上皮-间充质转化过程导致结直肠癌远处转移的关键基因筛选和分析

(整期优先)网络出版时间:2023-03-15
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摘要目的本研究通过生物信息学方法确定通过上皮-间充质转化(EMT)调控影响结直肠癌远处转移的关键基因,并探究分子机制和预后。方法通过分析Enrichr数据库中的基因组,获得EMT和转移性结直肠癌之间共同表达的枢纽基因。基因表达谱数据动态分析(GEPIA)被用来分析识别关键基因。利用多个生物信息数据库公布的数据,分析关键基因在结直肠癌中的表达和功能富集。利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达谱数据库(GEO)探讨关键基因与结直肠癌病理特征和预后之间的关系,并利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)探究可能存在的通路及分子机制。结果两个关键基因P21活化激酶1(PAK1)和转化生长因β3(TGFB3),分析与预后及病理特征关系。结果显示,PAK1低表达组的总体生存率低于高表达组[风险比(HR)=0.641,P<0.05],TGFB3高表达组的总体生存率低于低表达组(HR=1.561 P<0.05)。TGFB3的表达水平与结直肠癌的M分期(t=6.314,P<0.05)、病理分期(t=4.368,P<0.05)和N分期(t=5.843,P<0.05)显著相关;PAK1高表达组与人种(t=2.367,P<0.05)、病理分期(t=1.540,P<0.05)、N分期(t=1.677,P<0.05)和M分期(t=7.561,P<0.05)显著相关。KEGG路径分析确定了PAK1和TGFB3靶基因分别在"细胞因子受体相互作用"和"肌动蛋白细胞骨架调节"中的起着关键作用。结论PAK1和TGFB3可能通过相关的分子机制影响结直肠癌的上皮-间充质转化,并与预后明显相关。