Scanning for Genomic Regions Subject to Selective Sweeps Using SNP-MaP Strategy

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摘要 人口genomic途径,利用高产量的genotyping,还是强大的扫描为的昂贵的方法选择扫。因为它是大规模单个genotyping的一种划算的选择,分享DNA策略广泛地为协会研究被使用了。这里,我们执行了SNP地图(单个核苷酸多型性microarrays并且分享)使用的分析从欧亚大陆取样评估为选择在染色体宽的扫描分享策略的效率。由进行allelotype数据的模拟,我们首先证明有平均杂合现象(HET)的boxplot是一个有希望的方法检测强壮选择与分享错误的中等水平扫。基于这,我们使用了HET的滑动窗户分析通常认为地检测大连续区域(LCR)在下面选择从欧亚大陆数据集扫。这调查在一张欧洲人口识别了63LCR。这些信号被综合haplotype分数(iHS)进一步支持测试使用HapMapII数据。我们也证实从几的积极选择的欧洲人特定的签名以前识别了基因(KEL,TRPV5,TRPV6,EPHB6)。在摘要,我们的结果不仅在扫描为揭示了SNP地图策略的高可靠选择扫,而且提供了卓见进人口区别。
机构地区 不详
出版日期 2010年04月14日(中国期刊网平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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