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  • 简介:摘要目的了解青岛地区流行的柯萨奇病毒A4型(CVA4)的基因组特征。方法选取2013—2015年间青岛地区流行的4CVA4病毒,通过一步法RT-PCR对毒进行基因组扩增,采用MEGA7.0软件进行序列比对及系统进化分析,采用similarity plots 3.5.1软件进行基因重组分析。结果进化分析显示:在基因组、P1区、P2区及P3区系统进化树上:毒HS312/QD/CHN/2013和HS605/QD/CHN/2014与国内早期分离共处同一分支;毒FY218/QD/CHN/2015与2013年江苏温州分离CV-A4/P1033/2013/China一起在各基因进化树上形成一独立分支;毒HS144/QD/CHN/2014在P1区进化树上与HS312/QD/CHN/2014、HS605/QD/CHN/2014及国内早期分离共处同一分支,但在基因组、P2区及P3区进化树上各形成单一分支。重组分析提示:毒HS144/QD/CHN/2014与2013年大陆流行的CVA2型毒CV-A2/P373/2013/China在2C区~3D区间(5 081~7 301)发生基因重组;毒FY218/QD/CHN/2015与毒CV-A4/P1033/2013/China同源,都与CVA2型分离CV-A2/P373/2013/China在2A区~2B区间(3 821~4 161)发生基因重组。结论青岛地区流行的CVA4在基因组层面有明显的遗传多样性。

  • 标签: 手足口病 柯萨奇病毒A4型 系统发育 基因重组