简介：摘要目的了解北京地区5岁以下儿童轮状病毒、诺如病毒、腺病毒及星状病毒相关急性胃肠炎的流行特点和临床特征。方法在北京地区6个区县6家医院肠道门诊每月收集前30名年龄在5岁以下首次就诊的急性胃肠炎患者的信息资料和粪便样本，并对轮状病毒、诺如病毒、腺病毒及星状病毒四种病原进行PCR检测，采用描述性流行病学方法对四种病毒相关的急性胃肠炎流行特征进行描述，单因素方差分析各病毒引起的急性胃肠炎的Vesikari临床严重程度评分，采用非条件logistic回归分析急性胃肠炎的临床特征相关危险因素。结果2 052份样本中，非混合感染709例（34.6%）：其中轮状病毒411例（20.0%），诺如病毒153例（7.5%），腺病毒86例（4.2%），星状病毒59例（2.9%）；混合感染135例（6.6%）。轮状病毒性急性胃肠炎的Vesikari评分（8.0±3.1）高于诺如病毒（6.4±2.4，P<0.001）、腺病毒（6.2±2.1，P<0.001）及星状病毒（6.1±2.0，P<0.001）。临床特征比较结果显示：以星状病毒为参照，5岁以下儿童感染轮状病毒急性胃肠炎后更易出现：≥5 d的腹泻（OR=3.33）、1 d内≥3次的呕吐（OR=8.79）、≥1 d的呕吐（OR=3.96）、Vesikari评分≥11的重症病例（OR=13.19）；感染诺如病毒易出现1 d内≥3次的呕吐（OR=5.71）；感染腺病毒易出现≥5 d的腹泻（OR=2.62）；以轮状病毒为参照，5岁以下儿童感染诺如病毒（OR=0.40）或腺病毒（OR=0.28）后较少出现≥38.4 ℃的发热症状。结论本研究结果显示各病毒导致的急性胃肠炎特点不同，轮状病毒引起的急性胃肠炎临床症状较重，24月龄以下婴幼儿是轮状病毒感染的高危人群，应尽早采取有效预防措施如接种疫苗来保护易感人群。

简介：摘要目的调查北京市市售结球生菜诺如病毒(norovirus，NoV)和轮状病毒(rotavirus，RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月，在北京市某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法，分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩，用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因，PCR产物直接测序，用BioEdit7.0. 9.0软件进行序列比对，用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜，未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54)，其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功，为GⅡ.3基因型，该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京市市售部分结球生菜存在人源NoV污染，生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。

简介：摘要诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一，极易突变和重组，型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域，因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法，聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型，包括2个暂定基因组及16种暂定基因型，VP1可分为12个基因组及53种基因型，包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。

简介：摘要轮状病毒是全球5岁以下儿童重症腹泻的最主要病原，亚洲地区是全球轮状病毒腹泻疾病负担较高的地区。本文对亚洲地区轮状病毒腹泻的疫苗接种、疾病负担、人群分布、季节特征和基因型分布等进行综述。

简介：摘要国内多次在进口冷链水产品及其外包装检测出新型冠状病毒。本文对进口冷链水产品新型冠状病毒污染状况、来源及传播风险进行分析，并尝试提出了相关建议和策略，以期为新型冠状病毒感染防控提供依据。

简介：摘要诺如病毒具有传染性强、传播途径多样、病原体易变异的特点，是人群急性胃肠炎散发发病和暴发疫情的主要病原体，对社会造成较大的疾病负担。本文对诺如病毒急性胃肠炎的疾病负担、诺如病毒变异及流行株、诺如病毒感染的防控、诺如病毒感染后免疫和疫苗研发的研究进展进行综述。

简介：摘要目的建立一种检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，作为实时荧光PCR法检测新型冠状病毒的补充，并探讨该方法在临床样本检测中的初步应用价值。方法根据新型冠状病毒基因保守序列，利用在线软件设计N、S基因引物，构建巢式PCR反应体系，N基因巢式PCR及产物测序用于定性检测，S基因PCR产物测序用于型别初步鉴定。检测梯度稀释新型冠状病毒阳性样本评价检测灵敏度，检测流感病毒和人冠状病毒OC43、229E、HKU1、NL63等样本评价其特异性。分别检测Ct值>33与Ct值<33的各15份新型冠状病毒阳性样本，对扩增产物进行测序及比对分析，对检测方法进行验证。结果所建立的巢式PCR法可扩增出355 bp N基因片段及449 bp S基因片段的特异性条带，冠状病毒229E、OC43、HKU1、NL63、H3N2亚型流感病毒、甲型H1N1流感病毒、乙型流感病毒阳性样本无扩增条带。N基因片段最低检测限可达Ct值37.21。30份新冠核酸阳性样本中，巢式PCR检测的N基因阳性符合一致率达100%(30/30)；S基因阳性符合一致率达60%(18/30)。28份样本N基因片段测序成功，BLAST与新型冠状病毒相似性100%。12份样本S基因片段可获得位点突变特征结果。结论建立了可特异检测新型冠状病毒的巢式PCR方法，并可通过对PCR扩增产物测序分析其位点突变特征，可作为实时荧光PCR法的补充。

简介：摘要目的了解北京市肠道门诊腹泻病例中札如病毒（sapovirus，SaV）的感染特征。方法收集2019年肠道门诊腹泻病例流行病学和临床表现相关资料，应用x2检验或Fisher检验比较不同组间检出率；采集患者粪便标本，应用不同种PCR方法对腹泻病例粪便标本进行札如病毒检测，并进行基因分型。结果1 047例腹泻病例粪便标本中，SaV检出率为2.77%（29/1 047），成功测序16株，GI组11株，GII组4株，GIV组1株。春季检出率5.24%（x2=8.857，P=0.031）高于其他季节；远郊区检出率5.00%（x2=8.906，P=0.012）高于城区及近郊区；不同性别、年龄组检出率差异均无统计学意义。腹泻、恶心、呕吐及腹痛为SaV腹泻病例的主要临床症状。结论SaV是北京市腹泻病例的病原之一，春季和远郊区检出率高，GI组为主要基因型别。

简介：摘要目的调查北京市餐饮服务单位厨师的诺如病毒隐性感染状况及餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况。方法采用横断面调查方法，按照方便抽样的原则抽取北京市16个行政区内的餐饮服务单位以及三个大型火车站内部的餐饮服务单位，采集环境标本和厨师的肛拭子或便标本，使用实时荧光定量PCR技术对标本进行诺如病毒核酸检测，并分析了餐饮服务单位环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染状况。结果共调查650家餐饮服务单位，采集厨师肛拭子或便标本1 302件，环境标本2 600件。其中非火车站内部餐饮服务单位644家，厨师肛拭子或便标本1 290件，环境标本2 576件。非火车站餐饮服务单位厨师诺如病毒隐性感染率为0.85%（11/1 290），环境污染率为0.04%（1/2 576）；火车站餐饮服务单位厨师和环境标本中均未检出诺如病毒。结论在2019年诺如病毒非流行季期间，北京市餐饮服务单位中厨师诺如病毒感染率较低，环境中存在诺如病毒污染情况。

简介：摘要目的调查北京市宾馆住宿场所工作人员的诺如病毒隐性感染状况及宾馆住宿场所和旅游大巴车中诺如病毒污染情况，为诺如病毒防控提供科学参考依据。方法采用横断面调查方法，按照方便抽样的原则，抽取北京市16个区内的宾馆住宿场所以及旅游人员集中区域的旅游大巴车，采集环境标本，并采集相关工作人员肛拭子标本，使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测。采用描述性方法分析不同场所环境中诺如病毒污染情况和人员隐性感染情况。结果共采集北京市宾馆住宿场所工作人员肛拭子标本320件，环境涂抹标本640件，其中工作人员诺如病毒隐性感染率为0.94%，厨师隐性感染率为0.99%，环境污染阳性率为0.16%。旅游大巴车环境涂抹标本180件，未检出诺如病毒。结论在2019年诺如病毒非流行季期间北京市宾馆住宿场所中，工作人员诺如病毒感染率较低，环境中存在诺如病毒污染，为避免或减少旅游团体诺如疫情的发生，需进一步做好针对性的防控工作。

简介：摘要目的评估三种商业化试剂盒对新型冠状病毒奥密克戎变异株核酸检测的效果。方法收集2021年12月北京市监测发现的经测序分析确定为新型冠状病毒奥密克戎变异株的咽拭子标本8份，同时收集北京市2021年11月监测发现的新型冠状病毒德尔塔变异株咽拭子标本5份，用三种针对新型冠状病毒奥密克戎变异株的商业化荧光定量RT-PCR试剂盒进行检测，对检测效果进行比较分析。取其中两份Ct值较低的样本10倍系列稀释5个梯度，用于比较检测试剂的灵敏性。结果三种试剂盒均能特异性地检出8份奥密克戎变异株和5份非奥密克戎株（德尔塔变异株）。试剂A和B的灵敏性高于试剂盒C一个稀释度。结论三种试剂盒均能特异性地检测奥密克戎变异株。试剂盒A核酸用量最少，虽然只检测一个变异位点（Q498R），但该位点是奥密克戎变异株特有的，从而使实验操作和结果判定都更简便。

简介：摘要目的应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法检测和分析牡蛎中诺如病毒的基因特征。方法应用实时荧光RT-PCR和半巢式RT-PCR方法，对2014年11月至2015年10月北京市采集的新鲜市售牡蛎进行诺如病毒GⅠ/GⅡ组并联试验检测，分析检出率，应用符合率和一致性检验（Kappa值）对半巢式RT-PCR方法进行可靠性评价，应用半巢式RT-PCR方法扩增诺如病毒GⅠ/GⅡ衣壳蛋白区基因，对阳性产物进行测序。采用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建进化树。结果72份样品中，实时荧光RT-PCR、半巢式RT-PCR和并联试验的诺如病毒检出率分别为31.94%（23/72）、38.89%（28/72）和48.61%（35/72）。2种方法符合率为73.61%，中度一致（Kappa值=0.43）。测序成功13株诺如病毒，11株（7株GⅡ.17、2株GⅡ.4 Sydney_2012、1株GⅡ.1和1株GⅡ.21基因型）为2种RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本所得；2株（GⅡ.17和GⅡ.3基因型各1株）为半巢式RT-PCR方法检测诺如病毒阳性样本、实时荧光RT-PCR方法检测诺如病毒阴性样本所得。这些毒株与腹泻患者、环境污水和贝类水产品参考株的相似性为84.4%~100.0%。结论用2种RT-PCR并联法检测牡蛎中诺如病毒，不仅能提高检出率还能获得更多基因型；牡蛎中诺如病毒毒株与人源、环境污水及贝类水产品参考毒株高度同源，应对经常接触牡蛎的人群及相关环境进行诺如病毒监测和防控。

简介：摘要目的对2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒全长基因组进行系统进化分析。方法收集2016—2019年北京市GII.2[P16]诺如病毒毒株，采用一步法RT-PCR对基因组全长进行分段扩增，应用BioEdit软件分析核苷酸相似性和氨基酸变异情况，采用BEAST软件分别构建衣壳蛋白（major capsid protein，VP1）区和RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）区全长序列的贝叶斯进化树，结合流行病学资料对毒株进化特征进行分析。结果测得44个毒株的全基因组序列，其VP1和RdRp基因分型一致。进化分析显示北京市2017年5月以后毒株形成新亚群并分为两个分支，分别以2017—2018年和2018—2019年毒株为主。该亚群毒株在VP1区均存在Val256Ile点突变，但RdRp区没有发现氨基酸变异位点。流行病学数据表明，北京市GII.2[P16]型诺如病毒从2016年10月输入，2017年3月至6月为暴发高峰，2017年7月以后暴发数量明显降低,但2018年底暴发又有所增加。结论北京市GII.2[P16]诺如病毒新变异株2017年5月之后基因特征有所改变，暴发强度降低，但仍具有传播风险。