简介：采用分子对接和分子动力学方法,考察了硝基类二肽类化合物抑制剂的侧链结构对嗜热菌蛋白酶（TLN）的抑制效能的影响.计算结果表明：当侧链基团为异丁基时,抑制剂与TLN的活性部位之间形成的氢键数目最多,并可以提高抑制剂与TLN的结合能力.理论计算的结合自由能大小与抑制剂的抑制常数相吻合.以上结果从理论上进一步揭示了硝基类二肽化合物侧链结构对TLN的抑制能力的影响复杂性,即除了一般意义上的疏水作用外,侧链结构的变化导致氢键的形成能力变化也不可忽略.
简介：利用荧光光谱、紫外吸收光谱并结合分子模拟技术对3种分子结构相似，仅母核上C环3位取代功能团不同的黄酮小分子槲皮素、金丝桃苷及芦丁对蛋白质的构象影响进行了对比研究．探讨黄酮分子相同位置上功能团不同对相互作用体系的结合常数、结合位点数、结合作用力及蛋白质构象的影响．实验表明黄酮母核C环3位上单糖苷的存在抑制了其药效的发挥，而单糖苷递增为双糖苷时这种抑制作用会有所减弱．
硝基二肽类嗜热菌蛋白酶抑制剂的分子动力学研究
光谱法与分子模拟技术对槲皮素、金丝桃苷、芦丁与蛋白质的构效关系对比研究
