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17 个结果
  • 简介:目的评估AFLP-DNA指纹技术在新生隐球菌分类中应用情况。方法新生隐球菌基因组DNA用双酶酶切,双链接头连于其酶切末端,用与接头和酶切位点互补的引物扩增DNA片段,其产物在高分辨的变性聚丙酰胺凝胶上电泳分离,然后进行银染。结果分析来自5种血清型和临床分离株的18株新生隐球菌,可见有30多条大小在30~500bp的DNA-AFLP指纹,相同的血清型有不同的指纹图谱,来自同一患者不同病期的两株分离株和来自同一患者患者的不同部位的两株分离株都显示出相同的带型。结论显示了AFLP的高分辨率,是适用于新生隐球菌流行病学调查的有力工具。

  • 标签: 新生隐球菌 DNA 扩增片段长度多态性
  • 简介:从贵州、云南、四川、陕西和辽宁收集了27份天麻样品,从64对AFLP选择性引物组合中筛选出16对组合,对不同分布区天麻的遗传多样性进行分析。16对引物共产生548条大小在100~1500bp的谱带,其中多态性带428条,多态性比率(PP)达78%,说明不同分布区的天麻中存在一定的遗传多样性,且AFLP可以有效地进行天麻遗传多样性的分析。遗传差异分析结果表明,27个样品的遗传距离在0.5930~0.0187,平均为0.2199,表明不同分布区天麻个体间存在一定的遗传差异。5个省份的样品中来自贵州的样品遗传差异相对较大,表明贵州蕴藏着相对丰富的基因资源,可以作为天麻遗传改良的重要种质资源。不同变型的AFLP分析结果显示,3种变型从分子上无明显差异,说明天麻种内的变型仅仅是表型上的变异,尚未在遗传上固定下来,对天麻几个变型的划分是否成立还有待进一步研究。

  • 标签: AFLP 天麻 遗传多样性
  • 简介:摘要:应用AFLP分型技术,分析南川大树茶群体190个株系的遗传多样性与亲缘关系。选用多态性高、分辨力 强的11对引物组合分别扩增样品基因组DNA,共得到220条清晰条带,其中多态性条带186条,多态位点百分比为82.55%,反映了样品基因组DNA具有较高的多态性。190个样品得出的平均有效等位基因数(Ne)为2.43-11.00,平均 Nei′s 基因多样性(H)为0.4000-0.9947,平均Shannon′s信息指数(I)为1.1432-2.6388。应用POPGENE软件,计算得到190个样品间的相似系数在 0.50~0.90之间,平均为 0.81。根据 UPGMA 法,将190个株系分成6大类群,绘制样品 AFLP 聚类树状图。本研究为南川大树茶种质资源的保护及利用,从分子水平提供了一定的依据。

  • 标签: 南川大树茶 AFLP 遗传多样性
  • 简介:应用AFLP技术,对60个栽培蕉和野生蕉种进行了遗传多样性分析及分类研究。在相似系数0.62的水平上将供试的60份蕉类植物分为4个群体;在相似系数0.64的水平上将栽培蕉划为两个类群;在相似系数0.83的水平上将香牙蕉类群划分为6个亚群;认为传统地将Cavendish亚群分为5个类别的分类依据与基因型之间并无严格的对应关系。将Saba归入ABB群体;吊罗矮蕉和北大矮蕉2号很可能是同一品种;国家果树种质广州香蕉圃收集的小米蕉、63-1与华农香蕉园种植的小米蕉、63-1均属同名异物情况。

  • 标签: 香蕉 遗传多样性 亲缘关系 AFLP
  • 简介:探讨2种分子标记技术在沉香属药用植物遗传多样性研究中的应用。用ISSR和AFLP分子标记分析了海南、云南、广东、广西等地17份沉香属植物的遗传多样性。14个ISSR引物、8对AFLP引物分别检测到119、919个位点,多态性位点百分率分别为73.95%、86.94%。由于AFLP标记具有较高的多态性位点检测效率,AFLP标记分析的遗传多样性参数高于ISSR。虽然基于Nei's遗传距离的聚类分析结果存在着一定的差异,但用Mantel检测对2种方法检测的遗传一致度进行相关性分析表明,二者之间存在着明显的相关性(r=0.7705,P=0.0003)。ISSR标记与AFLP标记均能应用于沉香属植物的遗传多样性研究。2种标记的研究结果均揭示出沉香属植物具有较高的遗传多样水平。

  • 标签: 沉香属 遗传多样性 ISSR AFLP
  • 简介:为了揭示春兰品种的遗传多样性和亲缘关系,为春兰种质资源的有效利用和开发提供依据,采用AFLP技术对51个春兰品种进行了遗传多样性分析,经筛选得到了8对条带清晰、多态性高的引物,共扩增出1315条DNA片段,其中多态性条带为1217条,平均1对引物扩增条带164条,多态性带152条,多态性位点频率为92.5%,表明春兰品种具有丰富的遗传多态性。49个品种含有特有带。51个品种间遗传相似系数变化范围为0.501-0.716,聚类分析表明,51个春兰品种共分为5个类群,来自同一地区的品种并没有聚在一起,表明春兰品种的遗传背景混乱。AFLP分子标记技术能有效地分析春兰品种的遗传多样性和亲缘关系。

  • 标签: 春兰 品种 AFLP 遗传多样性
  • 简介:放大碎片长度多型性(AFLP)技术被用来在马尼拉蚌(Ruditapesphilippinarum)的四张自然人口分析基因差异,在中国的四个海区域分布式,我。e.,Bohai海,Huanghai海,华东海和华南海。264AFLPloci在195individuals被分析并且揭示了基因差异的高水平。多态的loci的百分比从92.13%~96.06%并且香农“s信息索引从0.2568~0.2756。由分析分子的变化(AMOVA),有在Qingdao和另外的三个海区域的人口之间的基因区别的高水平,这被发现。由Nei的聚合分析“spairwisedistances由地理起源组织了标本,除了Qingdao的人口。一个结论能被得出在在中国和一些不同差别的马尼拉蚌的四张自然人口有高基因的差异,这存在在之中并且在四张人口之间。结果也显示人的耕作活动将在Qingdao的人口的基因结构上有大影响。

  • 标签: 中国 菲律宾蛤 野生群体 遗传差异 AFLP分析
  • 简介:用20对AFLP引物对来自于国内外的177份皮燕麦(Avena.sativaL.)资源进行遗传多样性分析,共获得976条清晰条带,其中多态性条带为185条,不同引物的多态性百分率为9.3%~35.9%,平均为19.0%。不同来源组群的Shannon-Weaver多样性指数变化范围为0.19~0.3412,西欧材料最高,其次是北欧(0.3269)、日本(0.3072)、东欧(0.2949)、北美(0.2904)、黑龙江最低。主坐标和UPGMA聚类分析结果基本相同,并与地理来源有很高的一致性。全部材料总体上可分为两类,其中一类全部为国内资源,另一类包含所有国外、内蒙古和青海的材料。国内与国外材料分布相对集中,这表明国内与国外材料亲缘关系较远,交流不是很广泛。而国内不同来源的材料相互交错分布,表明国内皮燕麦资源交流充分,多样性不是很丰富,应加强国外皮燕麦的引种工作。

  • 标签: 皮燕麦 AFLP 遗传多样性 种质资源 主坐标分析
  • 简介:本研究构建了西伯利亚鲟(Acipenserbaeri)扩增片段长度多态性(AFLP)分析体系,分析了DNA提取、双酶切反应、连接反应、预扩增反应、选择性扩增反应和银染等步骤。用7对引物对24尾西伯利亚鲟进行了AFLP分析,每对引物扩增的位点数在24~39之间,共扩增出了234个位点,多态性位点为116个,多态性比例为48.83%,平均Nei氏基因多样性指数H为0.4297,平均Shannon氏指数I为0.1233,个体间平均遗传距离为0.1872,表明西伯利亚鲟养殖群体的遗传多样性程度比较低,同时还构建了西伯利亚鲟的聚类图。

  • 标签: 西伯利亚鲟 AFLP 反应体系 遗传多样性
  • 简介:本文以扩增片段长度多态性和切割的扩增产物多态性序列分子标记技术为例,介绍了在生物学教学中如何结合具体的教学内容进行创造性思维教学,培养学生的创造性思维能力。

  • 标签: AFLP CAPS 创造性思维教学
  • 简介:本研究以高抗大白菜芝麻状斑点病品系‘C24’和高感品系‘03B9’为试验材料,利用cDNA-AFLP技术分析其在发病条件(高氮)和不发病或少发病条件(低氮)下基因表达的差异,并回收得到与大白菜芝麻状斑点病相关的差异表达转录衍生片段(Transcript-derivedfragment,TDF)19条。研究结果表明:12个TDF与NCBI或BrassicaDatabase已有序列同源,功能涉及激素调节、氧化还原酶、细胞结构、蛋白质分解、信号传导等;3个TDF在NCBI或TIGR上有序列同源,但是功能未知;4个TDF未找到同源序列。结合本课题组有关氮素浓度和形态对大白菜芝麻状斑点病影响的生理指标的研究结果,可推测大白菜芝麻状斑点病可能是细胞结构受到破坏,细胞膜上细胞信号跨膜转导受阻,ACC、ABA的调节,蛋白质的降解,PPO引起酚类物质褐变等共同作用所致。

  • 标签: 大白菜 芝麻状斑点病 CDNA-AFLP 基因表达差异
  • 简介:摘要本文以扩增片段长度多态性和切割的扩增产物多态性序列分子标记技术为例,介绍了在生物学教学中如何结合具体的教学内容进行创造性思维教学,培养学生的创造性思维能力。

  • 标签: AFLP CAPS 创造性思维教学
  • 简介:利用表型和AFLP标记,对怒江干热河谷57份杧果种质进行遗传多样性分析。表型性状分析结果表明:8个表型性状在不同的种质间表现出较大的差异,变异系数变化范围为16.98%~61.50%,多样性指数(H’)平均为3.975,其中单果重变异较大。AFLP分析结果显示:57份种质共产生1098条带,其中多态性条带为1032条,多态性比率为94.0%,相似系数在0.55~0.82之间。AFLP聚类分析结果及主成分分析结果均表明种质间具有复杂的遗传关系,且怒江干热河谷杧果种质的亲缘关系与地理分布没有明显的相关性。表型性状聚类和AFLP分子标记聚类分析的结果相对一致,均能较准确地将优势类群聚在一起,且表明57份杧果种质具有较丰富的遗传多样性。

  • 标签: 杧果 AFLP 遗传多样性 怒江干热河谷
  • 简介:小麦白粉病是由布氏禾白粉菌(Blumeriagraminisf.sp.tritici)引起,在小麦生产上发生最广泛的世界性病害之一。普通小麦品种农大399(系谱为Torino/2%2552//9516/3/5$石4185)是利用“滚动式加代回交转育”育成的高产、抗白粉病新品种。利用农大399和高感白粉病小麦品种石4185进行杂交,获得农大399/石4185的F,、F,分离群体和F。家系。对F、F,分离群体和F、家系进行了苗期抗白粉病鉴定和遗传分析,结果表明:农大399对白粉菌生理小种E09的抗性受l对显性基因控制,暂命名为MlND399。通过BSA和分子标记分析,获得了与MlND399连锁的1个SSR标记Xcfd81和2个AFLP—SCAR标记SCAR203和SCARll2。其中M1ND399与Xcfd81的遗传距离为O.2cM,与SCAR203的遗传距离为1.0cM,与SCARll2的遗传距离为1.2cM。根据SSR标记在中国春缺体一四体、双端体和缺失系中的定位结果,将M1ND399定位在小麦染色体臂5I)SBin0.67~0.78区间上。根据对抗白粉病基因的染色体定位结果,推测MZⅣD399是Pm2基因。这些与肼2ⅣD399连锁分子标记为利用农大399的抗白粉病基因进行抗病基因聚合和分子标记辅助选择育种奠定了基础。

  • 标签: 农大399 白粉病 SSR标记 SCAR标记 PM2
  • 简介:扩增片段长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism,AFLP)技术具有多态性丰富,所需DNA量少,灵敏度高等优点,但流程繁琐,花费时间长。本文根据AFLP技术的特点,在酶切-连接和聚丙烯酰胺凝胶的制备,这两方面做了很大改进。采用优化的AFLP技术分析三倍体银鲫的DNA指纹图谱,不仅缩短了实验所需时间,而且获得了稳定清晰的扩增带型。

  • 标签: AFLP标记 聚丙烯酰胺凝胶电泳 银鲫