简介：摘要目的基于中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库分析非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因(PTPN12)在脑胶质瘤中的表达和意义。方法回顾性分析CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中脑胶质瘤患者的临床资料和RNA测序数据。分析不同世界卫生组织(WHO)肿瘤级别、四分型亚型、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态的患者PTPN12表达量的差异。根据PTPN12的表达量将患者分为PTPN12高表达组和PTPN12低表达组，采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线，比较两组患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法判断PTPN12对脑胶质瘤患者的预后作用。进一步通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获得基因相关的功能以及有关的通路。结果两数据库中，PTPN12的表达量均随脑胶质瘤病理级别的升高而升高(均P<0.01)；与IDH突变型比较，IDH野生型中PTPN12表达量升高(均P<0.01)；MGMT启动子非甲基化者PTPN12表达量高于MGMT启动子甲基化者(均P<0.01)；PTPN12在经典型、间质型、神经元型以及前神经元型中表达量的差异均具有统计学意义，间质型中表达量最高(均P<0.01)。两数据库中，PTPN12高表达者均比低表达者的生存期短(均P<0.01)。两个数据库中，多因素Cox回归分析结果均显示，PTPN12表达量为脑胶质瘤患者生存期的独立影响因素(CGGA数据库中，HR＝1.433，95%CI：1.094～1.876，P＝0.009；TCGA数据库中，HR＝1.588，95%CI：1.018～2.477，P＝0.042)。GO分析结果显示，PTPN12表达量正相关的基因更多地富集在增殖、凋亡、黏附、蛋白水解、免疫反应、血管生成、药物反应、缺氧反应、肿瘤细胞G2/M期的转化、肿瘤细胞G1/S期的转化等多个与脑胶质瘤恶性进展相关的功能上。KEGG分析结果显示，与PTPN12表达量呈正相关的基因更多地富集在肿瘤相关通路、PI3K-Akt通路、丝裂原活化蛋白激酶通路、肿瘤坏死因子通路、缺氧诱导因子1通路、p53通路、凋亡通路以及细胞周期通路上。结论不同WHO肿瘤级别的脑胶质瘤患者PTPN12表达量不同，PTPN12表达量可独立用于脑胶质瘤患者的预后判断，且与多个脑胶质瘤恶性进展相关的功能和通路有关。

简介：摘要目的基于中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)和癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库分析非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶12基因(PTPN12)在脑胶质瘤中的表达和意义。方法回顾性分析CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中脑胶质瘤患者的临床资料和RNA测序数据。分析不同世界卫生组织(WHO)肿瘤级别、四分型亚型、异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态的患者PTPN12表达量的差异。根据PTPN12的表达量将患者分为PTPN12高表达组和PTPN12低表达组，采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线，比较两组患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法判断PTPN12对脑胶质瘤患者的预后作用。进一步通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获得基因相关的功能以及有关的通路。结果两数据库中，PTPN12的表达量均随脑胶质瘤病理级别的升高而升高(均P<0.01)；与IDH突变型比较，IDH野生型中PTPN12表达量升高(均P<0.01)；MGMT启动子非甲基化者PTPN12表达量高于MGMT启动子甲基化者(均P<0.01)；PTPN12在经典型、间质型、神经元型以及前神经元型中表达量的差异均具有统计学意义，间质型中表达量最高(均P<0.01)。两数据库中，PTPN12高表达者均比低表达者的生存期短(均P<0.01)。两个数据库中，多因素Cox回归分析结果均显示，PTPN12表达量为脑胶质瘤患者生存期的独立影响因素(CGGA数据库中，HR＝1.433，95%CI：1.094～1.876，P＝0.009；TCGA数据库中，HR＝1.588，95%CI：1.018～2.477，P＝0.042)。GO分析结果显示，PTPN12表达量正相关的基因更多地富集在增殖、凋亡、黏附、蛋白水解、免疫反应、血管生成、药物反应、缺氧反应、肿瘤细胞G2/M期的转化、肿瘤细胞G1/S期的转化等多个与脑胶质瘤恶性进展相关的功能上。KEGG分析结果显示，与PTPN12表达量呈正相关的基因更多地富集在肿瘤相关通路、PI3K-Akt通路、丝裂原活化蛋白激酶通路、肿瘤坏死因子通路、缺氧诱导因子1通路、p53通路、凋亡通路以及细胞周期通路上。结论不同WHO肿瘤级别的脑胶质瘤患者PTPN12表达量不同，PTPN12表达量可独立用于脑胶质瘤患者的预后判断，且与多个脑胶质瘤恶性进展相关的功能和通路有关。

简介：摘要目的探讨采用唾液酸酶法诊断细菌性阴道病(BV)的临床意义。方法以无菌棉试子采集符合标准的患者阴道分泌物,分别用Blue法和传统的Amsel法金标准法,同时对875例送检样本进行检测,比较结果。结果Blue法和传统的Amsel法金标准法试验相比,两法检出率差异无统计学意义(χ2=3.59,P>0.05)。结论采用Blue法检测细菌性阴道病简便、快速、可靠,结果易判读,是一种临床上可行的好方法。

简介：摘要目的基于转录组学数据筛选影响脑胶质瘤恶性进展及替莫唑胺耐药的关键基因，分析其在脑胶质瘤中的表达及意义。方法本研究通过分析GSE23806数据库(63株细胞株)、癌症体细胞突变目录(COSMIC)数据库(34株细胞株)及中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)计划数据库(325例患者)中的转录组学数据，分别筛选出在胶质瘤干细胞中高表达的差异基因、在替莫唑胺耐药细胞中高表达的差异基因以及与胶质母细胞瘤恶性预后相关的基因，进而筛选出共同差异基因。通过CGGA与癌症基因组图谱(TCGA)计划数据库(636例患者)验证该基因在不同世界卫生组织(WHO)级别、不同四分型亚型的脑胶质瘤中的表达差异；采用Kaplan-Meier生存曲线比较该基因表达量不同的胶质母细胞瘤患者总生存期的差异；通过单因素和多因素Cox回归分析研究该基因对脑胶质瘤患者总生存期的影响；通过基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其潜在的生物学功能。结果通过分析共同差异基因，筛选出岩藻糖基转移酶Ⅶ(FUT7)作为目标基因。FUT7在胶质瘤干细胞中呈现高表达(P＝0.025)，且在替莫唑胺耐药的细胞中高表达(P＝0.033)。在CGGA数据库(325例)和TCGA数据库(636例)中，FUT7在WHO Ⅱ、Ⅲ及Ⅳ级组间表达量的差异有统计学意义(均P<0.001)，其中Ⅳ级中表达量最高，Ⅱ级中表达量最低；两数据库中，FUT7在四分型组间表达量的差异均有统计学意义(均P<0.001)，均在间质型中表达量最高。CGGA数据库和TCGA数据库中具有生存数据的胶质母细胞瘤患者(分别为138例和168例)中，FUT7高表达者比低表达者生存期短(P＝0.002和P＝0.013)；单因素分析结果显示，FUT7的表达量、放疗及化疗均为胶质母细胞瘤患者总生存期的影响因素(均P<0.05)；多因素Cox回归分析结果显示，FUT7表达量、放疗及化疗均为影响胶质母细胞瘤患者总生存期的独立危险因素(均P<0.001)。GO功能富集分析显示，FUT7表达量正相关的基因富集在免疫反应、炎性反应、凋亡、趋药性、白细胞迁移及细胞增殖等功能上。KEGG通路富集分析显示，FUT7正相关的基因富集在JAK-STAT信号通路、TNF信号通路及NF-κB信号通路上。结论FUT7可能是影响脑胶质瘤恶性进展及替莫唑胺耐药的基因，其机制可能与免疫反应、炎性反应、凋亡、趋药性、白细胞迁移及细胞增殖功能，JAK-STAT3和NF-κB等信号通路有关。