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6 个结果
  • 简介:【摘要】转录组测序(RNA-seq)是生物医学研究的重要手段之一,对数据进行质量控制,剔除质量异常样本,是保证生物学结果准确的必要前提。然而,现有的质量控制工具都局限于单个样本或单一数据层面,不利于分析人员多角度发现异常样本。本研究基于R语言开发了RawdataQC软件包,可以在原始数据、比对数据和基因表达谱三个层面对多个样本进行质量控制;通过可视化方法,帮助使用者综合多个数据层面发现低质量样本。本研究将助力广大临床医生和研究者开展转录组数据质量控制,为生物学结果准确提供质量保证。

  • 标签: R包 转录组测序 质量控制
  • 简介:摘要:实现智慧化是建设高质量机场的保障。智慧机场是指基于先进管理理念,充分利用前沿科技水平来优化服务品质,提升旅客体验和运行效率,实现机场的智能化、可视化、共享化。智慧机场的建设还充分考虑了平安、绿色、人文的需求,致力于构建现代化协同服务平台。基于此,本文章对大数据技术在智慧机场领域的应用研究进行探讨,以供相关从业人员参考。

  • 标签: 大数据技术 智慧机场 应用
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  • 简介:摘要:近年来,circRNA由于其稳定,保守,分布范围广等优点,成为了表观遗传修饰中倍受瞩目的一员,其对于癌症的发生、发展发挥着至关重要的作用。胃癌作为一种严重威胁人体健康的疾病,它的早期诊断、预后判断、治疗靶点具有很重要的意义。本文将基于GEO数据库,对GSE78092,GSE141977,GSE83521三组芯片数据进行整合分析,最后得出与胃癌具有良好关联性的circRNA,并通过预测其调控的miRNA,进而分析其影响的生物学功能,最后得出该circRNA潜在影响通路和功能,具有高度的临床转化价值。

  • 标签: 胃癌 circRNA 数据库
  • 简介:摘要:目的 研究内分泌科住院DM患者血糖管理情况。方法选取2018年1月~2020年10月于我院内分泌科住院治疗的非重症DM患者900例,采用Population、Patient、Patient‐day3种模型分析患者床旁快速血糖数据。结果共收集到43106个血糖数据,平均血糖为(9.60±4.30)mmol/L(Population模型)、(8.71±2.13)mmol/L(Patient模型)及(9.34±2.59)mmol/L(Patient‐day模型),严格、一般及宽松控制率的总和为80%以上。高血糖、严重高血糖、低血糖和严重低血糖发生率Population模型为11.4%、4.9%,0.9%和0.1%,Patient模型为22.6%、57.4%、23.7%和5.2%,Patient‐day模型为8.0%、16.8%、4.3%及0.6%。结论

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  • 简介:摘要 目的:探究基因组DNA污染及乳腺癌单样本预测器(single sample predictor, SSP)在RNA-seq中鉴定Basal-like亚型乳腺癌的一致性与稳健性。方法:使用4种SSP联合3种数据校正方法,按比例随机去掉一定比例的非Basal-like亚型样本,并使用正态分布模拟基因组DNA对基因表达量的影响。结果:数据校正方法影响乳腺癌SSP鉴定Basal-like亚型的一致性(κ=0.733-0.964);乳腺癌SSP可以一致鉴定出Basal-like亚型(κ=0.846-0.958),对Basal-like亚型鉴定的稳健性高;基因组DNA污染对Basal-like亚型鉴定的一致性影响较小(κ=0.922-1)。结论:Basal-like亚型的鉴定具有高度的一致性与稳健性且受基因组DNA污染影响较小。

  • 标签: 基因组DNA污染 RNA-seq 乳腺癌分型 Basal-like亚型