Genome-Wide Comparative in silico Analysis of Calcium Transporters of Rice and Sorghum

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摘要 在Poaceae的钙举起,translocation和累积的机制充分还没被理解。处理这个问题,我们在钙(Ca2+)的silico分析进行了染色体宽的比较级二庄稼种,米饭和蜀黍的transporter基因家庭。基因注解,在上游的行动cis元素的鉴定,种系发生的树构造和基因家庭印射的syntenic用几个生物信息学工具被执行。31Ca2+transporters的一个总数,从12个染色体在9上散布了,从米饭染色体被预言,当除了染色体10,从蜀黍预言的28Ca2+transporters在所有染色体上是分布式的时(Chr10)。有趣地,大多数Chr1和Chr3上的基因显示出在米饭和蜀黍之间的一种反的syntenic关系。这些transporter蛋白质的多重顺序排列和主题分析揭示了在二种之间的高保存。种系发生的树能很好在基因家庭之中识别隧道,ATPases和exchangers的子类。在里面silicocis规章的元素分析建议了与光,应力和荷尔蒙应答以及内乳特定、分裂组织特定的基因表示联系的多样的功能。进一步的实验被保证验证在里面预言的transporter基因家庭的silico分析并且阐明在各种各样的生物进程的Ca2+transporters的函数。
机构地区 不详
出版日期 2011年04月14日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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