简介：增加的证据证明丝氨酸，threonine和酷氨酸残余上的蛋白质phosphorylation是在细菌的主要规章的translational以后修正。这评论在细菌的致病力集中于细菌的phosphoproteome的含意并且在phosphoproteomics和phosphorylation网络的连接加亮方法的最近的开发。在高精确性团spectrometry的最近的技术开发戏剧性地转变了proteomics并且使它可能一些彻底的地点特定的细菌的phosphoproteomes的描述。在一些细菌的phosphoproteomes的高许多酷氨酸phosphorylations在致病力建议他们的角色，特别在病原体主人相互作用的情况中；在细菌的邻蛋白质的高许多multi-phosphorylation地点是相对小的phosphorylation尺寸和蛋白质功能的精细的规定的指示物的赔偿。

简介：Therapidincreasingnumberofcompletedbacterialgenomesprovidesagoodopportunitytocomparetheirproteomes.Thisstudywasundertakentospecificallycompareandcontrasttheirsecretomes—thefractionoftheproteomewithpredictedN-terminalsignalsequences,bothtypeIandtypeII.Atotalof176theoreticalbacterialproteomeswereexaminedusingtheExProtprogram.ComparedwiththeGram-positives,theGram-negativebacteriawerefound,onaverage,tocontainalargernumberofpotentialSec-dependentsequences.IntheGram-negativebacteriabutnotintheothers,therewasapositivecorrelationbetweenproteomesizeandsecretomesize,whiletherewasnocorrelationbetweensecretomesizeandpathogenicity.WithintheGram-negativebacteria,intracellularpathogenswerefoundtohavethesmallestsecretomes.However,thesecretomesofcertainbacteriadidnotfitintotheobservedpattern.Specifically,thesecretomeofBorreliaburgdoferihasanunusuallylargenumberofputativelipoproteins,andthesignalpeptidesofmycoplasmasshowclosersequencesimilaritytothoseoftheGramnegativebacteria.Ouranalysisalsosuggeststhatevenforatheoreticalminimalgenomeof300openreadingframes,afractionofthisgenepool(uptoamaximumof20%)maycodeforproteinswithSec-dependentsignalsequences.

简介：在过去几十年，从在整个世界的科学家以象小规章的RNA那样的新奇功能的单位拿了热切的兴趣，小开的读物框架，pseudogenes，transposons，integrase绑定attB/attP地点，为genomic复杂性在细菌的intergenic区域(IGR)以内并且在那些垃圾区域的分析重复元素。这里，我们开发了一个网服务者，命名Junker，详细说明为检验他们的长度分发，四象限的阴谋，GC百分比和重复便于IGR的深入的分析。在一个特别细菌的染色体的选择之上，物理染色体地图与选择作为多重loci被显示详细看兴趣的任何loci。另外，一个IGR统计模块被创造了并且在网服务者实现了分析IGR的长度分发并且理解由产生四象限的阴谋的越过染色体的IGR的混乱组织。建议的网服务者在URLhttp://pranag.physics.iisc.ernet.in/junker/是自由地可得到的。

简介：三位字节频率(TP)的阶段移动的概念从17个细菌的染色体在基因被用于寻找的潜在的DNA插入。为这些插入的察觉的一个数学算法被开发了。这条途径能与不是三个底的multiples的长度检测潜在的插入和删除，特别相对大的DNA碎片的插入(>100个底)。在三位字节矩阵之间的新类似措施被采用为检测TP阶段移动改进敏感。有每由超过1,200个底组成的17,220细菌的基因的序列被分析，并且TP阶段移动的存在在16%分析基因(2,809基因)被显示出，它是多于在我们的以前的工作检测了那的大约4次。我们建议TP阶段的移动可以显示与不是三个底的multiples的长度在DNA碎片的插入以后在基因读框架的移动。在TP的阶段移动和在基因的框架移动之间的一种关系被讨论。

简介：CoptotermescurvignathusHolmgren能够在生活树上喂。这个能力被归因于他们由白蚁他们的内脏微生物生产的自己的可加水分解纤维素的酶和合作的酶是有家具的有效消化系统。在这研究，居住在C的内脏的一连串的多样的微生物的身份。curvignathus被定序在全身附近的16SrRNA基因揭示。154细菌的phylotypes的一个总数被发现。Bacteroidetes是最丰富的门并且占了大约65%勇气微生物引起的侧面。这被Firmicutes，Actinobacteria，螺旋菌，Proteobacteria，TM7，Deferribacteres，Planctomycetes，Verrucomicrobia，和白蚁组跟随1。基于种系发生的学习，这共生能是有系统发生的分发，在内脏的强壮的选择压力，和决定细菌的生物群系列在后面的另外的思索的压力的内脏enterotypes的长coevolution的结果。在与另外的白蚁更加不同的细菌的领域的克隆的rRNA基因的种系发生的分发在在哪儿的内脏反映强壮的选择压力C的内脏microbiome的一篇比例的作文。curvignathus建立了。选择压力能被连接到C的唯一的食谱偏爱。深刻地在生活树上喂的curvignathus。精细的内脏microbiome作文可以对机会主义的病原体提供可得到的营养素给主人以及潜在的保护。

简介：象Wolbachia那样的繁殖寄生虫在节肢动物之中是极其普遍的并且能在他们的主人的繁殖和健康上有大影响。未被发现的感染能因此使集中于繁殖隔离的主人行为，复制，健康，和度的方面的大量研究的结果惊讶。这个潜在的问题被有货模型系统果蝇melanogaster的调查Wolbachia感染的发生的工作已经加重了。这里，我们调查进一步通常使用的模型节肢动物的实验室股票的一个范围，特别集中于面粉甲壳虫Triboliumcastaneum和Triboliumconfusum，豇豆象鼻虫Callosobruchusmaculatus和相关种类(翘目：Tenebrionidae和Bruchidae)。这些种类是普遍的存储了产品害虫因此有共生者的感染的知识进一步在通知biocontrol措施有潜在的使用。甲壳虫与3个已知的微生物引起的繁殖寄生虫为感染被估计：Wolbachia，立克次休属微生物，Spiroplasma。有一些这些微生物的感染在一些股票学习了的实验室被发现，尽管全面感染是相对稀罕的。多半在这些或另外的种类和以前的研究的类型发现感染最被假装的后果被讨论。

简介：生节是对在昆虫的细菌的挑战的占优势的细胞的防卫反应。在这研究，Chrysomyamegacephala的第三个中间形态幼虫与细菌被注射，Escherichia关口iK12(106CFU/mL，2μL)，立即在eicosanoid生合成的禁止者的注射以前，它严厉地减少的生节反应。测试幼虫与2(dexamethasone)，cyclo-oxygenase(消炎痛，布洛芬和piroxicam)，双cyclo-oxygenase/lipoxygenase(phenidone)和lipoxygenase(esculetin)和这些减少了的phospholipase的特定的禁止者被对待除了esculetin的生节。细菌的影响在注射(5nodules/larva)的2h以内是明显的，并且在8h以后增加了到最大值(与15nodules/larva)，然后显著地减少了超过24h(9nodules/larva)。dexamethasone的禁止的影响在注射(4对5nodules/larva)的2h以内是明显的，并且生节显著地与控制相比被减少，在24h(5对8nodules/larva)上。布洛芬，消炎痛，piroxicam和phenidone的增加的剂量导致了小瘤的减少的数字。小瘤继续在蛹的阶段期间存在。然而，dexamethasone的效果被与eicosanoid先锋多元不堡和对待注射细菌的昆虫颠倒丰满的酸，arachidonic酸。这些调查结果同意了我们eicosanoid能调停的看法响应在另一Dipteran昆虫C的细菌的感染的细胞的防卫机制。megacephala。