QIAxcel毛细管电泳与常规琼脂糖凝胶电泳比较分析的研究

(整期优先)网络出版时间:2014-12-22
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QIAxcel毛细管电泳与常规琼脂糖凝胶电泳比较分析的研究

李欣薛婧旎唐益明乔雪飞陆晓红杨丽华

李欣薛婧旎唐益明乔雪飞陆晓红杨丽华

(上海市松江区疾病预防控制中心201620)

【摘要】目的:比较QIAxcel凝胶电泳与常规琼脂糖凝胶电泳两种方法的优势。方法:采集疑似手足口病患者的咽拭子50例,提取RNA,RT-PCR扩增EV71,产物分别用两种电泳方法观察结果,最后经RealTimeRT-PCR验证。结果:50例标本中QIAxcel凝胶电泳结果显示24例为阳性,阳性率为48%,常规琼脂糖凝胶电泳结果15例为阳性,阳性率为30%;阳性结果RealTimeRT-PCR验证也均为阳性。结论:QIAxcel凝胶电泳比常规琼脂糖凝胶电泳具有更高的灵敏度,且QIAxcel系统所具有的方便性和快速分析适合病原微生物检测。

【关键词】QIAxcel电泳琼脂糖凝胶电泳

【中图分类号】R332【文献标识码】A【文章编号】1672-5085(2014)16-0140-01

QIAxcel毛细管凝胶电泳仪是一台DNA/RNA的快速分析系统,通过虹吸作用进样,在具有特殊凝胶介质中通过毛细管电泳的原理[1]自动进行分离检测、分析结果;常规琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质,通过电荷效应和分子筛效应进行样品分离,再染色拍照分析结果。本文旨在分析两种电泳的优势,为实验室病原微生物的检测方法提供理论依据。

1材料和方法

1.1材料

1.1.150例咽拭子标本来源于上海市松江区中心医院幼儿疑似手足口病患者。

1.1.2核酸提取试剂盒HighPureViralRNAKit购于QIAGEN公司

1.1.3核酸检测试剂盒肠道病毒EV71荧光PCR检测试剂盒购自上海之江生物技术有限公司,RT-PCR检测试剂盒购自QIAGEN公司,EV71特异性引物由上海生工有限公司合成

1.2仪器

1.2.1ABI7500RealTime实时荧光PCR仪和RT_PCR扩增仪购自lifetech公司

1.2.2QIAcub核酸自动提取仪购自QIAGEN公司

1.2.3电泳仪购自北京六一仪器厂,凝胶成像系统购自美国伯乐公司

1.3方法

1.3.1逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)用EV71特异性引物分别对标本RNA进行RT-PCR反应。反应条件设为;第1步:病毒RNA经AMV逆转录酶50℃反转录30min;94℃变性3min,1个循环;第2步:92℃变性30s,52℃退火30s,72℃延伸1min,40个循环;第3步:72℃延伸5min,1个循环[2]。所用引物序列如下:EV71-1:5'-GTCCTTAATTCGCACAGCACAGCT-3';EV71-2:5'-CGGTCCGCACTGAGAATGTACCCAT-3',扩增产物为341bp。RealTimeRT-PCR检测方法按照试剂盒说明操作。

1.3.2电泳

1.3.2.1RT-PCR产物先用1×TAE电泳缓冲液制备2.5%的琼脂糖凝胶进行电泳,100V电压,电泳30~40min。用凝胶成像系统分析相应PCR产物的条带并记录。

1.3.2.2RT-PCR产物再用QIAxcel毛细管凝胶电泳,直接观察EV71特异性条带。

2结果

2.150例标本的RT-PCR产物,QIAxcel毛细管凝胶电泳结果显示24例为阳性,阳性率为48%(24/50),电泳结果见图1;常规琼脂糖凝胶电泳结果有15例为阳性,阳性率为30%(15/50),电泳结果见图2。

2.2常规琼脂糖凝胶电泳15例阳性均与QIAxcel毛细管凝胶电泳结果一致,经Real_TimeRT_PCR验证均为阳性;其中9例常规琼脂糖凝胶电泳结果为阴性,而QIAxcel毛细管凝胶电泳结果为阳性,经Real_TimeRT_PCR扩增,9例也均为阳性。

图1QIAxcel毛细管凝胶电泳结果图2常规琼脂糖凝胶电泳结果

3讨论

通过RT-PCR法检测50例咽拭子标本的EV71,分别用QIAxcel毛细管凝胶电泳与常规琼脂糖凝胶电泳两种方法读取电泳结果,二者阳性率分别为48%和30%,说明QIAxcel毛细管凝胶电泳敏感度更高。另外琼脂糖凝胶电泳需要配胶,制胶,插上胶梳,并检查正负极,且观察结果需要染色;而QIAxcel毛细管电泳仪,将样品管放入仪器后,几分钟内便获得高分辨率的电泳结果。因此,QIAxcel毛细管凝胶电泳不仅有更高的灵敏度,而且使实验流程更加流畅,更加省时,为实验室检测提供一种更为敏感快速方便的方法。

参考文献

[1]宿振国,周玉明,高梅兰,宋向芹.高效毛细管电泳的临床应用[J].国际检验医学杂志,2011,32(10):1083-1084

[2]陈应坚,李水明,徐亚军.应用荧光定量PCR技术检测肠道病毒71型[J].现代预防医学,2010,37(2):339-352

基金项目:上海市松江区医学重点学科建设项目—病原微生物检验科(2013XK09)