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Sequence analysis of the hsp60 gene and it＇s application in identification of pathogenic bacteria

作者： Yu SHAN HU;MING WANG;LING DU;ZI YAO MO;ZHI AI DENG;JUN HUA LIU;YUN WAN LIN;LI FANG JIANG
学科：医药卫生 > 基础医学
创建时间：2007-01-11
出处：《中华微生物学和免疫学：英文版》 2007年第1期

简介：Tosupportthescientificbasisforrapididentificationofpathogenicbacteriaandotherstud-ies,thesequencesofhsp60geneinmajor34speciesof16genusofpathogenicbacteriaweresearchoutinGenBankandaproperpairofuniversaldegenerateprimerwasdesignedbymeansofthemolecu-larbiologicalsoftwawePrimer5.0andOligo6.0.ThisprimerwasthenusedinthePCRamplification,andthehsp60genefragmentsoftheselectedpathogenicbacteriacouldbeamplifiedusingthisdegener-ateprimer.Bywayofbioinformationalanalysis,theconservation,variationandtheinterspeciesphylo-geneticrelationsofthehsp60genesequencewereanalysed.Fromtheresultsofthecomparativestudyonsequences,itwasdemonstratedthatthehsp60genewascharacterizedbyconservationandvaria-tion,inwhichtheconservedandmutantregionsco-existedandseparatelydistributedwithmanysmallmutantregionsdistributedamongtheconservedregions,justlikethemosaic.Thephylogenetictreeamongdifferentpathogenicbacteriadrawnfromthehsp60geneanalysiswasprovedtobeconsistentwiththosefrom16SrRNAand23SrRNA.Itisconcludedthatthesequencedistributionofhsp60genewouldprovideasolidbasisfortherapididentificationofpathogenicbacteriaandthedevelopmentofadiagnosticmicroarray.
标签：种系发生致病基因遗传基因层次分析

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