Comparative Analysis of Genetic Diversity and Structure in Rice Using ILP and SSR Markers

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摘要 从农业(USDA)米饭收集的美国部门的36个米饭条目的基因差异用103ILP(intron长度多型性)和54SSR(简单顺序重复)被估计标记。236和332等位基因的一个总数被ILP和SSR标记分别地检测。平均,SSR标记比ILP标记生产了更高的多型性信息内容价值和等位基因的数字。而Nei的基因距离测量了,使用SSR标记比用ILP标记测量了的高得多。壁炉架的测试显示有统计上重要的关联(r=0.827,P<0.001)在二个标记系统之间。基于ILP和SSR标记聚类的UPGMA导致了一致dendrograms。cophenetic关联系数(r=0.918,0.878和0.924,P<0.001为ILP,SSR和联合标记,分别地)证明高度精确的dendrogram在这些条目之中代表了基因距离。36个条目被划分成四个组。四非洲的Oryzaglaberrima就职在不同的组(I)以内被聚类,并且留下的条目被分开成三个组(II,III和IV)。所有条目能也被聚类进二个主要的组:一个人由III和IV组成,看作了indica组,并且其他人由构成我(O。glaberrima)并且II(像装饰用的梨树)。当indica组分享了混合祖先时,基于模型的簇分析表明像装饰用的梨树的组维持了很纯的祖先,特别为组III,它有七混合与组IV从19.5%~30.0%祖先分享(基于SSR标记)。ILP和SSR标记能为基因学习是很有用的并且在米饭繁殖,这被建议。
机构地区 不详
出处 《水稻科学:英文版》 2010年4期
出版日期 2010年04月14日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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