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134 个结果
  • 简介:AllfactorsaffectingthePCRsysteminPinusmassonianaLambwereinvestigatedonebyone.TheresultsshowthattheoptimumPCRsystemofEST-SSRwere:2μL10×Buffer(Mg2+Free),30ngtemplateDNA,0.1875mmol/LdNTPs,3.75mmol/LMg2+,8pmolprimerpair,1.0UTaqDNApoly-meraseintotal20μLreactionsystem.Finally,atotalof11isolatesofP.massonianawasusedfortestingthestabilityofthePCRamplification.TheresultsprovethattheoptimumPCRsystemwasstable,reliable,highlyrepetitive.

  • 标签: PINUS massoniana EST-SSR MARKER single FACTOR
  • 简介:鲫作为研究鱼类进化的独特材料,具有丰富的遗传多样性和多种不同倍性的亚种。采用一般线性回归模型(GLM),对286个EST-SSR标记与鲫鱼自交F2代181尾个体的体长、体高及其比值进行单标记回归分析。Permutation检验(10000次)结果显示:共有53个标记分别与体长、体高及体长/体高具有显著相关性,其中与体长显著相关的标记有24个(P〈0.05),极显著相关的标记有6个(P〈0.01);与体高显著相关的标记有30个(P〈0.05),极显著相关的标记有9个(P〈0.01);与体长/体高显著相关的标记有23个(P〈0.05),极显著相关的标记有9个(P〈0.01)。本研究获得的53个与3种性状相关的标记为分子辅助育种(MAS)提供了理论基础。

  • 标签: 微卫星标记 体长 体高
  • 简介:采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5~19个不等,平均为9.94个,多态性信息含量变化范围为0.6235~0.9593,平均为0.7991。选择带型清晰、重复性好、易于统计且能将52份资源完全区分开的2对引物组合构建供试资源的DNA指纹图谱。NTSYS软件聚类分析表明,EST-SSR标记能正确反映出不同资源间的亲缘关系,为构建甘薯大型DNA指纹图谱数据库奠定了基础。

  • 标签: 甘薯 种质资源 EST-SSR DNA指纹图谱
  • 简介:利用EST-SSR标记分析了藜科6种耐盐植物的遗传基础和遗传多样性,以期为藜科耐盐植物遗传育种提供快速、可靠的分子标记辅助选择工具。采用31对藜科海蓬子属和碱蓬属的EST-SSR引物对藜科6种植物进行PCR扩增,其中16对引物得到较好扩增,引物通用率为51.6%,共检测到18个多态性位点,每位点等位基因数2~4个,多态性丰富。进一步采用Nei’s遗传距离聚类分析表明6种植物可以分为3组,主成分分析也支持上述分组,而且DY529957、DY529903和DY5298853个EST在分组中贡献率最高。经与GenBank中序列相似性比对,前两者分别编码生长素抑制蛋白(Auxin-repressedprotein,ARP)和植物防御素(Defensins,Def),都参与植物逆境胁迫响应,但分属于不同代谢途径;后者则编码未知蛋白。总体而言,16对SSR引物在藜科6种植物间具有较好的通用性,能够揭示该6种植物间广泛的遗传多样性,及其存在不同耐盐机制提供分子证据。

  • 标签: 藜科 EST-SSR 遗传多样性 耐盐机制
  • 简介:EST-SSR标记是基于表达序列标签(expressedsequencetags,EST)数据信息,并结合SSR标记特点开发出的一种新型分子标记。本文利用12对EST-SSR标记对湖北省内目前主要栽培的8个黑杨品种进行分子鉴定,同时对不同EST-SSR位点进行相关遗传参数分析。品种鉴定结果表明,仅需4对EST-SSR引物即可将8个亲缘关系较近的黑杨品种完全区别开来。遗传多样性分析显示,多态位点百分比为58.3%,平均有效等位基因数为2.09个,平均Shannon信息指数0.61,平均杂合度为0.35。这些结果表明,杨树EST-SSR标记完全可以应用于品种鉴定及群体遗传多样性分析。

  • 标签: 杨树 EST-SSR标记 品种鉴定
  • 简介:为了更好地在荔枝杂交育种中判别真杂种,以荔枝两个人工杂交群体‘雪怀子’ב桂味’和‘雪怀子’ב焦核三月红’的F,代为材料,利用ESTSSR标记进行真假杂种鉴定,创建作图群体,并对两个群体进行遗传多样性分析。结果表明,分别采用4对引物组合即可实现对两个杂交群体F。代单株100%的鉴定,两个群体的159个单株均为真杂种;且两个群体后代叶片形态存在变异,基因型上产生了不同于亲本的扩增谱带。经聚类分析发现,群体‘雪怀子’ב桂味’113个F1单株被聚为6大类(相似性系数0.68),63.72%(72株)后代与父本聚为一类,28.3%(32株)单株与双亲距离较远,推测这些单株中出现了较大的遗传重组或变异。在相似系数0.642处,‘雪怀子’ב焦核三月红’组合的46株杂种后代分为两大类,该组合大部分单株(60.87%)与母本亲缘关系较近,具有偏母本遗传倾向。可见,ESTSSR标记适合荔枝真假杂种鉴定,两个F1作图群体的创建为荔枝遗传连锁图谱构建奠定基础,同时为荔枝的品种改良积累材料。

  • 标签: 荔枝 杂种群体鉴定 EST—SSR 遗传多样性
  • 简介:对4000条辣椒EST序列进行筛选,获得了119条含有SSREST,共设计出35对ESTSSR引物,占所有EST序列的0.87%。在所有的SSR—ESTs中,二核苷酸重复含量最高,其次是三核苷酸重复。GA和AGA分别是二,三核苷酸重复中含量最高的重复基元。以不育系(cytoplasmicmalesterility,CMS),保持系基因组DNA为模板,对ESTSSR引物进行筛选,首次获得Pe21、Pe26和Pe27等3对特异引物,并扩增出特异片段分别为CMSPe2160、CMSPe260、CMSPe27300.ESTSSR标记作为功能基因的一部分,可以直接揭示或反映相关基因功能,特异标记基因的一部分序列,它的应用将对进一步研究辣椒胞质雄性不育分子机理带来一定的促进作用。

  • 标签: 辣椒 胞质雄性不育 EST—SSR
  • 简介:NU’EST带着他们的第三张迷你专辑回归大众视线,主打曲《梦话》尝试了MysticFantasy风格,独特中还带给了大家更多丰富多彩的元素,只能说这一次很精彩。

  • 标签: 音乐 歌手 个人专辑 单曲
  • 简介:Expressedsequencetags(ESTs)arewidelyusedingenesurveyresearchtheseyears.TheESTPipelineSystem,softwaredevelopedbyHangzhouGenomicsInstitute(HGI),canautomaticallyanalyzedifferentscalarESTsequencesbysuitablemethods.Alltheanalysisreports,includingthoseofvectormasking,sequenceassembly,geneannotation,GeneOntologyclassification,andsomeotheranalyses,canbebrowsedandsearchedaswellasdownloadedintheExcelformatfromthewebinterface,savingresearcheffortsfromroutinedataprocessingforbiologicalrulesembeddedinthedata.

  • 标签: 表达序列标签 管道系统 信号加工 EST
  • 简介:Inthisstudy,28,691genomesequencesand16,566expressedsequencetags(ESTs)ofEucalyptuswerederivedfromtheGenBankdatabase.Atotalof2292SSRlociweresoughtoutfrom1785effectivesequences.ThroughanalysesofSSRlociinformation,theSSRmotiflengthwasnegativelycorrelatedwiththeabundanceoftheSSRs.IntheESTsequencesofEucalyptus,tripletrepeatmotifswerethemostabundant,anddinucleotiderepeatsmotifshadthehighestfrequencies.Subsequently,395pairsofprimersweredesignedbasedontheSSRloci.UsingoptimizedSSR-PCRconditions,340pairsofprimersweresuccessfullyscreened,withasuccessrateof86.1%.Byconstructionofamaximumlikelihoodphylogenetictreeofsixeucalyptspecies,representedbyfivespeciesofthegenusEucalyptusandoneofthegenusCorymbia,thegeneticrelationshipsofEucalyptusurophyllaandE.camaldulensissuggestedbythistreewasfoundtodifferfromthatsuggestedbytraditionalmorphologicaltaxonomy.TheresultsprovideinsightsforevaluatinggeneticdiversityofEucalyptusandanalysisofEucalyptusphylogeneticsusingSSRmarkers.

  • 标签: SSR EUCALYPTUS SSR MARKERS SSR LOCI
  • 简介:摘要目的讨论内镜逆行胰胆管造影术(EndoscopicRetrogradeCholangiopancreatography,ERCP)、内镜下乳头括约肌切开术(endoscopicsphincterotomy,EST)的围手术期护理。方法总结140例患者的临床资料、对ERCP、EST围手术期护理措施进行汇总。结果135例患者插管成功,行ERCP检查、EST取石治疗后,黄疸、腹部疼痛症状得到缓解,134例顺利出院,1例手术中出现穿孔症状,转普外科继续治疗,5例插管不成功,转普外科手术治疗。结论围手术期护理对ERCP检查、EST切开治疗,术后并发症的护理具有重要作用。

  • 标签: ERCP EST 围手术期护理
  • 简介:摘要目的探讨老年胆总管结石患者经十二指肠镜乳头切开术(EST)的护理配合。方法对97例年龄大于60岁的胆总管结石患者进行了EST后取石术,术前予以心理护理,并告知患者手术的过程和术中配合方法,术中密切观察病情变化和配合处理患者的不适,并于术中、术后根据患者情况予以监测生命体征、吸氧、输液、等对症治疗。结果通过术前、术中、术后护理,所有患者术中情绪稳定,配合得当,治疗过程顺利,术后恢复良好。并发高淀粉酶血症43例,急性胰腺炎2例,术后出血1例,穿孔并死亡1例。结论EST术具有创伤小、适用范围广、疗效确切等优点尤其适合于老年患者;正确的护理方式,对手术成功可以提供有力的保障。

  • 标签: EST 老年人 胆总管结石 护理
  • 简介:摘要逆行胰胆管造影术(ERCP)是在内镜下通过注射造影剂显影胆胰系统的过程,再结合胆总管乳头括约肌切开术(EST)。它是在ERCP基础上发展起来的一种内镜微创手术,具有手术时间短、创伤小、恢复快、住院时间短的特点。但ERCP作为一种侵袭性操作,同样也具有一定风险和并发症的发生。

  • 标签: 逆行胰胆管造影 护理 引流
  • 简介:Sincepigisanimportantlivestockspeciesworldwide,itsgeneexpressionhasbeeninvestigatedintensively,butrarelyinbrain.Inordertostudygeneexpressionprofilesinthepigcentralnervoussystem,wesequencedandanalyzed43,122highquality5′endexpressedsequencetags(ESTs)fromporcinecerebellum,cortexcerebrum,andbrainstemcDNAlibraries,involvingseveraldifferentprenatalandpostnataldevelopmentalstages.TheinitialESTswereassembledinto16,101clustersandcomparedtoproteinandnucleicaciddatabasesinGenBank.Ofthesesequences,30.6%clustersmatchedproteindatabasesandrepresentedfunctionknownsequences;75.1%hadsignificanthitstonucleicaciddatabasesandpartialrepresentedknownfunction;73.3%matchedknownporcineESTs;and21.5%hadnomatchestoanyknownsequencesinGenBank.WeusedthecategoriesdefinedbytheGeneOntologytosurveygeneexpressionintheporcinebrain.

  • 标签: 表达序列标签技术 EST 基因表达 基因鉴定
  • 简介:Seventy-fivepreviouslyknownplantmicroRNAs(miRNAs)wereclassifiedinto14familiesaccordingtotheirgenesequenceidentity.Atotalof18,694plantexpressedsequencetags(EST)werefoundintheGenBankESTdatabasesbycomparingallpreviouslyknownArabidopsismiRNAstoGenBank'splantESTdatabaseswithBLASTalgorithms.AfterremovingtheESTsequenceswithhighnumbers(morethan2)ofmismatchednucleotides,atotalof812ESTcontigswereidentified.AfterpredictingandscoringtheRNAsecondarystructureofthe812ESTsequencesusingmFoldsoftware,338newpotentialmiRNAswereidentifiedin60plantspecies,miRNAsarewidespread.SomemicroRNAsmayhighlyconserveintheplantkingdom,andtheymayhavethesameancestorinveryearlyevolution.ThereisnonucleotidesubstitutioninmostmiRNAsamongmanyplantspecies.SomeofthenewidentifiedpotentialmiRNAsmaybeinducedandregulatedbyenvironmentalbioticandabioticstresses.Somemaybepreferentiallyexpressedinspecifictissues,andareregulatedbydevelopmentalswitching.ThesefindingssuggestthatESTanalysisisagoodalternativestrategyforidentifyingnewmiRNAcandidates,theirtargets,andothergenes.AlargenumberofmiRNAsexistindifferentplantspeciesandplayimportantrolesinplantdevelopmentalswitchingandplantresponsestoenvironmentalabioticandbioticstressesaswellassignaltransduction.EnvironmentalstressesanddevelopmentalswitchingmaybethesignalsforsynthesisandregulationofmiRNAsinplants.AmodelformiRNAinductionandexpression,andgeneregulationbymiRNAishypothesized.

  • 标签: RNA 植物 环境胁迫 基因表达 表达序列标签 鉴定
  • 简介:表达序列标签是一种快捷、高效的揭示基因组信息的方法。本研究以蓝塘猪与大白猪差异表达的5条EsT在各组织中的表达情况为目的.采用大白猪、蓝塘猪为实验材料,从成年种猪的10个组织中提取总RNA;运用RT—PCR方法分析,结果显示5条EST在猪的多数组织中均有表达;同源性比对后发现,在5条差异显示cDNA中,EST1、EST2与已知序列无同源性;电子表达谱分析表明EST1、EST2、EST4及ESt5在骨骼肌、肝脏组织中有表达。这为进一步研究该EST的功能奠定基础。

  • 标签: EST RT—PCR 生物信息学
  • 简介:内窥镜下乳头括约肌切开术(Endoscpicduodenalpapilo-sphincterotomyEST)主要用于治疗胆总管结石及乳头括约肌狭窄[1],是胆总管结石介入治疗的重要方法之一;逆行性内窥镜胰胆管造影(EndoscopicretregradecholangiopancreatographyERCP)具有确定EST的适应证,指导网篮取石,发现合并症及观察疗效的作用,而成为EST的基础[2].我们自1996年11月~2003年2月共做EST320例,取得满意疗效.现将ERCP在其中的基础作用分析如下.

  • 标签: 胆总管结石 内镜术 造影
  • 简介:【摘要】目的 在重症急性胰腺炎治疗中,选择不同治疗方案,总结与探究早期内镜下奥狄括约肌切开术(EST)实施效果。方法 于2020年1月至2020年12月期间纳入因重症急性胆源性胰腺炎而就诊于我科室的130例病人进行调研,根据治疗方案不同进行分组,每组均纳入65例病人,将两组分别命名为治疗A组与治疗B组,治疗A组所选用的治疗手段为传统常规治疗,治疗B组所选用的治疗手段为早期内镜下奥狄括约肌切开术。总结与探究两种治疗方案与实施效果。结果 治疗A组与治疗B组相比,白细胞恢复正常时间较长、胆红素恢复正常时间较长、血清淀粉酶恢复正常时间较长、腹痛缓解时间较长,组间对照差异明显(P值

  • 标签: 内镜 奥狄括约肌切开术 急性胆源性胰腺炎