简介：摘要：现阶段，随着社会的发展，我国的各行业的发展也有了创新。消化道菌群多样性对于维持家畜机体健康起着至关重要的作用，因此，对家畜消化道中定植菌群的种类和功能进行分析就显得尤为关键。由于所有动物的消化道是厌氧环境，所以在体外的好氧环境中，有些菌种不易培养，而这些菌种信息的缺失，会导致消化道优势菌群的分析结果出现偏差。借助一些广泛应用的分子生物学研究方法，可以避免这种情况的发生。这些方法主要是测序法和定性定量分析法。测序法包括指纹图谱法和高通量测序法，定性定量分析法包括荧光原位杂交法和实时荧光定量 PCR法。这些方法均基于分子生物学水平，可避免菌体培养步骤，直接分析消化道菌群的组成和功能。综述了上述方法的原理以及各自的优点和缺点，并对它们在动物消化道菌群多样性分析中的应用进行了讨论，以期为研究动物消化道微生物时不同分子生物学方法的选择和联合使用提供参考。
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