简介：Domaindatabaseisessentialfordomainpropertyresearch.Eliminatingredundantinformationindatabasequeryisveryimportantfordatabasequality.Herewereportthemanualconstructionofanon-redundanthumanSH2domaindatabase.Thereare119humanSH2domainsin110SH2-containingproteins.HumanSH2swerealignedwithClustalX,andahomologoustreewasgenerated.Inthistree,proteinswithsimilarknownfunctionwereclassifiedintothesamegroup.Someproteinsinthesamegrouphavebeenreportedtohavesimilarbindingmotifsexperimentally.Thetreemightprovidecluesaboutpossiblefunctionsofhypotheticalproteinsforfurtherexperimentalverification.

简介：PBONDisawebserverthatpredictstheconformationofthepeptidebondbetweenanytwoaminoacids.PBONDclassifiesthepeptidebondsintooneoutoffourclasses,namelycisimide(cis-Pro),cisamide(cis-nonPro),transimide(trans-Pro)andtransamide(trans-nonPro).Moreover,foreverypredictionareliabilityindexiscomputed.Theunderlyingstructureoftheserverconsistsofthreestages:(1)featureextraction,(2)featureselectionand(3)peptidebondclas-sification.PBONDcanhandlebothsinglesequencesaswellasmultiplesequencesforbatchprocessing.Thepredictionscaneitherbedirectlydownloadedfromthewebsiteorreturnedviae-mail.ThePBONDwebserverisfreelyavailableathttp://195.251.198.21/pbond.html.

简介：植物非特定的类脂化合物转移蛋白质(nsLtps)被报导了对细菌、真菌的病原体涉及植物防卫活动。在这研究，我们识别了135(122通常认为并且13以前识别了)SolanaceaensLtps，它被聚类进8个不同的组。由与Boutrot的nsLtp分类作比较，我们分类这八个组进五种类型(我，II，IV，IX和X)。我们把SolanaceaensLtps与Arabi-dopsis和GramineaensLtps作比较并且发现(1)那打字我，II和IV被Solanaceae，Gramineae和Arabidopsis分享；(2)类型III，V，VI和VIII被Gramineae和Arabidopsis分享然而并非到目前为止在Solanaceae检测了；(3)而类型IX在Arabidopsis和Solanaceae仅仅是在场的，类型VII仅仅在Gramineae被发现；(4)类型X是在我们的数据说明52.59%SolanaceaensLtps的一种新类型，并且到目前为止没在任何另外的植物被报导。我们进一步造了并且比较了八个组的三维的结构，并且发现在nsLtp家庭以内的主要功能的多样化能被早于到monocot/dicot分叉，并且许多基因复制和顺序变化在monocot/dicot分叉以后发生在nsLtp家庭，特别在Solanaceae。

简介：用定序技术的16SrDNA基因，entomopatho遗传因子的线虫(杀虫剂的一种)的非共生的细菌的三不同的种(Steinernemasp。并且Heterorhabditissp)从感染的昆虫死尸被孤立并且识别{街郎mellonella幼虫)在48小时的柱子感染以后。顺序类似分析表明紧张SRK3，SRK4和SRK5分别地属于Ochrobactrumcytisi，Schineria幼虫和Ochrobactrumanthropi。isolatesO。anthropi和S。幼虫被发现分别地，而，与Heterorhabditisindica紧张BDU-17和Yer-136被联系O。cytisi与Steinernemasiamkayai紧张BDU-87被联系。Phenotypically，时间的杀虫剂的一种细菌是相当与共生杀虫剂的一种细菌(Photorhabdus和Xenorhabdus类)有关。紧张SRK3和SRK5phylogeographically类似于几非共生者并且污染了在德国(LMG3311T)和中国(X-14)孤立的杀虫剂的一种细菌，当紧张SRK4与S的isolates相同时。从在匈牙利的Wohlfahrtiamagnifica的幼虫(Ll/57，Ll/58，Ll/68和L2/11)。结果被RNA第二等的结构和排列序列的最小的精力计算进一步证实。这研究建议这些线虫的非共生者phylogeographically由于阶段变化在某程度被分叉。因此，这些紧张不是主人依赖者，但是环境特定孤立。

简介：Transgeniccelllinesofloblollypine(PinustaedaL.)wereanalyzedbyacompactlaser-tweezers-Raman-spectroscopy(LTRS)systeminthisinvestigation.Alowpowerdiodelaserat785nmwasusedforbothlaseropticaltrappingofsingletransgeniccellsandexcitationfornear-infraredRamanspectroscopyofthenucleiofsynchronizedcells,whichweretreatedassingleorganicparticles,attheS-phaseofthecellcycle.TransgeniclivingcellswithgfpanduidAgeneswereusedasbiologicalsamplestotestthisLTRStechnique.Asexpected,differentRamanspectrawereobservedfromthetestedbiologicalsamples.Thistechniqueprovidesahighsensitivityandenablesreal-timespectroscopicmeasurementsoftransgeniccelllines.Itcouldbeavaluabletoolforthestudyofthefundamentalcellandmolecularbiologicalprocessbytrappingsinglenucleusandbyprovidingawealthofmolecularinformationaboutthenucleiofcells.