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  • 简介:[摘要] 目的 探讨头颈癌中的肿瘤浸润免疫细胞( Tumor-infiltrating immune cells, TIICs)亚群与其临床特征及预后的关系。方法 采用去卷积算法(CIBERSORT)分析504例头颈癌组织和42例正常组织浸润免疫细胞类型及评估22个免疫细胞亚群的比例,Corrplot R包评价不同亚群免疫细胞间的关系,Survival R包绘制Kaplan-Meier曲线,并用Wilcox检验分析TIICs与临床特征的相关性。结果 CIBERSORT分析显示,头颈癌组织中共有22种TIICs,其中幼稚B细胞、单核细胞和M0型巨噬细胞在肿瘤组织与相应的正常组织有显著差异;Wilcox检验分析显示,M1型巨噬细胞、卵泡辅助T细胞和静息记忆性CD4+T细胞与患者年龄有关,巨噬细胞和静息NK细胞与患者性别有关,幼稚B细胞、CD8+T 细胞、调节性T细胞(Tregs)和M0型巨噬细胞的丰度与肿瘤病理分级有关,且I期和II期头颈癌患者静息肥大细胞水平较高;Kaplan-Meier分析显示,卵泡辅助T细胞与头颈癌患者5年总生存率(Overall survival ,OS) 呈正相关,而活化的树突状细胞与头颈癌的5年OS呈负相关。 结论 头颈癌肿瘤浸润免疫细胞亚群与其临床特征及预后有关,可为临床预后提供一定的参考价值。

  • 标签: [] 头颈部癌 肿瘤浸润免疫细胞 TCGA CIBERSORT
  • 简介:摘要血管免疫细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)是较常见的外周T细胞淋巴瘤,不同患者临床过程、预后及对治疗的反应差异较大。AITL肿瘤微环境(TME)的细胞数量和成分可变,除肿瘤细胞外,还包括非肿瘤细胞和基质,如肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes,TILs)、巨噬细胞、肥大细胞等,以及丰富的细胞因子成分,其中,TILs是TME的关键成员,可能对AITL的发生发展具有重要意义。本文将从AITL中TILs的主要构成与预后、不同TILs与治疗的关系及其研究方法等进行综述,总结AITL中TILs的特征并探讨其潜在的临床意义,以期寻找免疫治疗的新靶点,开辟AITL免疫药物治疗研发的新领域。

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  • 简介:摘要目的研究结直肠腺癌中肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)的相对占比,探讨TIICs与结直肠腺癌的预后及临床分期的关系。方法通过TCGA数据库获取结直肠腺癌基因转录表达数据及样本对应的临床信息。通过CIBERSORT软件计算每个样本中22种TIICs的相对占比。利用R软件分析结直肠腺癌和正常结肠组织之间TIICs的占比差异;分别对每种TIICs做单因素生存分析,并分析每种TIICs与结直肠腺癌临床分期之间的关系。结果从TCGA数据库中一共得到514例样本的基因转录表达数据和临床信息,其中结直肠腺癌473例,正常癌旁组织41例。发现幼稚B细胞等12种TIICs在结直肠腺癌和正常结直肠组织中差异均有统计学意义(均P<0.05)。经过样本临床信息的对应配对后,纳入到生存分析共222例。对每种TIICs相对比例值降序排列,按中位值将所有样本分为高、低浸润组,单因素生存分析结果发现,记忆B细胞对结直肠腺癌预后的影响有统计学意义(P<0.05)。活化CD4记忆T细胞等4种TIICs在结直肠腺癌的不同临床分期中占比差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论TIICs与结直肠腺癌的预后及临床分期有关。

  • 标签: 结直肠肿瘤 免疫,细胞 预后
  • 简介:摘要目的探讨von Hippel-Lindau(VHL)综合征遗传性肾癌中免疫细胞浸润的特点及其与临床病理和预后的关系。方法收集2010年至2019年于北京大学第一医院泌尿外科确诊并进行手术治疗的VHL综合征肾癌患者的样本。对6对新鲜匹配的VHL综合征肾癌和癌旁组织进行RNA-Seq测序,利用TIP工具将RNA-Seq数据转换成14种免疫细胞浸润数据,并进行分析比较。采用免疫组织化学染色方法在54对匹配的VHL综合征肾癌和癌旁组织的石蜡切片中来验证差异浸润免疫细胞表面标志物的表达情况,并分析其与患者临床病理及预后的关系。结果与癌旁组织相比,VHL综合征肾癌中初始CD4 T细胞浸润水平显著下调(0.289±0.009比0.200±0.012,P<0.001),记忆CD4 T细胞浸润水平显著上调(0.123±0.014比0.222±0.016,P<0.001)。免疫组织化学染色结果显示,与癌旁组织相比,VHL综合征肾癌中CD45RA(初始CD4 T细胞标志物)表达明显降低(50.9±1.9比15.6±0.9,P<0.001),CD45RO(记忆CD4 T细胞标志物)表达明显升高(22.2±1.1比80.8±4.3,P<0.001)。此外,CD45RA低表达组和CD45RO高表达组具有更高的组织病理学分级、更晚的肿瘤分期和更低的无病生存率(均P<0.01)。另外,CD45RA表达与VHL表达呈正相关(r=0.693 3,P<0.000 1),而CD45RO表达与VHL表达呈负相关(r=-0.609 0,P<0.000 1)。结论初始CD4 T细胞和记忆CD4 T细胞可能是VHL综合征肾癌中特异性浸润免疫细胞,且其浸润水平与VHL的表达和患者的预后密切相关。

  • 标签: 肾肿瘤 VHL综合征肾癌 初始CD4 T细胞 记忆CD4 T细胞
  • 作者: 于歌 刘树民 冯晓玲
  • 学科: 医药卫生 >
  • 创建时间:2022-12-13
  • 出处:《国际遗传学杂志》 2022年第04期
  • 机构:黑龙江中医药大学药学院,哈尔滨 150040 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院妇科,哈尔滨 150081,黑龙江中医药大学药学院,哈尔滨 150040,黑龙江中医药大学附属第一医院妇科,哈尔滨 150040
  • 简介:摘要目的探究Ly6/Plaur结构域包含蛋白1(Ly6/ Plaur domain-containing 1,LYPD1)在卵巢癌中的作用、潜在机制以及与卵巢癌患者不良预后的关系。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据中分析不同癌症中LYPD1的表达。同时,以TCGA数据库中卵巢癌患者临床生存数据评价LYPD1对卵巢癌患者预后的影响。采用Metascape数据库对LYPD1在卵巢癌生物学功能进行富集分析。CCK-8方法检测细胞增殖活性,流式细胞术检测细胞凋亡。Western印迹方法检测低表达LYPD1后对于SKOV3和A2780细胞中NF-κB蛋白的影响。肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库分析LYPD1对于卵巢癌免疫细胞浸润的影响。结果LYPD1在卵巢癌中高表达,且在卵巢癌中的总生存率较低,同时LYPD1与疾病特异性生存率和无进展期相关。此外,低表达LYPD1能够抑制卵巢癌细胞增殖活性,诱导凋亡。I-κB激酶/NF-κB信号通路是LYPD1参与卵巢癌恶性进展的潜在通路之一。低表达LYPD1使卵巢癌细胞SKOV3和A2780中NF-κB蛋白表达升高。且LYPD1的表达与卵巢癌免疫细胞浸润密切相关。如,T细胞(P=0.041,r=0.100),DC细胞(P=0.034,r=0.110)以及巨噬细胞(P=0.027,r=0.110)表达正相关,与Tgd(P=0.001,r=-0.180),以及NK细胞(P=0.044,r=-0.100)负相关。结论LYPD1是一个原癌基因,通过I-κB激酶/NF-κB调控免疫细胞浸润参与卵巢癌细胞的异常增殖以及卵巢癌患者不良预后。

  • 标签: Ly6/Plaur结构域包含蛋白1 卵巢癌 NF-κB 免疫细胞浸润
  • 简介:摘要目的研究前列腺癌局部免疫细胞浸润模式,探讨免疫细胞在前列腺癌发生发展中的作用。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载正常前列腺及前列腺癌组织基因表达谱芯片数据集,通过R、SPSS软件计算两组中22种免疫细胞的比例,并比较两组之间免疫细胞比例的差异,计算前列腺癌组织中免疫细胞之间的相关系数。结果下载数据集GSE62872,得到样本共424例,包含正常前列腺组织160例、前列腺癌组织264例,每例样本均检测mRNA 20 228个,数据校正后使用反卷积算法得到22种免疫细胞的比例数据,采用P<0.01筛选样本,得到正常前列腺组织63例、前列腺癌组织57例。前列腺癌组织中浸润水平较高的免疫细胞包括:CD8+ T细胞[(23.48±6.16)%]、浆细胞[(18.46±5.74)%]、单核细胞[(12.15±3.82)%]、活化的NK细胞[(11.11±2.97)%]。构成比相关系数较大的免疫细胞包括:CD8+ T细胞与未活化的CD4+记忆性T细胞(r=-0.609,P<0.01),M0型巨噬细胞与M2型巨噬细胞(r=-0.596,P<0.01)。相比于正常组织,M1型巨噬细胞及未活化树突细胞浸润程度增加,差异均具有统计学意义(Z=-2.783,P=0.005;Z=-2.129,P=0.033)。结论前列腺癌肿瘤微环境中浸润免疫细胞主要以CD8+ T细胞、浆细胞、单核细胞、活化的NK细胞为主,M0型巨噬细胞在肿瘤微环境的作用下主要向M2型分化,可能参与前列腺癌发生发展过程,为寻找潜在免疫治疗靶点提供新的线索。

  • 标签: 前列腺肿瘤 免疫,细胞 数据库,核酸
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  • 简介:摘要调节性T细胞(Treg细胞)对机体内环境稳定至关重要。然而,肿瘤浸润Treg细胞(TITR)在肿瘤微环境(TME)中发挥免疫抑制作用,削弱抗肿瘤特异性免疫应答,从而促进肿瘤逃避免疫监视。近来,随着免疫检查点抑制剂、趋化因子及其受体阻断剂、Treg细胞选择性靶点敲除和新药的问世,基于Treg细胞的肿瘤免疫治疗取得了较好的抗肿瘤效果。文章介绍TITR生物学特性,并探讨Treg细胞肿瘤免疫治疗的前景与应用。

  • 标签: 调节性T细胞 肿瘤微环境 免疫疗法
  • 简介:摘要炎症反应是肝脏损伤后发生纤维化的前提条件,巨噬细胞是纤维化级联反应的关键调控者,其中骨髓来源的单核细胞浸润至受伤的肝组织并分化成巨噬细胞,对肝脏损伤、纤维化的启动、维持及消退至关重要。因此,揭示浸润的单核/巨噬细胞对肝纤维化过程免疫调节的细胞、分子机制,将为开展基于巨噬细胞的抗纤维化治疗提供重要的依据。

  • 标签: 单核/巨噬细胞 肝纤维化消退 免疫调节
  • 简介:[摘要]  目的:分析儿童特异性皮炎患者病变组织免疫细胞浸润模式,筛选调控关键基因。方法:自GEO数据库下载GSE107361数据集,使用Cibersort、WCGNA、Cytoscape等方法进行分析。结果:AD患儿病变组织DC浸润比值上升,肥大细胞浸润比值降低。DC浸润比值与CCL22、CXCL1表达量与呈正相关,与KRT19表达量呈负相关;肥大细胞浸润比值与CXCL1、CXCL8、GZMB等基因表达量呈正相关。结论: CCL22、CXCL1、KRT19、CXCL8、GZMB等基因与儿童AD病变皮肤组织免疫细胞浸润比值相关。

  • 标签: []  特应性皮炎 儿童 免疫 趋化因子
  • 简介:摘要随着对肿瘤热疗和肿瘤免疫微环境(TIME)的深入研究,近年来热疗对TIME的作用越来越受到学者们的重视。本文就目前国内外研究进展,对热疗与TIME中几类主要免疫细胞免疫相关细胞因子的影响及作用机制作一综述。全面而透彻的了解热疗对TIME的调控作用,有助于为肿瘤治疗提供新的思路和方法。

  • 标签: 肿瘤/热疗法 肿瘤免疫微环境 免疫细胞 细胞因子 热休克蛋白
  • 简介:诱导移植器官的特异性免疫耐受是克服免疫排斥的主要发展方向,也是当前器官移植领域研究的热点问题。NKT细胞是一种特殊类型的T淋巴细胞,同时表达NK细胞和T淋巴细胞标记,具有较为恒定的TCRα和独特的CDld限制性,通过调节Th1和Th2细胞发育参与免疫调节,在诱导免疫耐受的过程中起重要作用。

  • 标签: NKT细胞 Α-GALCER CDld限制性 免疫耐受
  • 简介:摘要肿瘤细胞免疫疗法大多分为两大类,为特异性细胞免疫疗法以及非特异性细胞免疫疗法。对于特异性免疫疗法中的肿瘤特性镶嵌抗体T细胞疗法现在被国内外的生物制药公司所应用,伴随对人类免疫系统以及肿瘤的产生原因的深入探讨,细胞免疫疗法已经成为当今针对肿瘤治疗手段中的一种,这种方法已经被当作当今的国际肿瘤研究发展的主要方向之一,被认定为肿瘤治愈的希望。

  • 标签: 细胞免疫 肿瘤疫苗 淋巴细胞疗法
  • 简介:NKT细胞是一种特殊类型的T淋巴细胞,同时表达NK细胞和T淋巴细胞标记,具有较为恒定的TCRα和独特的CDld限制性,通过调节Th1和Th2细胞发育参与免疫调节,在诱导免疫耐受过程中起重要作用。

  • 标签: NKT细胞 Α-GALCER CDld限制性 免疫耐受
  • 简介:<正>神经组织包括神经细胞和神经胶质细胞成分。外周神经系统中,神经胶质细胞有卫星细胞(外周神经节节细胞周围)、雪旺细胞(神经干内形成神经纤维髓鞘)。中枢神经系统(CNS)中神经胶质细胞分为两大类:一类为大胶质细胞(macrolia),含星形胶质细胞(共特殊类型为视网膜中的Müller细胞和小脑中的Bergmann细胞)和少突胶质细胞;另一类为异源性细胞群(heterogenousgroupofcells),含室管膜细胞(包括脉络丛上皮细胞)和小胶质细胞

  • 标签: 神经胶质细胞 小胶质细胞 星形胶质细胞 细胞因子 少突胶质细胞 性细胞
  • 简介:摘要目的探讨结直肠癌免疫细胞浸润模式,分析免疫细胞浸润与患者临床特征及总生存(OS)的相关性。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载615例结直肠癌RNA测序数据,数据更新于2019年7月19日。包括结直肠癌肿瘤组织571例、癌旁组织44例,其中具有临床资料552例,包括生存时间、生存状态、年龄、性别、临床分期、分级、肿瘤部位等信息。采用CIBERSORT工具反卷积算法,基于标准化的基因表达数据计算出22种免疫细胞的相对含量。根据CIBERSORT算法的结果验证,选取反卷积结果准确性高的样本(P<0.05),用于分析和绘图。分析免疫细胞浸润模式与患者临床特征及OS的相关性。结果采用CIBERSORT方法运行后过滤去除P≥0.05的样本,共筛选出肿瘤组织样本282例,癌旁组织样本16例;其中有临床信息者共293例,包括肿瘤组织样本277例、癌旁组织样本16例。293例样本中M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、M2巨噬细胞、CD8+ T细胞及未活化的CD4记忆性T细胞占总免疫细胞的比例较高;在肿瘤组织样本中,M0巨噬细胞、M1巨噬细胞、活化的CD4记忆性T细胞、未活化的自然杀伤(NK)细胞表达量较高;在癌旁组织中,初始B细胞、M2巨噬细胞、活化的NK细胞、未活化的树突细胞、未活化的肥大细胞及浆细胞等表达量较高;随着临床分期的升高,滤泡辅助性T细胞、活化的CD4记忆性T细胞、活化的NK细胞、M1巨噬细胞表达量降低,浆细胞、调节性T细胞表达量升高,差异均有统计学意义(均P<0.05)。M1巨噬细胞、未活化的肥大细胞、活化的CD4记忆性T细胞、CD8+ T细胞、滤泡辅助性T细胞在右半结肠癌中表达量较高,而M0巨噬细胞、活化的肥大细胞在左半结肠和直肠癌中表达量较高,差异均有统计学意义(均P<0.05)。以浸润免疫细胞的中位表达水平将患者分为高浸润组和低浸润组进行生存分析,结果显示初始B细胞浸润程度高的患者OS较好,而M2巨噬细胞、活化的肥大细胞、中性粒细胞浸润程度高的患者OS较差。结论结直肠癌中不同分期、部位的样本中存在不同类型的免疫细胞浸润模式,且与肿瘤进展及患者OS密切相关,有望用于治疗靶点开发及预后预测。

  • 标签: 结直肠肿瘤 免疫,细胞 临床特征 总生存
  • 简介:摘要目的探讨甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)伴淋巴结转移(lymph node metastasis, LNM)的免疫细胞浸润模式,并分析其与临床特征及预后的相关性。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库获取PTC患者的RNA-seq数据及临床病例资料,据纳入排除标准,PTC伴颈部LNM组85例,对照组23例;从CIBERSORT下载22种免疫细胞基因表达矩阵,利用CIBERSORT反积卷法计算免疫细胞在PTC LNM患者甲状腺癌组织及正常甲状腺组织中的浸润情况,比较免疫细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织与正常甲状腺组织的差异,评估在PTC LNM患者中甲状腺癌组织的免疫细胞浸润模式与临床特征(年龄、性别、腺外浸润、TNM分期)间的相关性,通过Kaplan-Meier分析评估与PTC LNM患者预后相关的免疫细胞。结果免疫细胞浸润分析结果显示,幼稚B细胞、记忆B细胞、CD8+T细胞、M1巨噬细胞、活化的肥大细胞及嗜酸性粒细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织中浸润下调;M0巨噬细胞、M2巨噬细胞、静息状态树突状细胞、活化树突状细胞及静息状态肥大细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织中浸润上调。其中,M0巨噬细胞,M2巨噬细胞,静息状态树突状细胞浸润丰度与PTC LNM患者的甲状腺癌腺外浸润,TNM分期呈正相关,且浸润丰度高的患者无进展生存率较浸润丰度低的患者差。而幼稚B细胞,CD8+T细胞与患者的腺外浸润、TNM分期呈负相关,且浸润丰度高的患者预后较浸润丰度低的患者好。结论PTC LNM患者的免疫细胞浸润模式具有一定的特异性,并与患者的临床特征和预后相关。本研究为免疫细胞微环境在PTC LNM中的作用提供理论基础和新的见解。

  • 标签: 甲状腺癌 免疫浸润 预后 TCGA数据库 生物信息学