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  • 简介:[摘 要]根据进化论,现存物种拥有一个共同祖先,在漫长的时间中,各种环境因素及其他因素的条件下,得到了不同的进化结果。在这一过程中,生物细胞内的遗传物质在不断复制,分配给下一代。这其中就会因为各种各样的错误,导致子代序列与亲本的序列出现差异。这就是普遍存在的突变。已知现存物种都共用同一个密码子表,即基因序列中每三个碱基,所对应的氨基酸在所有生物体中是统一的。除此之外,密码子中存在多个密码子编码同一个氨基酸的现象,即密码子简并性。这也导致了突变结果会出现,序列改变但是编码的蛋白质没有改变的情况,这就是同义突变。突变普遍存在,但其具有低频性,两条序列经过一段时间的突变累积,我们可以推算得到他们的同义替换率(ks)和非同义替换率(ka),本研究采用核密度曲线将ks可视,并探究ks推断的影响因素及矫正方法。

  • 标签: [] 碱基替换率 进化分析 可视化 ks矫正 突变