简介：Genomicspromisestoenrichtheinvestigationsofbiologyandbiochemistry.Currentadvancementsingenomicshavemajorimplicationsforgeneticimprovementinanimals,plants,andmicroorganisms,andforourunderstandingofcellgrowth,development,differentiation,andcommunication.Significantprogresshasbeenmadeintheunderstandingofplantgenomicsinrecentyears,andtheareacontinuestoprogressrapidly.Functionalgenomicsoffersenormouspotentialtotreeimprovementandtheunderstandingofgeneexpressioninthisareaofscienceworldwide.Inthisreviewwefocusonfunctionalgenomicsofwoodqualityandpropertiesintrees,mainlybasedonprogressesmadeingenomicsstudyofPinusandPopulus.Theaimsofthisreviewaretosummarizethecurrentstatusoffunctionalgenomicsincluding:(1)Genediscovery;(2)ESTandgenomicsequencing;(3)FromESTtofunctionalgenomics;(4)Approachestofunctionalanalysis;(5)Engineeringligninbiosynthesis;(6)Modificationofcellwallbiogenesis;and(7)Molecularmodelling.Functionalgenomicshasbeengreatlyinvestedworldwideandwillbeimportantinidentifyingcandidategeneswhosefunctioniscriticaltoallaspectsofplantgrowth,development,differentiation,anddefense.Forestbiotechnologyindustrywillsignificantlybenefitfromtheadventoffunctionalgenomicsofwoodqualityandproperties.

简介：压缩(ZRT/IRT-like蛋白质)和CDF(阳离子散开Facilitator)是主要搬运锌进并且从cytosol的二个大金属transporter家庭。几快速做，CDF运输ers在哺乳动物和各种各样的模型有机体被描绘了，并且许多候选人基因被染色体工程识别了，例如酵母，线虫，水果苍蝇，和斑马鱼。压缩和CDF运输ers的意外功能最近在一些模型有机体被报导了，导致在我们哺乳动物的对应物的功能的理解的主要进展。这里，我们在从代表性的模型有机体获得的真核细胞的压缩和CDF运输ers之中在顺序类似和功能的关系上考察最近的信息。

简介：赤霉素(GA)一起被指一组diterpenoid酸，其中一些充当植物荷尔蒙并且为正常植物生长和开发是必要的。DNA微数组技术为大量送信人RNA抄本的平行数量化离子成为了标准工具。这条途径的力量在把被表明了植物生理学和开发，并且在解开内在的细胞的发信号小径。理解GA由调整植物的生长和发展的分子的机制与单音的简易窄床模型植物大米的参考，在被GA调整的抄写和翻译层次识别并且分析更多的基因和他们的产品是必要的。与二种主要米饭类型，indica和装饰用的梨树米饭的草稿序列的可获得性，在染色体规模上分析基因的全球表示侧面变得可能。在这评论，进步在用微数组系统在米饭叶鞘发现新基因做了，他们的描述被讨论。调查结果做了在这方面，这被相信为理解GA由调整米饭的生长和发展的机制有重要含意。

简介：Computationalanalysisisessentialfortransformingthemassesofmicroarraydataintoamechanisticunderstandingofcancer.Herewepresentamethodforfindinggenefunctionalmodulesofcancerfrommicroarraydataandhaveappliedittocoloncancer.First,acoloncancergenenetworkandanormalcolontissuegenenetworkwereconstructedusingcorrelationsbetweenthegenes.Thenthemodulesthattendedtohaveahomogeneousfunctionalcompositionwereidentifiedbysplit-tingupthenetwork.Analysisofbothnetworksrevealedthattheyarescale-free.Comparisonofthegenefunctionalmodulesforcoloncancerandnormaltissuesshowedthatthemodules’functionschangedwiththeirstructures.

简介：Heterogeneousnuclearribonucleoproteins(hnRNPs)arespliceosomalmacromolecularassemblagesandthusactivelyparticipateinpre-mRNAmetabolism.Theyarecomposedofevolutionarilyconservedandtandemlyrepeatedmotifs,wherebothRNA-bindingandprotein-proteinrecognitionoccurtoachievecellularactivities.Byyetunknownmechanisms,theseribonucleoprotein(RNP)particlesaretargetedbyautoantibodiesandhenceplaysignificantroleinavarietyofhumansystemicautoimmunediseases.Thisfeaturemakesthemimportantprognosticmarkersintermsofmolecularepidemiologyandpathogenesisofautoimmunity.SinceRNPdomainisoneofthemostconservedandwidespreadscaffolds,evolutionalysesoftheseRNA-bindingdomainscanprovidefurthercluesondisease-specificepitopeformation.ThestudypresentedhereinrepresentsasequencecomparisonofRNA-recognitionregionsofrecentlyclonedandcharacterizedhumanhnRNPA3withthoseofotherrelevanthnRNPA/B-typeproteins.Theirimplicationsinhumanautoimmunityareparticularlyemphasized.

简介：人的造血作用用控制干细胞区别的技术被评估，二维的胶化基于电气泳动的proteomics，和功能的基因组学。我们提供神经胶质成熟因素鲸鱼群妈(GMFG)是cytokine应答的蛋白质在的第一份报告导致erythropoietin并且刺激导致因素的造血的系开发的granulocyte殖民地。从全球功能的基因组学分析的结果显示GMFG拥有几个另外的特征：造血的织物特定的基因表示，与高分数的造血作用特定的抄写因素集中的一个倡导者，和有一个原始血/免疫者系统的可能的分子的coevolution。根据我们的调查结果，我们假设那GMFG是可以调停的造血特定的蛋白质人的造血的干细胞的pluripotentiality和系承诺。

简介：在这研究，被尝试了从他们的氨基酸序列预言克否定的细菌的蛋白质的主要功能。使用训练并且测试的数据集由670非冗余的克否定的细菌的蛋白质(255细胞的过程，60个信息分子，285新陈代谢，和70个毒力因素)组成。首先，我们开发了使用氨基酸和dipeptide作文的一个基于SVM的方法并且分别地完成了52.39%和47.01%的全面精确性。我们基于tetrapeptides，我们在识别了显著地在蛋白质的一个班上发现的唯一的tetrapeptides为蛋白质的分类介绍了一个新概念。这些tetrapeptides作为输入特征被使用预言蛋白质的功能并且完成了68.66%的全面精确性。我们也开发了tetrapeptide信息与氨基酸作文在被使用并且完成了70.75%的全面精确性的一个混合方法。五倍的生气确认被用来评估这些方法的表演。网服务器VICMpred为预言克否定的细菌的蛋白质(http://www.imtech.res.in/raghava/vicmpred/)的函数被开发了。