简介:摘要宏基因组学利用新一代高通量测序技术,以特定环境下病原体基因组为研究对象,在分析病原体多样性、种群结构、进化关系的基础上,进一步探究病原体的群体功能活性、相互作用及其与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。目前,绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价,宏基因组检测临床应用前分析性能确认的研究相对空白,北京协和医院检验科研究团队结合多年病原宏基因组检测的经验和国内外相关研究成果,就病原宏基因组项目医院本地化开展前的性能确认工作,从临床预期用途、方法学建立、性能确认、标准操作作业书4个方面提出了具体的实施方案,具体包含:标本类型和病原体范围、生物信息流程建立、生物信息分析参考盘制备和评估、湿实验流程的建立、背景核酸数据模型的建立、参考盘制备和全流程的性能确认等。
简介:【摘要】目的 探讨高通量血液透析治疗肾功能衰竭的临床效果。方法 以等量电脑随机法将我院收治肾功能衰竭患者60例均分为A(n=30)、
简介:摘要目的优化和评估粪便和组织样本高通量测序前处理方法,提高高通量测序在宏病毒组研究中的灵敏度。方法针对粪便样本,选取经粪便排毒的5种病毒阳性样本混合模拟样本,对不同材质的滤器、核酸酶不同处理时间、不同的提取核酸方法进行评价。针对组织样本,选取动物组织中检出的2种病毒阳性样本,对过滤、核酸酶处理和不同的核酸提取方法进行评价。采用TaqMan real-time PCR定量方法评价每步处理对每一种模式病毒核酸载量的影响,采用SYBR Green real-time PCR方法对细菌16S rRNA基因和宿主12S rRNA基因进行定量以评价细菌和宿主的去除效果。结果对于粪便样本,使用0.22 μm的PES滤器过滤效果较好,使用PVDF材质滤器导致样本量减少;核酸酶消化2 h比消化1 h去除细菌的效果更好,且病毒损失较少;使用RPMK试剂盒可以有效减少细菌,但对部分病毒提取效果较差,而MVSK试剂盒提取病毒核酸效果较好。对于组织样本,使用0.22 μm的PES滤器过滤病毒损失较少;核酸酶消化1 h可以有效去除宿主gDNA,且病毒损失较少;使用VNAEK II试剂盒提取病毒核酸效果最好,Trizol LS+RPMK方法去除宿主gDNA效果较好,但病毒损失较大。粪便和组织样本的前处理方法整个流程的病毒损失分别为(1.7-3.0)Ct和(1.6-2.5)Ct。结论粪便样本最佳方法为PES滤器过滤、核酸酶消化2 h、MVSK试剂盒提取核酸;组织样本最佳方法为PES滤器过滤、核酸酶消化1 h、VNAEK II试剂盒提取核酸。
简介:[摘要] 目的:建立新冠、流感等常见呼吸道病原高通量快速检测方法,为呼吸道传染病防控提供技术支撑和技术保障。方法:采用实时荧光RT-PCR方法和恒温扩增微流控芯片法分别检测新型冠状病毒、流感病毒、呼吸道合胞病毒等多种病原,比对两种方法结果的符合率,建立高通量多病原快速检测方法。结果:719份样本实时荧光RT-PCR方法检出新冠病毒58份、流感病毒45份、呼吸道合胞病毒0份,103份阳性病毒样本恒温扩增微流控芯片法检出新冠病毒55份、流感病毒44份、呼吸道合胞病毒0份。另选新冠、流感、呼吸道合胞病毒均阴性样品30份进行检测,结果均为阴性。两种方法新冠病毒阳性检出符合率为94.83%,流感病毒阳性检出符合率为97.78%,新冠、流感、呼吸道合胞病毒均阴性符合率为100%。结论:恒温扩增微流控芯片法对引起呼吸道综合征常见病原包括新冠病毒、流感病毒、呼吸道合胞病毒等多种病原可以多指标并行检测,实现多病原快速检测,为呼吸道传染病诊断提供技术支撑。
简介:【摘要】目的:本文研究的主要目的是针对维持性血透患者,实施高通量血透(HFD)的实际临床效果。方法:选择2018-2021年在我院实施维持性血透的60例患者,对患者实施普通血透
简介:【摘要】目的:探讨分析高通量血液透析对慢性肾病患者治疗的效果研究。方法:该次研究从2020年7月开始,至2021年8月为止,通过电脑的方式进行随机抽选选择上述时间段内我院接受治疗的慢性肾病患者68例作为入组成员,将其进行了两个组别的区分,分别为使用常规血液透析治疗的对照组共34例,以及使用高通量血液透析治疗的观察组共34例,对比两组患者的肾功能指标。结果:观察组的血肌酐以及血尿素氮水平均低于对照组(P<0.05)。结论:对于出现慢性肾病的患者,对其使用高通量血液透析进行治疗,能让患者获得更加接近理想状态的治疗效果,患者拥有更高的治疗安全性,应该得到临床实际使用并推广。