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  • 简介:摘要目的调查北京售结球生菜诺如病毒(norovirus,NoV)和轮状病毒(rotavirus,RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月,在北京某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法,分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩,用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因,PCR产物直接测序,用BioEdit7.0. 9.0软件进行序列比对,用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜,未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54),其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功,为GⅡ.3基因型,该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京售部分结球生菜存在人源NoV污染,生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。

  • 标签: 结球生菜 诺如病毒 轮状病毒 基因型
  • 简介:摘要目的分析北京不同阶段新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疫情特征,为今后新冠肺炎及其他新发突发传染病的防控提供参考。方法收集北京《全民健康信息化疾病预防控制信息系统》和流行病学调查报告中新冠肺炎确诊病例的人口学、来源、发病时间、就诊时间、确诊时间等信息,分析比较不同阶段的特征。结果2020年1月19日至7月10日,北京共报告新冠肺炎确诊病例935例,疫情可分为三个阶段:武汉输入病例为主的境内输入疫情防控阶段(2020年1月19日至2月28日);多国境外输入疫情防控阶段(2020年2月29日至6月10日);新发地市场为主的本地聚集性疫情防控阶段(2020年6月11日至7月10日)。第一阶段病例来源主要为本地病例(51.46%)和境内输入病例(48.54%),第二阶段主要为境外输入及其关联病例(97.80%),第三阶段主要为本地病例(99.12%),三个阶段病例来源构成比差异有统计学意义(x2=1170.680,P<0.01)。所有病例发病至就诊时间M(P25~P75)为2.00(0~5.00)d,就诊至确诊时间M(P25~P75)为1.00(1.00~2.00)d,发病至确诊时间M(P25~P75)为4.00(2.00~7.00)d。三个阶段病例发病至确诊时间、就诊至确诊时间逐渐缩短,差异有统计学意义(H=76.833,P<0.01;H=204.484,P<0.01)。结论北京三个阶段人口学特征、来源、临床特征均不同,需采取不同的防控措施进行精准防控。

  • 标签: 新型冠状病毒肺炎 流行特征 输入性病例
  • 简介:摘要目的对2016—2019年北京GII.2[P16]诺如病毒全长基因组进行系统进化分析。方法收集2016—2019年北京GII.2[P16]诺如病毒毒株,采用一步法RT-PCR对基因组全长进行分段扩增,应用BioEdit软件分析核苷酸相似性和氨基酸变异情况,采用BEAST软件分别构建衣壳蛋白(major capsid protein,VP1)区和RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)区全长序列的贝叶斯进化树,结合流行病学资料对毒株进化特征进行分析。结果测得44个毒株的全基因组序列,其VP1和RdRp基因分型一致。进化分析显示北京2017年5月以后毒株形成新亚群并分为两个分支,分别以2017—2018年和2018—2019年毒株为主。该亚群毒株在VP1区均存在Val256Ile点突变,但RdRp区没有发现氨基酸变异位点。流行病学数据表明,北京GII.2[P16]型诺如病毒从2016年10月输入,2017年3月至6月为暴发高峰,2017年7月以后暴发数量明显降低,但2018年底暴发又有所增加。结论北京GII.2[P16]诺如病毒新变异株2017年5月之后基因特征有所改变,暴发强度降低,但仍具有传播风险。

  • 标签: 诺如病毒 全基因组 进化分析