简介：目的：筛选ATP结合盒E1（ABCE1）基因的相关调节miRNA，为诊治肺癌提供新思路。方法选取20例非小细胞肺癌患者，其中男性13例，女性7例；年龄45～73岁，平均年龄62.9岁。鳞癌11例，腺癌9例。应用生物信息学预测ABCE1基因上游的miRNA，通过实时定量聚合酶链反应（RT-Q-PCR）及免疫组织化学方法，对标本非小细胞癌组织和癌旁组织进行检测，并进行统计学分析，从中筛选出目的miRNA。结果生物信息软件预测7个最有可能调节ABCE1基因的miRNA，分别为miR-29a/b/c、miR-135a/b、miR-203及miR-141；其中miR-29a/b/c、miR-135a、miR-203的表达在癌组织内较癌旁组织都有不同程度的降低，以miR-135a、miR-29c差异最为明显，与之对应ABCE1在相同的肺癌组织内表达上调（P〈0.05）；仅miR-135a与ABCE1在上述肺癌患者内表达呈现负性相关（r=-0.665，P=0.001）。结论在非小细胞肺癌内，很有可能是miR-135a负性调节ABCE1基因，两者结合可能成为诊治肺癌的新靶点。

简介：为探索有效分离两样品间差异甲基化片段的方法,以DNMT1(DNAmethyltransferase1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基化片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基化片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基化位点分布规律.实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法,能筛选出两样品间的差异甲基化片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基化片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性.

简介：目的检测Clinprot系统中2种磁珠对于同种样品的蛋白分选能力，初步探讨磁珠选择的步骤、指标。方法分别同时利用Cu^2螫合（IMAC-Cu）磁珠和弱阳离子（WCX）磁珠检测同样30例血清标本，其中子宫内膜异位症10例．其他良性卵巢肿物10例，健康人10例。比较2种磁珠分选后的蛋白质谱图基本参数、组内一致性和2种磁珠寻找差异的能力．结果①对于该实验样本，WCX磁珠在蛋白质谱图中总峰数量、峰面积均优于Cu^2＋磁珠（P〈0．001）。而在峰高度上．Cu^2＋有一定优势；②比较3个组的质谱图组内一致性，WCX与IMAC-Cu均有良好的一致性：③初步了解2种磁珠寻找差异的能力，WCX磁珠与IMAC-Cu磁珠均能区分疾病组与正常组．相对WCX磁珠构建的模型更为稳定。结论在Clinprot实验开始前，选择合适的样本量，综合多个衡量指标，结合多个选择步骤评价不同磁珠抓取蛋白的能力．选择一种磁珠扩大样本量，可以为进一步实验中寻找差异蛋白奠定良好基础。就该实验样品．WCX磁珠更利于扩大样本时应用。