实验结果表明,其灵敏度达1pg/ml,比ELISA方法灵敏度高10^3倍.

  • 标签: 蓖麻毒素 免疫PCR 戊二醛 生物素 亲和素
  • 简介:目的建立HLA基因微阵列新技术,并与PCR-SSO(PCR-顺序特异性寡核苷酸)、PCR-SSP(PCR-序列特异性引物)及SBT(DNA测序)进行方法学比对。方法基于反向SSO原理设计引物和探针→探针点样→标本处理和标记→杂交检测分析,其依据的原理和主要步骤为:(1)PCR扩增;(2)DNA杂交;(3)酶联染色;(4)结果判断。以此构建HLA-B27基因微阵列系统,并检测88例标本,将此结果与PCR-SSO、PCR-SSP及金标准的SBT三种方法进行比对。结果成功构建了HLA-B27基因微阵列系统。其与PCR-SSO、PCR-SSP及SBT方法相比总体一致率为98.86%;B27阳性标本结果的一致率为97.72%(86/88);B27阴性标本结果的一致率为100%(4/4)。结论与目前常用的PCR-SSO,PCR-SSP及SBT等方法相比,HLA基因微阵列具有高效、快速、稳定、经济等特点,可同时进行HLA-B27基因检定与等位基因,不失为临床及造血干细胞库大规模HLA(中低分辨)的一种新方法。

  • 标签: HLA 基因 微阵列 分型 PCR-SSO PCR-SSP
  • 简介:摘要目的分析并焦磷酸测序法与Sanger测序法检测在丙型肝炎病毒基因中的应用情况。方法选取2018年3月——2018年11月期间100例丙型肝炎患者,收集其血浆标本,分成相等的2份,其中1份采用焦磷酸测序法进行检测,另外1份采用Sanger测序法检测,对2种检测方法在丙型肝炎病毒基因结果进行对比。结果通过焦磷酸测序法和Sanger测序法对HCV-RNA进行基因,100例标本共有93例结果一致,其余7例结果不一致,一致率达到93.0%;焦磷酸测序法和Sanger测序法在高病毒载量检出率对比上无明显差异(P>0.05);焦磷酸测序法和Sanger测序法在低病毒载量检出率对比上存在明显差异性(P<0.05)。结论焦磷酸测序法对丙型肝炎患者开展病毒基因,检测结果可靠、准确,与Sanger测序法相比,焦磷酸测序法敏感度更高。

  • 标签: 焦磷酸测序 Sanger测序 丙型肝炎 病毒基因分型
  • 简介:摘要目的探究对结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB突变以PCR-反向点杂交法检测的效果。方法设计结核分歧杆菌rpoB基因引物,采用PCR-反向点杂交法对40例结核杆菌临床菌株耐药性进行检测,对照由DNA测序法检测的标准结核分歧杆菌(H37Rv)rpoB基因,确定rpoB基因的变异情况,对PCR-反向点杂交法的灵敏度和准确性作出评价。结果40株临床菌株中有11株利福平敏感株的基因序列与对照的H37Rv相同,剩下的29株耐药株中检测到变异基因27株,其特异性为100%,阳性率为93.1%。结论rpoB基因本身高度保守,但由于rpoB基因突变导致结核分枝杆菌对利福平耐药。本研究使用PCR-反向点杂交法针对rpoB基因高突变区设计引物,此方法快速、简便、准确,能有效监测临床标本中结核分枝杆菌,对临床早期诊治结核病有极大帮助。

  • 标签: PCR-反向点杂交法 rpoB 基因 利福平 结核分歧杆菌
  • 简介:目的:了解Dombrock血型Do^a和Do^b基因在汉族人群中的分布。方法:采用PCR—SSP技术对Dombrock血型进行Do^a和Do^b基因。结果:248例Dombrock血型Do^a的基因频率为0.0867,Do^b的基因频率为0.9133。结论:248例Dombrock血型Do^a及Do^b的基因频率分别为0.0867和0.9133。PCR—SSP技术可以较好的对Dombrock血型进行DO基因

  • 标签: Dombrock Do^a Do^b 血型
  • 简介:目的:建立并改良磁珠提取基因DNA的方法,以应用于HLA常规测序。方法:使用磁珠法自动提取系统从全血中提取基因组DNA,利用DNA定量仪测定DNA浓度与纯度,利用测序仪对PCR扩增产物进行测序及相关的分析软件进行HLA结果分析。比较改良前后DNA浓度与纯度、HLA结果成功率、信噪比及测序胶图的反应格局。结果:改良后96份DNA浓度的均一性、纯度均优于改良前;32份HLA结果中HLA-A、B位点成功率改良后高于改良前,差异有统计学意义(P〈0.01);改良后32人份HLA-B第二外显子信噪比(N/S)合格率均高于改良前,差异有统计学意义(P〈0.01);改良后32份胶图反应格局均优于改良前。结论:改良磁珠提取DNA法能稳定、可靠地应用于HLA测序,具有快速、高通量化的特点和广泛的应用前景。

  • 标签: 脱氧核糖核酸 标本 基因分型 测序分型
  • 简介:摘要:手足口病是儿科的多发病和常见病,具有较高的传染性和流行性,通常发生在夏秋季节,以5岁以下的婴幼儿最为常见。其中,以手、足部出疹,口腔黏膜疱疹或溃疡等为特征性表现。一般情况下患儿在发病的5~7天自行缓解,也有少部分患儿会发展至重症,即出现脑膜炎、脑炎、脊髓炎、脑脊髓炎等中枢神经系统受累并发症,甚至伴有肺水肿、肺出血及循环衰竭等症状。危重症患儿与轻症患儿不同,因其病情进展较快,若不及时接受有效治疗,可危及生命安全。目前临床上诊断手足口病的金标准为病毒分离培养,虽然准确率高,但检测时间长,在现实应用过程中存在比较明显的缺陷,因此寻求一种操作简单、方便、费用低、准确率高、灵敏度高的检查方法十必要。以PCR为基础的分子检测,具有准确率高、灵敏度高,适合临床的需求。

  • 标签: 荧光PCR 测序 手足口病 病毒
  • 简介:探讨霍夫变换(Houghtransform)在聚合酶链反应-反向点杂交(polymerasechainreaction-reversedotblotting,PCR-RDB)检测基因突变结果的自动化判读中的应用。以凯普HMM-2I医用核酸分子快速杂交仪检测基因突变为例,建立一种通过霍夫变换进行图像识别的方法,以快速判读PCR-RDB的检测结果,并提出一套基于移动终端的检测结果后处理方案。利用开发的软件,对113份地中海贫血常见突变以及86份人乳头瘤病毒PCR-RDB检测结果进行了自动读取,并同人工判读结果进行了比较,二者的符合率均达100%。将霍夫变换应用于PCR-RDB检测图像的自动化判读符合实际需求,无需人工干预,可以降低肉眼判读的错误率并提高工作效率。

  • 标签: 聚合酶链反应-反向点杂交 霍夫变换 二值化图像 中值滤波 基因突变筛查 无线移动终端
  • 简介:摘要目的建立多重荧光PCR-熔解曲线法,并评价其同时检测假丝酵母菌、曲霉菌及新型隐球菌的诊断价值。方法建立多重荧光PCR-熔解曲线法并对其检测体系进行优化。收集临床高度怀疑为侵袭性真菌感染(IFI)的各类临床样本179例,其中血液65例、深部痰液35例、尿液30例、脑脊液18例、胸腹水12例、肺泡灌洗液10例、新鲜肺组织9例。通过敏感性、特异性、重复性实验验证多重荧光PCR-熔解曲线法的检测性能,并应用受试者工作特征(ROC)曲线评价该方法的诊断效能。结果建立的多重荧光PCR-熔解曲线法可同时检测8种常见病原真菌,包括4种假丝酵母菌(白假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、克柔假丝酵母菌)、3种曲霉菌(烟曲霉、黄曲霉、黑曲霉)和新型隐球菌。其最低检测限为1 × 104 cfu/mL,且常见细菌无扩增反应,重复性实验解链温度波动小于0.5 ℃。179例临床样本中,以培养法、镜检法、病理诊断等"金标准"方法诊断IFI阳性为112例,多重荧光PCR-熔解曲线法检测阳性为96例。多重荧光PCR-熔解曲线法同时检测假丝酵母菌、曲霉菌及新型隐球菌的敏感度为0.857,特异度为0.970,阳性预测值为0.980,阴性预测值为0.802,ROC曲线下面积为0.914,95%置信区间为0.868 ~ 0.959,P < 0.001。结论本研究建立的多重荧光PCR-熔解曲线法可快速、准确、高通量同时检测假丝酵母菌、曲霉菌及新型隐球菌,对于IFI的早期诊断具有重要意义。

  • 标签: 真菌 多重荧光PCR 熔解曲线
  • 简介:摘要目的比较多重荧光PCR-熔解曲线法与病理诊断法检测福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肺组织样本中病原真菌的价值。方法选择2014—2019年本院病理科病原真菌阳性患者的42份肺组织样本(念珠菌8份、曲霉菌23份、隐球菌11份)作为阳性组,病原真菌阴性的肺组织样本50份作为阴性组,均进行多重荧光PCR-熔解曲线法检测,并应用配对χ2检验和Kappa值对两种方法的检测结果进行比较。结果阳性组42份样本多重荧光PCR-熔解曲线法检出23份阳性,并可分辨至种水平,其中念珠菌4份(白色念珠菌2份、热带念珠菌1份、克柔念珠菌1份)、曲霉菌13份(烟曲霉11份、黄曲霉2份)、新型隐球菌6份。阴性组50份样本多重荧光PCR-熔解曲线法检测均阴性。Kappa值0.568,以病理诊断法为"金标准",多重荧光PCR-熔解曲线法检测病原真菌的灵敏度为54.8%(23/42)、特异性为100.0%(50/50)。结论多重荧光PCR-熔解曲线法检测FFPE样本中病原真菌的灵敏度不高,但可以将病原真菌鉴定至种,是病理诊断法的补充。

  • 标签: 真菌 荧光PCR,多重 熔解曲线 福尔马林固定石蜡包埋组织
  • 简介:目的通过改进和优化多重扩增阻滞突变系统-PCR(multi-ARMS-PCR)条件,建立载脂蛋白E(ApoE)基因的简易方法。方法基于multi-ARMS-PCR的原理和特点,针对文献报道方法中存在的缺陷和错误,重新设计或改进引物。以外周血白细胞基因组DNA为模板,应用4个等位基因特异性寡核酸上游引物、1个通用下游引物和一对内参引物,A,B两个管同步进行多重PCR反应。PCR扩增产物经过琼脂糖凝胶电泳分离-EB染色,根据电泳带型的差异,实现对ApoE6种基因的判定。结果新引物显著提高了扩增效率和反应特异性,排除了非特异条带的干扰,减少了ApoE基因的错判。结论采用优化后的multi-ARMS-PCR方法对ApoE基因进行鉴定,具有操作简便、时间短、效率高、成本低的优点,值得推广。

  • 标签: 载脂蛋白E 多重扩增阻滞突变系统-PCR 基因分型
  • 简介:摘要目的评价PCR-流式荧光杂交技术在地中海贫血产前基因诊断中的诊断效能。方法回顾性分析2017年9月至2020年12月间于广东省妇幼保健院进行地中海贫血产前基因诊断的8 005份胎儿的样本,所有样本均经多重缺口-PCRPCR-反向斑点杂交法、Sanger测序和多重连接依赖性探针扩增等方法确诊基因,同时应用PCR-流式荧光杂交技术作为地中海贫血常见突变位点的验证平台进行平行检测。分析基因检测结果,并比较PCR-流式荧光杂交技术与传统方法对于地中海贫血常见突变位点的检测结果的诊断效能差异。结果传统方法共检出地中海贫血阴性样本1 939份,阳性样本6 066份,其中包括α-地中海贫血4 513份、β-地中海贫血1 475份以及αβ-地中海贫血78份。经软件首次判读,PCR-流式荧光杂交方法共判读成功7 845份,与传统方法比较,其敏感度、特异度和准确度均为100%。首次判读失败的160份样本经复检或人工复核数据后均可成功正确判读。结论PCR-流式荧光杂交方法与传统方法对于地中海贫血产前基因诊断中常见突变位点的诊断效能无差异。

  • 标签: 地中海贫血 PCR-流式荧光杂交 液相芯片 产前基因诊断
  • 简介:摘要目的探讨荧光定量PCR法检测乙肝病毒B、C基因的方法学的应用价值,掌握不同类型感染者的基因分布特征。方法随机选择在我院接受诊疗的73例乙型肝炎患者,对其临床资料进行回顾性分析,所有患者均采用荧光定量PCR法进行检测,判断患者基因。结果利用荧光定量PCR法成功70例(95.9%),其余3例(4.1%)未检出;70例成功的患者中,B45例/61.6%,C11例/15.1%,B/C混合14例/19.2%,B显著高于C、B/C混合,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论荧光定量PCR法检测乙型肝炎患者,成功率较高,且乙肝病毒以B基因为主。

  • 标签: 荧光定量PCR分型法 乙肝病毒 基因型
  • 简介:摘要目的多结节肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是常见的肝脏恶性肿瘤,本研究通过分析多结节HCC患者肝组织和各结节的克隆起源特点,探讨克隆起源检测的意义。方法选取海军军医大学东方肝胆外科医院收治的1例5结节HCC患者,提取周边肝组织和5个结节DNA,利用PCR-毛细管电泳法检测10个微卫星位点杂合性缺失情况,判断各结节之间的克隆起源关系。结果5个结节与周边肝组织在10个位点处均检出杂合性缺失,其中T2与其他4个结节之间检出4个或以上的杂合性缺失位点。结论多结节HCC各结节间的克隆起源模式可能不同。

  • 标签: 肝细胞癌 克隆 多结节 微卫星 杂合性缺失
  • 简介:目的建立一种检测丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白基因的巢式RT-PCR方法,以及HCV核心蛋白基因区测序方法。方法从国际HCV数据库查找HCV核心蛋白基因序列,设计HCVRNA巢式RT-PCR引物及测序引物,并建立巢式RT-PCR反应体系。采用出入境人员抗-HCV阳性血清60份,及50份标本为HCV抗体检测阴性,且谷丙转氨酶(ALT)〉100U/L的血清进行巢式RT-PCR检测,阳性结果使用本研究建立的测序引物进行基因测序以确定HCV基因。结果60份抗-HCV阳性血清中,42份(70.0%)核心蛋白基因RT-PCR扩增阳性,其中1b27例、1a12例、6a1例、3a1例、2a1例。50份ALT〉100U/LR抗-HCV阴性标本中,1份HCV核心蛋白基因RT-PCR扩增阳性,测序鉴定为3a。结论本研究建立了一种HCVRNA核心蛋白基因的巢式RT-PCR检测和方法,为出入境人员HCV的诊断和监测提供重要依据。

  • 标签: 丙型肝炎病毒 核心蛋白基因 巢式RT-PCR 基因分型